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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ACTR10_chr14_58195149_58240636	58234920	T T	C C	3_prime_UTR_variant 3_prime_UTR_variant	MODIFIER	HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 others(180): Show HG00099.hp1 HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00323.hp1 HG00408.hp1 HG00408.hp2 HG00423.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp2 HG00597.hp1 HG00621.hp2 HG00642.hp2 HG00673.hp2 HG00738.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01074.hp1 HG01074.hp2 HG01081.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp2 HG01109.hp1 HG01109.hp2 HG01123.hp1 HG01168.hp1 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01169.hp2 HG01255.hp2 HG01256.hp2 HG01258.hp1 HG01261.hp2 HG01346.hp1 HG01346.hp2 HG01358.hp2 HG01433.hp1 HG01433.hp2 HG01515.hp1 HG01515.hp2 HG01516.hp1 HG01516.hp2 HG01517.hp1 HG01517.hp2 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp2 HG01934.hp1 HG01934.hp2 HG01943.hp1 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01975.hp2 HG01978.hp1 HG01981.hp1 HG01993.hp1 HG02015.hp2 HG02027.hp1 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02056.hp1 HG02056.hp2 HG02071.hp2 HG02080.hp1 HG02109.hp2 HG02145.hp1 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