Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

Search by Variant

Regionname

Chr

Snpeff genename

Sampleids

Snpeff haplotype class

Snpeff annotation impact

Snpeff annotation impact detail

Hapid

Samplehapid

No_hapid

No_samplehapid

Start

End

Minac

Maxac

Minlen

Maxlen

Sort By

Order by

view	regionname	pos	ref	alt	annotation	impact	samples	ahapids	chapids	thapids	thapids	ac	an	af	len	hgvs_c	hgvs_p	genename	geneid	featuretype	featureid	transcript_biotype	rank	cdna cdna pos length	cds cds pos length	aa aa pos length	distance	status	chr	external
	UCN3_chr10_5359966_5379692	5370270	T T	TGTGTGTG others(892): Show TGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGGGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTG TATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATATGCG TGTGTATGCGTGTGTGTATATGCGTGTGTATGCGTGTGGGTATATGCGTG TGTATGCGTGTGGGTATATGCGTGTGTGTATGCGTGTGTGTATATGTGTG TATGTGTGTGTATATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATCTG TGTGTGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTATATGTGTGTATGTGTGTGTG TATCTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTA TATGTGTGTATATGTGTGTGTACGTGTGTGTGTGTATGTGTGTATGTGTG TGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATG TGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATATGCG TGTGTATGCGTGTGTGTATATGCGTGTGTATATATGCGTGTGTGTATGCG TGTGTATGCGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATATGCGTGTGTA TGCGTGTGTATGCGTGTGTATGGGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTG TGTATATGTGTGTATATGTGTGTGTATATGTGTGTATGTGTGTATATGTG TGCGTATATGCGTGTGTATATGCGTGTGTATGTGCGTGTGTATGTGCGTG TGTATATGCGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATATGATGTGAGTGT ATATGCGTGTGTATATGCGTGTGTATATGCGTGTGTGTGTGTATGCGTGT GTATATGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGTGTGTGC	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG03239.hp1 HG03239.hp1	a0002 a0002	a0002c0002 a0002c0002	a0002c0002t0007 a0002c0002t0007	a0002c0002t0007g0110 a0002c0002t0007g0110	1	468	0.0021	899	c.-6- others(914): Show c.-6-3445_-6-3444insGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGGGTGTGT ATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGT GTATGTGTGTGTATATGCGTGTGTATGCGTGTGTGTATATGCGTGTGTAT GCGTGTGGGTATATGCGTGTGTATGCGTGTGGGTATATGCGTGTGTGTAT GCGTGTGTGTATATGTGTGTATGTGTGTGTATATGTGTGTGTATGTGTGT GTATGTGTGTGTGTATCTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTAT ATGTGTGTATGTGTGTGTGTATCTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTAT GTGTGTGTGTATGTGTGTATATGTGTGTATATGTGTGTGTACGTGTGTGT GTGTATGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGT GTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTAT GTGTGTGTGTGTATATGCGTGTGTATGCGTGTGTGTATATGCGTGTGTAT ATATGCGTGTGTGTATGCGTGTGTATGCGTGTGTGTATGTGTGTGTATGT GTGTGTATATGCGTGTGTATGCGTGTGTATGCGTGTGTATGGGTGTGTGT ATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATATGTGTGTATATGTGTGTGTATATGT GTGTATGTGTGTATATGTGTGCGTATATGCGTGTGTATATGCGTGTGTAT GTGCGTGTGTATGTGCGTGTGTATATGCGTGTGTATGTGTGTGTATGTGT GTGTATATGATGTGAGTGTATATGCGTGTGTATATGCGTGTGTATATGCG TGTGTGTGTGTATGCGTGTGTATATGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCGTG TGTGTGCGCGTGTGTGTGC		UCN3	ENSG00000178473.7	transcript	ENST00000380433.5	protein_coding	1/1						chr10	TogoVar
	UCN3_chr10_5359966_5379692	5370270	T T	TGTGTGTG others(892): Show TGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGGGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTG TATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATATGCG TGTGTATGCGTGTGTGTATATGCGTGTGTATGCGTGTGGGTATATGCGTG TGTATGCGTGTGGGTATATGCGTGTGTGTGTATGCGTGTGTGTATATGTG TGTATGTGTGTGTATATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATC TGTGTGTGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTATATGTGTGTATGTGTGTG TGTATCTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTG TATATGTGTGTATATGTGTGTGTACGTGTGTGTGTGTATGTGTGTATGTG TGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTA TGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTATATG CGTGTGTATGCGTGTGTGTATATGCATGTGTATATATGCGTGTGTGTATG CGTGTGTATGCGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATATGCGTGTG TATGCGTGTGTATGCGTGTGTATGGGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTG TGTGTATATGTGTGTATATGTGTGTGTATATGTGTGTATGTGTGTATATG TGTGCGTATATGCGTGTGTATATGCGTGTGTATGTGCGTGTGTATGTGCG TGTGTATATGCGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTATATGATGTGAGTGT ATATGCGTGTGTATATGCGTGTGTATATGCGTGTGTGTGTGTATGCGTGT GTATATGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGCGTGTGTGTGC	intron_variant intron_variant	MODIFIER	HG02300.hp1 HG02300.hp1	a0002 a0002	a0002c0002 a0002c0002	a0002c0002t0003 a0002c0002t0003	a0002c0002t0003g0091 a0002c0002t0003g0091	1	468	0.0021	899	c.-6- others(914): Show c.-6-3445_-6-3444insGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGGGTGTGT ATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGT GTATGTGTGTGTATATGCGTGTGTATGCGTGTGTGTATATGCGTGTGTAT GCGTGTGGGTATATGCGTGTGTATGCGTGTGGGTATATGCGTGTGTGTGT ATGCGTGTGTGTATATGTGTGTATGTGTGTGTATATGTGTGTGTATGTGT GTGTATGTGTGTGTGTATCTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGT ATATGTGTGTATGTGTGTGTGTATCTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGT ATGTGTGTGTGTATGTGTGTATATGTGTGTATATGTGTGTGTACGTGTGT GTGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTATGTGTGTAT GTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGT ATGTGTGTGTGTGTATATGCGTGTGTATGCGTGTGTGTATATGCATGTGT ATATATGCGTGTGTGTATGCGTGTGTATGCGTGTGTGTATGTGTGTGTAT GTGTGTGTATATGCGTGTGTATGCGTGTGTATGCGTGTGTATGGGTGTGT GTATGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATATGTGTGTATATGTGTGTGTATAT GTGTGTATGTGTGTATATGTGTGCGTATATGCGTGTGTATATGCGTGTGT ATGTGCGTGTGTATGTGCGTGTGTATATGCGTGTGTATGTGTGTATGTGT GTGTATATGATGTGAGTGTATATGCGTGTGTATATGCGTGTGTATATGCG TGTGTGTGTGTATGCGTGTGTATATGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCGTG TGTGTGCGCGTGTGTGTGC		UCN3	ENSG00000178473.7	transcript	ENST00000380433.5	protein_coding	1/1						chr10	TogoVar
	ZNF30_chr19_34921903_34950168	34923077	A A	ATATATAA others(892): Show ATATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTAT GTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAA CTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATA TAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTAT ATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGT TATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACA TAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGT ATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGT TATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACT TGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATA ACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATAT TGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTA TGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATA ACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTAT ATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTA TATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTG TTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAAC ATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTG	upstream_gene_variant upstream_gene_variant	MODIFIER	HG02647.hp2 HG02647.hp2	a0002 a0002	a0002c0002 a0002c0002	a0002c0002t0010 a0002c0002t0010	a0002c0002t0010g0232 a0002c0002t0010g0232	1	412	0.0024	899	c.-42 others(910): Show c.-4204_-4203insTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATAT AACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATA TTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTT ATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACAT AACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTA TATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTT ATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTT GTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAA CATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATT GTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTAT GTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAA CTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATA TAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTAT ATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGT TATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACA TAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGT ATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACTTGTTATGT TATATTGTATATAACATAACTTGTTATGTTATATTGTATATAACATAACT TGTTATGTTATATTG		ZNF30	ENSG00000168661.15	transcript	ENST00000601142.2	protein_coding					3825		chr19	TogoVar