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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ADAM10_chr15_58583809_58754707	58693761	T T	TA TA	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00323.hp2 HG00423.hp2 HG00544.hp1 others(115): Show HG00323.hp2 HG00423.hp2 HG00544.hp1 HG00558.hp2 HG01081.hp2 HG01106.hp2 HG01175.hp1 HG01243.hp2 HG01257.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp1 HG01515.hp1 HG01516.hp2 HG01517.hp2 HG01943.hp1 HG01981.hp1 HG01993.hp1 HG02004.hp1 HG02027.hp1 HG02055.hp1 HG02071.hp2 HG02074.hp2 HG02083.hp2 HG02135.hp1 HG02148.hp1 HG02258.hp1 HG02523.hp1 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02683.hp2 HG02698.hp1 HG02723.hp1 HG02886.hp2 HG02965.hp1 HG02970.hp1 HG03017.hp1 HG03041.hp1 HG03098.hp1 HG03130.hp1 HG03139.hp1 HG03139.hp2 HG03209.hp2 HG03239.hp2 HG03471.hp2 HG03669.hp2 HG03704.hp1 HG03927.hp2 HG03942.hp1 HG04115.hp2 HG04184.hp1 HG04228.hp1 NA18522.hp1 NA18522.hp2 NA18747.hp2 NA18940.hp1 NA18942.hp2 NA18943.hp1 NA18944.hp2 NA18947.hp1 NA18948.hp2 NA18949.hp1 NA18955.hp1 NA18957.hp1 NA18957.hp2 NA18960.hp2 NA18962.hp1 NA18962.hp2 NA18964.hp1 NA18966.hp2 NA18967.hp1 NA18968.hp1 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