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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ACVR1_chr2_157731446_157881330	157776468	C C	CA CA	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00408.hp1 others(145): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00408.hp1 HG00408.hp2 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00558.hp1 HG00558.hp2 HG00735.hp1 HG00735.hp2 HG01074.hp2 HG01168.hp1 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01243.hp1 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01255.hp2 HG01261.hp1 HG01261.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp2 HG01978.hp1 HG01978.hp2 HG02004.hp1 HG02004.hp2 HG02040.hp1 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02074.hp1 HG02074.hp2 HG02080.hp1 HG02080.hp2 HG02109.hp1 HG02132.hp1 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02135.hp2 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02155.hp1 HG02165.hp1 HG02165.hp2 HG02257.hp1 HG02257.hp2 HG02258.hp1 HG02258.hp2 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02486.hp2 HG02559.hp1 HG02559.hp2 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02647.hp2 HG02698.hp2 HG02717.hp1 HG02717.hp2 HG02809.hp1 HG02809.hp2 HG02895.hp1 HG02895.hp2 HG02897.hp1 HG02897.hp2 HG02922.hp1 HG02922.hp2 HG02965.hp1 HG02965.hp2 HG02970.hp2 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