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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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AGPAT2_chr9_136668143_136692457	136673595	G G	A A	3_prime_UTR_variant 3_prime_UTR_variant	MODIFIER	HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00408.hp1 others(294): Show HG00323.hp1 HG00323.hp2 HG00408.hp1 HG00408.hp2 HG00423.hp1 HG00423.hp2 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp1 HG00544.hp2 HG00558.hp2 HG00597.hp1 HG00597.hp2 HG00609.hp1 HG00609.hp2 HG00621.hp2 HG00639.hp1 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00642.hp2 HG00673.hp1 HG00673.hp2 HG00733.hp1 HG00733.hp2 HG00735.hp1 HG00735.hp2 HG00738.hp1 HG01069.hp1 HG01071.hp1 HG01071.hp2 HG01074.hp2 HG01081.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp1 HG01109.hp1 HG01167.hp1 HG01167.hp2 HG01168.hp1 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01169.hp2 HG01175.hp1 HG01175.hp2 HG01192.hp1 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01255.hp2 HG01256.hp2 HG01258.hp1 HG01258.hp2 HG01261.hp1 HG01346.hp1 HG01346.hp2 HG01361.hp1 HG01361.hp2 HG01496.hp2 HG01515.hp2 HG01516.hp1 HG01516.hp2 HG01517.hp1 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01928.hp1 HG01928.hp2 HG01934.hp1 HG01934.hp2 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01952.hp2 HG01975.hp1 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