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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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KCNJ1_chr11_128833020_128872296	128868087	A A	ATATATTA others(2234): Show ATATATTATTATGTAATGTAATATAATATATTATTATGTAATGTAATATA ATATATTATTATATAACATAATATAATATAATATAATATATTATATAACA AAAATAATATAATATAATATATTATTATATAACATAATATAATGTAATAT ATTATTATATAACATAATATAATACAATATAATATATTATTATATAACAT AATATAATATAATATAATATAGTATATTATAATATAATATAGTATAATAT AATATGATATATTATTATATAATATAATATAATATGTAATTATATATTAT ATTATATTATAATATAATATGTAATTATATTATATTATTATAATATAATA TGTAATTATATTATATTATGATATATAATTATATTATAATAATATAATAT ATAATTATATATTATAATATAATATATAATTATATTATATTATTATATTA TAATATATCATTATATATTATAATGATATATTATATTATAATATATGATA TATTATAATATAATATAAAATGATATATTATAATATAATATATAATTATA TTATATTATATTATATAATAAAATATATTATATTATATAATATTATATAA TATATTATATTATATAGTATTATATAATATATTATATTATATAATATTAT ATAATATAATATATTATATAATACTATATAATATAATATATTATACATTA TATAATTATTATACAATATATTATATATTATATATATTATATATATTATA TATGTATATTATATAATATATTATAATATATTATATAATATATTATAATA TATTATATGTTATATATTATTATATATTGTATATAATATATTATATATTA TATATTTTTATATATTATATATTATTATATATAATATATATAATATATTA TATATTATATATATTATATATAATATATTGTATATTATATATTTTTATAT ATTATATATTACTATATCTATTATATATAATATATAATATATTATATATA GTATATTATATATGTTATATATAATATATTATATATTATACATATTATAG ATAATATATATAATATATTATATATTATACATAATATATATAATATATTA TATATGTTATATAATATATTATATATTATACATGTTATAGATAATAGATA TAATATATTATATATTATACATAATATATATAATATATTATATATAATAT ATAATATATTATATATTATATATAATATATTATATATATTATGTATAATA TATAATATATTATATCTATTATCTATAATATATTATATATAATATATATA ATATATTATATATTATATAATATATTATATATTATATATTACATATAATA TATTATATAGTATATATAATATATATAATATATTATATAGTATATATATT ATGTATTATATATATTATATATTATATATAGTATATAATTATTATATCTT ATATATATTATTATATAATATAATTATATATTTTATATAATATAATTATT ATATATTATTATTAAAATATATTGTATATTATATGATATAATATAATTTA TTATATTATATAATATATAACATATTATATATTACATTGTATAATATATA ATATATAATATATATTACATTGTATAATATATTATATATAATATATTTTA ATAATAATATATAATAATTATATTATATAAAATATATAATTATATTATAT AATATATATAAGATATAATAATTATATATAATATATAATATATAATATAA TATATAATATAATATATATAATATATAGTATAATATTGTATAATAAATAT ATAATATATAATATAATATATTATATTATATTATATTATATATTTTATAT TATATAATATATTATATACAATATGTAATATATCATTTATAATATATTAT ATAATAATATATTATATAATATATTATATGATAATATATTATATAATATA TATTATATTATATTACATAATATATTATATAATAATATATTACATAATAT ATTATATAATAATATATTACATAATATATTATATAATAATATATTACATA ATATATTATATAATAATATATTACATAATATATTATATAATAATATATTA TATTATATTACATAATATATTATATAATATATTATATTATATTACATAAT ATATTATGTTATATATTATATTATATTACATAATATATATTATATTATAT ATTAGAATATAATACATAATGAAATAAGGAATATAATAGAAT	upstream_gene_variant upstream_gene_variant	MODIFIER	HG01123.hp1 HG01123.hp1	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0001	a0001c0001t0001g0139 a0001c0001t0001g0139	1	301	0.0033	2241	c.-11 others(2252): Show c.-1107_-1106insATTCTATTATATTCCTTATTTCATTATGTATTAT ATTCTAATATATAATATAATATATATTATGTAATATAATATAATATATAA CATAATATATTATGTAATATAATATAATATATTATATAATATATTATGTA ATATAATATAATATATTATTATATAATATATTATGTAATATATTATTATA TAATATATTATGTAATATATTATTATATAATATATTATGTAATATATTAT TATATAATATATTATGTAATATATTATTATATAATATATTATGTAATATA ATATAATATATATTATATAATATATTATCATATAATATATTATATAATAT ATTATTATATAATATATTATAAATGATATATTACATATTGTATATAATAT ATTATATAATATAAAATATATAATATAATATAATATAATATATTATATTA TATATTATATATTTATTATACAATATTATACTATATATTATATATATTAT ATTATATATTATATTATATATTATATATTATATATAATTATTATATCTTA TATATATTATATAATATAATTATATATTTTATATAATATAATTATTATAT ATTATTATTAAAATATATTATATATAATATATTATACAATGTAATATATA TTATATATTATATATTATACAATGTAATATATAATATGTTATATATTATA TAATATAATAAATTATATTATATCATATAATATACAATATATTTTAATAA TAATATATAATAATTATATTATATAAAATATATAATTATATTATATAATA ATATATATAAGATATAATAATTATATACTATATATAATATATAATATATA TAATACATAATATATATACTATATAATATATTATATATATTATATATACT ATATAATATATTATATGTAATATATAATATATAATATATTATATAATATA TAATATATTATATATATTATATATAATATATTATAGATAATAGATATAAT ATATTATATATTATACATAATATATATAATATATTATATATAATATATAA TATATTATATATTATATATAATATATTATATATATTATGTATAATATATA ATATATTATATCTATTATCTATAACATGTATAATATATAATATATTATAT AACATATATAATATATTATATATATTATGTATAATATATAATATATTATA TATATTATCTATAATATGTATAATATATAATATATTATATATAACATATA TAATATACTATATATAATATATTATATATTATATATAATAGATATAGTAA TATATAATATATAAAAATATATAATATACAATATATTATATATAATATAT ATAATATATAATATATTATATATATTATATATAATAATATATAATATATA AAAATATATAATATATAATATATTATATACAATATATAATAATATATAAC ATATAATATATTATAATATATTATATAATATATTATAATATATTATATAA TATACATATATAATATATATAATATATATAATATATAATATATTGTATAA TAATTATATAATGTATAATATATTATATTATATAGTATTATATAATATAT TATATTATATAATATTATATAATATAATATATTATATAATACTATATAAT ATAATATATTATATAATATTATATAATATAATATATTTTATTATATAATA TAATATAATATAATTATATATTATATTATAATATATCATTTTATATTATA TTATAATATATCATATATTATAATATAATATATCATTATAATATATAATG ATATATTATAATATAATAATATAATATAATTATATATTATATTATAATAT ATAATTATATATTATATTATTATAATATAATTATATATCATAATATAATA TAATTACATATTATATTATAATAATATAATATAATTACATATTATATTAT AATATAATATAATATATAATTACATATTATATTATATTATATAATAATAT ATCATATTATATTATACTATATTATATTATAATATACTATATTATATTAT ATTATATTATGTTATATAATAATATATTATATTGTATTATATTATGTTAT ATAATAATATATTACATTATATTATGTTATATAATAATATATTATATTAT ATTATTTTTGTTATATAATATATTATATTATATTATATTATGTTATATAA TAATATATTATATTACATTACATAATAATATATTATATTACATTACATAA TAATATA	KCNJ1	ENSG00000151704.16	transcript	ENST00000392666.6	protein_coding		792		chr11	TogoVar
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