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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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DCLK2_chr4_150073445_150262438	150251003	C C	CCAACACC others(1039): Show CCAACACCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCCCACAC CCCCCACACCACACATCCCTCACACCCCCCACACCACACATCCCCCACAC CCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCA CACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCTCACACCCCCCACACCCC CCACACCCCCCACAACACCCCCCACACCACACATCCCTCACACCCCCACA CCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCA CACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCACACCCC CACACACCCCCCACACCACACATCCCTCACACCCCCCACACCCCCACACC CCCACACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCTCACACCCCCCACA CCCCCACACCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACCCCCACACACCCCC CACACCACACATCCCCCACACCCCCCAACACCCCCACACACCCCCCACAC CACACATCCCCCACACCCCCCAACACCCCCACACACCCCCCACACCACAC ATCCCCCACACCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACCCCCACACACCC CCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCAACACCCCCACACACCCCCCAC ACCCACACATCCCCCACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCA CACCACACATCCCCCACACCCCCCAACACCCCCACACACCCCCCACACCA CACATCCCCCACACCCCCCAACACCCCCACACACCCCCCACACCACACAT CCCCCACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCACACCACACAT CCCCCACACCCCCCAACACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCCC ACACCCCCCAACACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACC CCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCAACACCCCCACACCCCCA	intron_variant intron_variant	MODIFIER	NA18954.hp1 NA18954.hp1	a0001 a0001	a0001c0011 a0001c0011	a0001c0011t0020 a0001c0011t0020	a0001c0011t0020g0065 a0001c0011t0020g0065	1	116	0.0086	1046	c.207 others(1065): Show c.2073+1321_2073+1322insACACCCCCACACCCCCACACACCCCC CACACCACACATCCCCCACACCCCCCACACCACACATCCCTCACACCCCC CACACCACACATCCCCCACACCCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACC ACACATCCCCCACACCCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACCACACAT CCCTCACACCCCCCACACCCCCCACACCCCCCACAACACCCCCCACACCA CACATCCCTCACACCCCCACACCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACC ACACATCCCCCACACCCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACCACACAT CCCCCACACCCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCTCA CACCCCCCACACCCCCACACCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACCAC ACATCCCTCACACCCCCCACACCCCCACACCCCCACACCCCCACACACCC CCCACACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCAAC ACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCAACACCCC CACACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCACACCCCCACACAC CCCCCACACCCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCA ACACCCCCACACACCCCCCACACCCACACATCCCCCACACCCCCCACACC ACACATCCCCCACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCAACAC CCCCACACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCAACACCCCCA CACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCACACCACACATCCCC CACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCAACACCCCCACACAC CCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCCAACACCCCCACACACCCCCC ACACCACACATCCCCCACACCCCCCACACCACACATCCCCCACACCCCCC AACACCCCCACACCCCCACA	DCLK2	ENSG00000170390.16	transcript	ENST00000296550.12	protein_coding	15/15		INFO_REALIGN_3_PRIME	chr4	TogoVar
DIP2C_chr10_269201_694668	447426	T T	TATACTCA others(1039): Show TATACTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCGCTCACTCCCATC GATACTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCGCTCACTCCCATC AATACTCAGGATCACATGCAGTGGGGCAGCAGGACCCACTCACCCGTCGA TAATCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCACTCATCCCTGTCTA TACTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCAATCACCCCCATTGA TATTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCGCTCACCCCTGTCGA TATTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCACTCACCCCTGTCGA TACTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCACTCATCCCCATCTA TACTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCGCTCACTCCCATCGA TACTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCGCTCACTCCCATCAA TACTCAGGATCACATGCAGTGGGGCAGCAGGACCCACTCACCCGTCGATA ATCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCACTCATCCCTGTCTATA CTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCAATCACCCCCATTGATA TTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCGCTCACTCCCACTGATG CTCAGGATCACACACAGTAGGGCAGCAGGACCCACTCATCCCCGTCTATA CTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCGCTCACTCCCGTCGATA CTCAGGATCACACACAGTGCGGCAGCAGGACCCACTCATTCCCATTAATA ATCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCACTCATCCCTGTCTATA CTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCAATCACCCCCATTGATA TTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCGCTCACCCCTGTCGATA TTCAGGATCACACACAGTGGGGCAGCAGGACCCACTCACCCCTGTCG	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG01975.hp2 HG02040.hp2 HG02132.hp1 HG01975.hp2 HG02040.hp2 HG02132.hp1	a0001 a0001	a0001c0002 a0001c0002	a0001c0002t0001 a0001c0002t0002 a0001c0002t0003 a0001c0002t0001 a0001c0002t0002 a0001c0002t0003	a0001c0002t0001g0056 a0001c0002t0002g0067 a0001c0002t0003g0047 a0001c0002t0001g0056 a0001c0002t0002g0067 a0001c0002t0003g0047	3	88	0.0341	1046	c.269 others(1063): Show c.269-6431_269-6430insCGACAGGGGTGAGTGGGTCCTGCTGCCC CACTGTGTGTGATCCTGAATATCGACAGGGGTGAGCGGGTCCTGCTGCCC CACTGTGTGTGATCCTGAATATCAATGGGGGTGATTGGGTCCTGCTGCCC CACTGTGTGTGATCCTGAGTATAGACAGGGATGAGTGGGTCCTGCTGCCC CACTGTGTGTGATCCTGATTATTAATGGGAATGAGTGGGTCCTGCTGCCG CACTGTGTGTGATCCTGAGTATCGACGGGAGTGAGCGGGTCCTGCTGCCC CACTGTGTGTGATCCTGAGTATAGACGGGGATGAGTGGGTCCTGCTGCCC TACTGTGTGTGATCCTGAGCATCAGTGGGAGTGAGCGGGTCCTGCTGCCC CACTGTGTGTGATCCTGAATATCAATGGGGGTGATTGGGTCCTGCTGCCC CACTGTGTGTGATCCTGAGTATAGACAGGGATGAGTGGGTCCTGCTGCCC CACTGTGTGTGATCCTGATTATCGACGGGTGAGTGGGTCCTGCTGCCCCA CTGCATGTGATCCTGAGTATTGATGGGAGTGAGCGGGTCCTGCTGCCCCA CTGTGTGTGATCCTGAGTATCGATGGGAGTGAGCGGGTCCTGCTGCCCCA CTGTGTGTGATCCTGAGTATAGATGGGGATGAGTGGGTCCTGCTGCCCCA CTGTGTGTGATCCTGAGTATCGACAGGGGTGAGTGGGTCCTGCTGCCCCA CTGTGTGTGATCCTGAATATCGACAGGGGTGAGCGGGTCCTGCTGCCCCA CTGTGTGTGATCCTGAATATCAATGGGGGTGATTGGGTCCTGCTGCCCCA CTGTGTGTGATCCTGAGTATAGACAGGGATGAGTGGGTCCTGCTGCCCCA CTGTGTGTGATCCTGATTATCGACGGGTGAGTGGGTCCTGCTGCCCCACT GCATGTGATCCTGAGTATTGATGGGAGTGAGCGGGTCCTGCTGCCCCACT GTGTGTGATCCTGAGTATCGATGGGAGTGAGCGGGTCCTGCTGCCCCACT GTGTGTGATCCTGAGTAT	DIP2C	ENSG00000151240.18	transcript	ENST00000280886.12	protein_coding	3/36			chr10	TogoVar
DOCK8_chr9_209865_470255	400472	C C	CCACCTCC others(1039): Show CCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCACCTCCACC ACCATCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACCACCACCAGCAT CTTCACCATCACCACCACCTCCACCACCACCACCACCTCCACCATCACCA CCACCACCTCCACCACCACCAGCATCTTCACCATCACCACCACCTCCACC ACCACCAGCATCTTCACCATCACCACCACCTCCACCACCACCACCACCTC CACCATCACCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCA TCACCACCACCTCCACCATCACCACCTCCTCCACCATCACCACCACCTCC ACCACCACCACCTCCCCCACTACCAACAGCTCCTTCACCATCACCACAAC ATCCACCACCACCATCACCACCACCACCACCACCTCCTCCACCATCACCA CCTCCTTCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCACCTCCACC ATCACCACCACCTCCACCACCACCAGCATCTTCACCATCACCACCACCAC CTCCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACCACCACCA GCATCTTCACCATCACCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACC ATCACCACCACCACCTCCACCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCAC CACCTCCACCACCACCAGCATCTTCACCATCACCACCACCTCCACCACCA CCACCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCACCTCC ACCACCACCAGCATCTTCACCATCACCACCACCTCCACCACCACCACCAC CTCCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCA TCACCACCACCTCCACCATCACCACCTCCTCCACCATCACCACCACCTCC ACCACCACCACCTCCCCCACTACCAACAGCTCCTTCACCATCACCACAAC ATCCACCACCACCATCACCACCACCACCACCACCTCCTCCACCATCA	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG01257.hp2 HG01257.hp2	a0005 a0005	a0005c0159 a0005c0159	a0005c0159t0002 a0005c0159t0002	a0005c0159t0002g0005 a0005c0159t0002g0005	1	256	0.0039	1046	c.323 others(1065): Show c.3234+1214_3234+1215insACCTCCACCATCACCACCACCTCCAC CATCACCACCACCACCTCCACCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCA CCACCTCCACCACCACCAGCATCTTCACCATCACCACCACCTCCACCACC ACCACCACCTCCACCATCACCACCACCACCTCCACCACCACCAGCATCTT CACCATCACCACCACCTCCACCACCACCAGCATCTTCACCATCACCACCA CCTCCACCACCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCACCTCCACCATC ACCACCACCTCCACCATCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCACCTC CTCCACCATCACCACCACCTCCACCACCACCACCTCCCCCACTACCAACA GCTCCTTCACCATCACCACAACATCCACCACCACCATCACCACCACCACC ACCACCTCCTCCACCATCACCACCTCCTTCACCATCACCACCACCTCCAC CATCACCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACCACCACCAGCA TCTTCACCATCACCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACCATC ACCACCACCTCCACCACCACCAGCATCTTCACCATCACCACCACCACCTC CACCATCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCACCTCCACCACCATCA CCACCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACCACCACCAGCATCTTCACC ATCACCACCACCTCCACCACCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCTC CACCATCACCACCACCACCTCCACCACCACCAGCATCTTCACCATCACCA CCACCTCCACCACCACCACCACCTCCACCATCACCACCACCTCCACCATC ACCACCACCTCCACCATCACCATCACCACCACCTCCACCATCACCACCTC CTCCACCATCACCACCACCTCCACCACCACCACCTCCCCCACTACCAACA GCTCCTTCACCATCACCACAACATCCACCACCACCATCACCACCACCACC ACCACCTCCTCCACCATCAC	DOCK8	ENSG00000107099.18	transcript	ENST00000432829.7	protein_coding	26/47		INFO_REALIGN_3_PRIME	chr9	TogoVar
DPEP1_chr16_89608642_89643433	89619512	T T	TCCCTGCC others(1039): Show TCCCTGCCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCCC CTCCCTGCAGCTCCATGCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCC CCTGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGC CCCCTGCCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCCC CTCCCTGCAGCTCCATGCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCC CCTGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGC TCCATGCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCT CCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCC CCTGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGC CCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCATGCCCCCCGCTCCCCT CCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCC CTGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCTCTGCAGCC CCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCATGCCCCCCGCTCCCCTC CCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCATGCCCCCC GCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCTCC CTGCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCC CTGCAGCCCCCTGCCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCC CGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTC CATGCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCT CTGCAGCCCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCATGCCCCCCG CTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCTCTGCAGCC	intron_variant intron_variant	MODIFIER	NA19064.hp1 NA19064.hp1	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0001	a0001c0001t0001g0011 a0001c0001t0001g0011	1	250	0.0040	1046	c.-10 others(1065): Show c.-107+5804_-107+5805insCTGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGC CCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCATGCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCA GCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCCGCTCC CCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGC CCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCATGCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCA GCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCC CCTCCCTGCAGCTCCATGCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCC CCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAG CCCCCTGCCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCC CCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCATGCC CCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAG CTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCC CTCTCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCATGCCC CCCGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGC TCCATGCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCT CCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCC CCGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGC CCCCTGCCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCCCCCTGCCCCCCCGCTCCCC TCCCTGCAGCTCCATGCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCC CTGCTCCCCTCTCTGCAGCCCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTCCCTGCAGCT CCATGCCCCCCGCTCCCCTCCCTGCAGCTCCCTGCCCCCCTGCTCCCCTC TCTGCAGCCCCCTGCCCCCC	DPEP1	ENSG00000015413.10	transcript	ENST00000690203.1	protein_coding	1/10		INFO_REALIGN_3_PRIME	chr16	TogoVar
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