Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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Chr

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HLA-C_chr6_31263749_31277092	31270037	A A	AGGACAGC others(11): Show AGGACAGCCAGGACAGCTG	conservative_inframe_insertion conservative_inframe_insertion	MODERATE	HG01891.hp1 HG02055.hp1 HG02257.hp2 others(7): Show HG01891.hp1 HG02055.hp1 HG02257.hp2 HG02486.hp2 HG02630.hp1 HG02922.hp2 HG03098.hp1 HG03139.hp1 HG03225.hp1 HG03471.hp1	a0017 a0032 a0017 a0032	a0017c0017 a0032c0033 a0017c0017 a0032c0033	a0017c0017t0010 a0032c0033t0010 a0017c0017t0010 a0032c0033t0010	a0017c0017t0010g0017 a0032c0033t0010g0046 a0017c0017t0010g0017 a0032c0033t0010g0046	10	448	0.0223	18	c.943 others(25): Show c.943_944insCAGCTGTCCTGGCTGTCC	p.Gly others(31): Show p.Gly314_Leu315insProAlaValLeuAlaVal	HLA-C	ENSG00000204525.18	transcript	ENST00000376228.10	protein_coding	5/8	964/1542	943/1101	315/366		chr6	TogoVar
HNRNPA0_chr5_137740651_137759363	137753256	C C	CGCT CGCT	conservative_inframe_insertion conservative_inframe_insertion	MODERATE	HG02109.hp1 HG03239.hp1 HG03710.hp2 HG02109.hp1 HG03239.hp1 HG03710.hp2	a0002 a0002	a0002c0002 a0002c0002	a0002c0002t0001 a0002c0002t0001	a0002c0002t0001g0000 a0002c0002t0001g0000	3	366	0.0082	3	c.808 others(10): Show c.808_810dupAGC	p.Ser others(6): Show p.Ser270dup	HNRNPA0	ENSG00000177733.7	transcript	ENST00000314940.7	protein_coding	1/1	1107/8713	810/918	270/305		chr5	TogoVar
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HOXB1_chr17_48523526_48536011	48530822	G G	GGGGCGCT others(2): Show GGGGCGCTGT	conservative_inframe_insertion conservative_inframe_insertion	MODERATE	HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00408.hp1 others(44): Show HG00280.hp1 HG00280.hp2 HG00408.hp1 HG00558.hp2 HG00597.hp1 HG00609.hp1 HG00639.hp2 HG00735.hp1 HG00735.hp2 HG00741.hp2 HG01123.hp1 HG01123.hp2 HG01168.hp1 HG01169.hp2 HG01496.hp2 HG02004.hp1 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02040.hp1 HG02083.hp1 HG02165.hp1 HG02273.hp1 HG02486.hp2 HG02572.hp1 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02965.hp1 HG02965.hp2 HG03098.hp2 HG03130.hp1 HG03195.hp1 HG03490.hp1 HG03490.hp2 HG03492.hp1 HG03579.hp1 HG03669.hp2 HG03831.hp2 HG04204.hp2 NA18948.hp1 NA18983.hp2 NA19043.hp1 NA19080.hp1 NA19085.hp2 NA19240.hp1 NA20752.hp1	a0002 a0005 a0002 a0005	a0002c0002 a0002c0003 a0002c0006 others(3): Show a0002c0002 a0002c0003 a0002c0006 a0002c0008 a0002c0009 a0005c0007	a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0010 others(5): Show a0002c0002t0001 a0002c0002t0002 a0002c0002t0010 a0002c0003t0001 a0002c0006t0001 a0002c0008t0002 a0002c0009t0002 a0005c0007t0001	a0002c0002t0001g0017 a0002c0002t0002g0002 a0002c0002t0002g0018 others(6): Show a0002c0002t0001g0017 a0002c0002t0002g0002 a0002c0002t0002g0018 a0002c0002t0010g0016 a0002c0003t0001g0003 a0002c0006t0001g0013 a0002c0008t0002g0015 a0002c0009t0002g0019 a0005c0007t0001g0014	47	424	0.1108	9	c.74_ others(14): Show c.74_82dupACAGCGCCC	p.His others(11): Show p.His25_Ala27dup	HOXB1	ENSG00000120094.9	transcript	ENST00000239174.7	protein_coding	1/2	189/2034	82/906	28/301		chr17	TogoVar
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HRCT1_chr9_35901202_35912136	35906589	A A	ACCACCAC others(32): Show ACCACCACCACCACCCCCACCGCCACACCCCTCACCACCT	conservative_inframe_insertion conservative_inframe_insertion	MODERATE	NA18992.hp1 NA18992.hp1	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0001 a0001c0001t0001	a0001c0001t0001g0000 a0001c0001t0001g0000	1	387	0.0026	39	c.327 others(46): Show c.327_328insACCCCTCACCACCTCCACCACCACCACCCCCACCGCCA C	p.His others(52): Show p.His109_His110insThrProHisHisLeuHisHisHisHisProHi sArgHis	HRCT1	ENSG00000196196.3	transcript	ENST00000354323.3	protein_coding	1/1	414/935	328/348	110/115	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr9	TogoVar
HRCT1_chr9_35901202_35912136	35906589	A A	ACCACCAC others(44): Show ACCACCACCACCACCCCCACCGCCACCATCCCCGCCACACCCCTCACCAC CT	conservative_inframe_insertion conservative_inframe_insertion	MODERATE	NA18947.hp1 NA18960.hp1 NA18974.hp2 others(5): Show NA18947.hp1 NA18960.hp1 NA18974.hp2 NA18982.hp1 NA18990.hp2 NA19001.hp2 NA19059.hp1 NA19091.hp1	a0008 a0008	a0008c0007 a0008c0007	a0008c0007t0001 a0008c0007t0001	a0008c0007t0001g0000 a0008c0007t0001g0000	8	394	0.0203	51	c.339 others(58): Show c.339_340insACCCCTCACCACCTCCACCACCACCACCCCCACCGCCA CCATCCCCGCCAC	p.His others(64): Show p.His113_Ala114insThrProHisHisLeuHisHisHisHisProHi sArgHisHisProArgHis	HRCT1	ENSG00000196196.3	transcript	ENST00000354323.3	protein_coding	1/1	426/935	340/348	114/115	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr9	TogoVar
HRCT1_chr9_35901202_35912136	35906589	A A	ACCACCAC others(95): Show ACCACCACCACCACCCCCACCGCCACCATCCCCGCCACACCCCTCACCAC CTCCACCACCACCACCCCCACCGCCACCATCCCCGCCACACCCCTCACCA CCT	conservative_inframe_insertion conservative_inframe_insertion	MODERATE	NA19004.hp1 NA19004.hp1	a0008 a0008	a0008c0007 a0008c0007	a0008c0007t0001 a0008c0007t0001	a0008c0007t0001g0000 a0008c0007t0001g0000	1	387	0.0026	102	c.339 others(109): Show c.339_340insACCCCTCACCACCTCCACCACCACCACCCCCACCGCCA CCATCCCCGCCACACCCCTCACCACCTCCACCACCACCACCCCCACCGCC ACCATCCCCGCCAC	p.His others(115): Show p.His113_Ala114insThrProHisHisLeuHisHisHisHisProHi sArgHisHisProArgHisThrProHisHisLeuHisHisHisHisProH isArgHisHisProArgHis	HRCT1	ENSG00000196196.3	transcript	ENST00000354323.3	protein_coding	1/1	426/935	340/348	114/115	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr9	TogoVar
HRC_chr19_49146198_49160396	49154274	G G	GGTGCCTG others(149): Show GGTGCCTGTGGGCCTGGTGTCCATACTCAGTGGAGACATCATCATCATCA TCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTTTGTGGCCTCGGTGCCTGTGGCTGGG GCTGTGATGGTGGTGTTCATCGGAGACATCCTCATCCTCTTCCTTTCTGT GACCTCC	conservative_inframe_insertion conservative_inframe_insertion	MODERATE	NA18906.hp1 NA18906.hp1	a0039 a0039	a0039c0035 a0039c0035	a0039c0035t0001 a0039c0035t0001	a0039c0035t0001g0047 a0039c0035t0001g0047	1	381	0.0026	156	c.963 others(163): Show c.963_964insGGAGGTCACAGAAAGGAAGAGGATGAGGATGTCTCCGA TGAACACCACCATCACAGCCCCAGCCACAGGCACCGAGGCCACAAAGAAG AAGAAGAAGATGATGATGATGATGATGATGATGTCTCCACTGAGTATGGA CACCAGGCCCACAGGCAC	p.His others(169): Show p.His321_Gln322insGlyGlyHisArgLysGluGluAspGluAspVa lSerAspGluHisHisHisHisSerProSerHisArgHisArgGlyHisL ysGluGluGluGluAspAspAspAspAspAspAspAspValSerThrGlu TyrGlyHisGlnAlaHisArgHis	HRC	ENSG00000130528.12	transcript	ENST00000252825.9	protein_coding	1/6	1122/2357	963/2100	321/699		chr19	TogoVar
HRC_chr19_49146198_49160396	49154274	G G	GGTGCCTG others(146): Show GGTGCCTGTGGGCCTGGTGTCCATACTCAGTGGAGACATCATCATCATCA TCATCATCATCTTCTTCTTCTTTGTGGCCTCGGTGCCTGTGGCTGGGGCT GTGATGGTGGTGTTCATCGGAGACATCCTCATCCTCTTCCTTTCTGTGAC CTCC	conservative_inframe_insertion conservative_inframe_insertion	MODERATE	HG02896.hp1 HG02896.hp1	a0035 a0035	a0035c0051 a0035c0051	a0035c0051t0001 a0035c0051t0001	a0035c0051t0001g0076 a0035c0051t0001g0076	1	381	0.0026	153	c.963 others(160): Show c.963_964insGGAGGTCACAGAAAGGAAGAGGATGAGGATGTCTCCGA TGAACACCACCATCACAGCCCCAGCCACAGGCACCGAGGCCACAAAGAAG AAGAAGATGATGATGATGATGATGATGATGTCTCCACTGAGTATGGACAC CAGGCCCACAGGCAC	p.His others(166): Show p.His321_Gln322insGlyGlyHisArgLysGluGluAspGluAspVa lSerAspGluHisHisHisHisSerProSerHisArgHisArgGlyHisL ysGluGluGluAspAspAspAspAspAspAspAspValSerThrGluTyr GlyHisGlnAlaHisArgHis	HRC	ENSG00000130528.12	transcript	ENST00000252825.9	protein_coding	1/6	1122/2357	963/2100	321/699		chr19	TogoVar
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