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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ADD3_chr10_110002984_110140565	110011084	C C	CT CT	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00408.hp2 HG00423.hp2 HG00438.hp1 others(124): Show HG00408.hp2 HG00423.hp2 HG00438.hp1 HG00558.hp1 HG00597.hp1 HG00621.hp2 HG01069.hp1 HG01109.hp1 HG01109.hp2 HG01123.hp1 HG01168.hp2 HG01175.hp1 HG01243.hp1 HG01257.hp1 HG01258.hp1 HG01261.hp1 HG01361.hp1 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG01978.hp2 HG02027.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp2 HG02074.hp1 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02129.hp1 HG02129.hp2 HG02132.hp1 HG02132.hp2 HG02145.hp2 HG02155.hp1 HG02258.hp2 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02523.hp2 HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02683.hp2 HG02895.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp2 HG02922.hp1 HG02965.hp1 HG02965.hp2 HG02970.hp2 HG03041.hp1 HG03098.hp1 HG03098.hp2 HG03130.hp1 HG03139.hp2 HG03195.hp2 HG03209.hp1 HG03239.hp1 HG03453.hp2 HG03471.hp1 HG03471.hp2 HG03492.hp2 HG03516.hp1 HG03540.hp1 HG03540.hp2 HG03579.hp2 HG03654.hp1 HG03688.hp2 HG03710.hp2 HG03834.hp1 HG03927.hp1 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