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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ANAPC1_chr2_111762640_111889193	111823997	A A	ATTTT ATTTT	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00140.hp2 others(139): Show HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00280.hp2 HG00408.hp1 HG00423.hp2 HG00544.hp1 HG00558.hp2 HG00621.hp1 HG00621.hp2 HG00733.hp2 HG00735.hp2 HG00741.hp1 HG00741.hp2 HG01070.hp2 HG01099.hp2 HG01106.hp1 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01168.hp1 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01169.hp2 HG01192.hp1 HG01256.hp1 HG01257.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp1 HG01258.hp2 HG01261.hp1 HG01346.hp2 HG01361.hp1 HG01361.hp2 HG01496.hp1 HG01496.hp2 HG01515.hp1 HG01517.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp2 HG01943.hp1 HG01943.hp2 HG01975.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp1 HG01978.hp2 HG02004.hp1 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02040.hp2 HG02056.hp1 HG02056.hp2 HG02071.hp1 HG02071.hp2 HG02080.hp2 HG02083.hp1 HG02129.hp1 HG02129.hp2 HG02148.hp2 HG02155.hp2 HG02165.hp2 HG02257.hp2 HG02293.hp2 HG02300.hp1 HG02300.hp2 HG02602.hp1 HG02602.hp2 HG02630.hp2 HG02698.hp1 HG02698.hp2 HG02717.hp1 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