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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ADARB1_chr21_45069580_45231560	45224648	A A	G G	3_prime_UTR_variant 3_prime_UTR_variant	MODIFIER	HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00280.hp2 others(208): Show HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00280.hp2 HG00408.hp1 HG00408.hp2 HG00423.hp1 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00544.hp2 HG00558.hp2 HG00639.hp1 HG00642.hp1 HG00642.hp2 HG00673.hp1 HG00673.hp2 HG00733.hp2 HG00738.hp1 HG00741.hp2 HG01069.hp1 HG01081.hp2 HG01106.hp2 HG01109.hp1 HG01123.hp1 HG01167.hp1 HG01192.hp2 HG01257.hp1 HG01261.hp1 HG01261.hp2 HG01358.hp2 HG01361.hp2 HG01433.hp2 HG01496.hp2 HG01516.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp1 HG01934.hp2 HG01943.hp1 HG01952.hp2 HG01975.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp1 HG01978.hp2 HG01981.hp2 HG01993.hp1 HG01993.hp2 HG02015.hp1 HG02015.hp2 HG02040.hp1 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02071.hp1 HG02074.hp2 HG02080.hp1 HG02080.hp2 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02109.hp2 HG02129.hp1 HG02129.hp2 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02135.hp2 HG02145.hp1 HG02148.hp2 HG02165.hp2 HG02257.hp2 HG02258.hp2 HG02273.hp2 HG02280.hp2 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