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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ADNP_chr20_50883918_50936437	50889923	C C	A A	3_prime_UTR_variant 3_prime_UTR_variant	MODIFIER	HG03471.hp1 HG03516.hp2 HG03471.hp1 HG03516.hp2	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0068 a0001c0001t0098 a0001c0001t0068 a0001c0001t0098	a0001c0001t0068g0101 a0001c0001t0098g0348 a0001c0001t0068g0101 a0001c0001t0098g0348	2	358	0.0056	0	c.14 others(5): Show c.1482G>T	ADNP	ENSG00000101126.18	transcript	ENST00000621696.5	protein_coding	6/6	1482		chr20	TogoVar
ADNP_chr20_50883918_50936437	50889964	G G	GA GA	3_prime_UTR_variant 3_prime_UTR_variant	MODIFIER	HG00099.hp2 HG00423.hp2 HG00544.hp2 others(228): Show HG00099.hp2 HG00423.hp2 HG00544.hp2 HG00558.hp2 HG00609.hp2 HG00621.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00642.hp2 HG00673.hp1 HG00741.hp1 HG00741.hp2 HG01069.hp1 HG01069.hp2 HG01071.hp1 HG01074.hp1 HG01099.hp1 HG01106.hp2 HG01109.hp2 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01167.hp2 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01175.hp1 HG01243.hp1 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01256.hp1 HG01261.hp2 HG01358.hp2 HG01361.hp2 HG01433.hp2 HG01496.hp2 HG01515.hp1 HG01517.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp1 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01952.hp2 HG01978.hp1 HG01978.hp2 HG01981.hp1 HG02004.hp1 HG02015.hp2 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp2 HG02074.hp1 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02135.hp2 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02148.hp1 HG02155.hp2 HG02257.hp2 HG02258.hp1 HG02273.hp1 HG02280.hp1 HG02280.hp2 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