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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ACAP2_chr3_195269745_195448020	195311103	G G	GT GT	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG00280.hp1 HG00323.hp2 HG00408.hp1 others(221): Show HG00280.hp1 HG00323.hp2 HG00408.hp1 HG00408.hp2 HG00438.hp1 HG00544.hp1 HG00544.hp2 HG00558.hp1 HG00609.hp1 HG00609.hp2 HG00621.hp1 HG00621.hp2 HG00642.hp1 HG00642.hp2 HG00673.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp2 HG01069.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp1 HG01071.hp1 HG01071.hp2 HG01074.hp2 HG01081.hp1 HG01081.hp2 HG01109.hp1 HG01123.hp1 HG01123.hp2 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01175.hp1 HG01175.hp2 HG01255.hp1 HG01255.hp2 HG01256.hp2 HG01257.hp2 HG01258.hp1 HG01358.hp1 HG01361.hp2 HG01433.hp2 HG01517.hp1 HG01517.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01934.hp1 HG01943.hp1 HG01978.hp2 HG02004.hp2 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02027.hp2 HG02040.hp1 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp2 HG02074.hp1 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02129.hp2 HG02132.hp1 HG02135.hp1 HG02135.hp2 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02165.hp1 HG02258.hp2 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02300.hp1 HG02300.hp2 HG02451.hp2 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