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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ADGRL2_chr1_81795934_81998932	81842353	C C	CTT CTT	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00099.hp2 HG00544.hp1 HG00597.hp2 others(116): Show HG00099.hp2 HG00544.hp1 HG00597.hp2 HG00609.hp2 HG00639.hp1 HG00733.hp1 HG00733.hp2 HG00738.hp1 HG00738.hp2 HG01081.hp2 HG01106.hp1 HG01106.hp2 HG01109.hp1 HG01255.hp1 HG01257.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp1 HG01261.hp2 HG01346.hp1 HG01358.hp1 HG01358.hp2 HG01433.hp1 HG01433.hp2 HG01515.hp2 HG01517.hp1 HG01517.hp2 HG01891.hp1 HG01934.hp1 HG01934.hp2 HG01943.hp2 HG01975.hp2 HG01978.hp2 HG01981.hp1 HG01993.hp1 HG02004.hp1 HG02071.hp2 HG02074.hp1 HG02083.hp1 HG02132.hp1 HG02135.hp1 HG02148.hp1 HG02165.hp2 HG02257.hp1 HG02273.hp1 HG02300.hp2 HG02451.hp2 HG02523.hp1 HG02523.hp2 HG02572.hp1 HG02572.hp2 HG02622.hp1 HG02683.hp2 HG02698.hp1 HG02717.hp1 HG02723.hp2 HG02735.hp1 HG02809.hp1 HG02818.hp1 HG02886.hp1 HG02897.hp2 HG02970.hp1 HG03017.hp1 HG03130.hp1 HG03209.hp2 HG03239.hp2 HG03453.hp1 HG03453.hp2 HG03471.hp1 HG03490.hp2 HG03492.hp1 HG03516.hp2 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