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Regionname

e.g. ALDH2_chr12_111761933_111822532, HBB_chr11_5220464_5232071.

Chr

Chromosome name (e.g., chr11).

Snpeff genename

Exact SnpEff gene name.

Sampleids

Target sampleid (e.g. HG02615).

Snpeff haplotype class

Haplotype-annotation class (e.g., ahapid, ahapid+chapid).

Snpeff annotation impact

Exact impact level (e.g., HIGH, MODERATE, LOW).

Snpeff annotation impact detail

Keyword match in SnpEff annotation.

Hapid

One or more haplotype IDs (comma-separated; e.g., a0001, a01, a0001c0001, a01c02, a1c2, a0001c0001t0005, a0001c0001t0005g0018).

Samplehapid

Sample haplotype IDs to include (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

No_hapid

Haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., a0001, a0002, a0001c0001, a0001c0001t0005, a1, a01).

No_samplehapid

Sample haplotype IDs to exclude (comma-separated; e.g., HG02257.hp1, HG02615.hp2, HG00673.hp2).

Start

Start position (GRCh38).

End

End position (GRCh38).

Minac

Minimum alternate allele count (≥).

Maxac

Maximum alternate allele count (≤).

Minlen

Minimum variant length (≥).

Maxlen

Maximum variant length (≤).

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ADAM10_chr15_58583809_58754707	58589589	G G	A A	3_prime_UTR_variant 3_prime_UTR_variant	MODIFIER	HG03239.hp2 HG03239.hp2	a0001 a0001	a0001c0001 a0001c0001	a0001c0001t0070 a0001c0001t0070	a0001c0001t0070g0260 a0001c0001t0070g0260	1	342	0.0029	0	c.79 others(5): Show c.7958C>T	ADAM10	ENSG00000137845.15	transcript	ENST00000260408.8	protein_coding	16/16	7958	chr15	TogoVar
ADAM10_chr15_58583809_58754707	58589770	T T	C C	3_prime_UTR_variant 3_prime_UTR_variant	MODIFIER	HG00099.hp1 HG00423.hp1 HG00438.hp1 others(121): Show HG00099.hp1 HG00423.hp1 HG00438.hp1 HG00438.hp2 HG00544.hp2 HG00558.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp1 HG00673.hp1 HG00735.hp1 HG00735.hp2 HG01069.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01081.hp1 HG01256.hp1 HG01346.hp2 HG01515.hp2 HG01517.hp1 HG01884.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp1 HG01981.hp2 HG01993.hp2 HG02004.hp2 HG02027.hp2 HG02071.hp1 HG02080.hp1 HG02080.hp2 HG02135.hp2 HG02148.hp2 HG02155.hp2 HG02165.hp1 HG02258.hp2 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02523.hp2 HG02615.hp1 HG02622.hp2 HG02735.hp2 HG02886.hp1 HG02896.hp1 HG02965.hp1 HG02976.hp2 HG03017.hp2 HG03041.hp2 HG03209.hp2 HG03225.hp2 HG03239.hp1 HG03453.hp1 HG03491.hp2 HG03492.hp1 HG03579.hp1 HG03688.hp1 HG03688.hp2 HG03704.hp2 HG03710.hp1 HG03831.hp1 HG03834.hp1 HG03927.hp1 HG03942.hp2 HG04184.hp2 HG04228.hp2 HG06807.hp1 NA18612.hp1 NA18747.hp1 NA18939.hp1 NA18940.hp2 NA18942.hp1 NA18943.hp2 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