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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ABCC1_chr16_15944616_16148053	16006425	G G	GA GA	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00099.hp1 HG00280.hp2 HG00323.hp2 others(115): Show HG00099.hp1 HG00280.hp2 HG00323.hp2 HG00408.hp1 HG00544.hp1 HG00558.hp1 HG00558.hp2 HG00597.hp2 HG00621.hp1 HG00621.hp2 HG00639.hp1 HG00642.hp1 HG00642.hp2 HG00673.hp1 HG00673.hp2 HG00738.hp2 HG01071.hp1 HG01081.hp1 HG01109.hp2 HG01168.hp2 HG01175.hp1 HG01175.hp2 HG01243.hp1 HG01243.hp2 HG01257.hp2 HG01261.hp1 HG01261.hp2 HG01496.hp2 HG01516.hp1 HG01516.hp2 HG01517.hp1 HG01517.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01978.hp1 HG01981.hp2 HG01993.hp2 HG02015.hp2 HG02055.hp1 HG02080.hp1 HG02129.hp2 HG02132.hp1 HG02135.hp2 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02155.hp1 HG02165.hp2 HG02257.hp1 HG02280.hp1 HG02300.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02486.hp2 HG02523.hp1 HG02523.hp2 HG02615.hp2 HG02630.hp2 HG02723.hp2 HG02735.hp1 HG02735.hp2 HG02809.hp1 HG02818.hp1 HG02886.hp1 HG02922.hp2 HG02976.hp1 HG02976.hp2 HG03017.hp1 HG03017.hp2 HG03098.hp1 HG03098.hp2 HG03130.hp1 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