Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr11:22236252	C C	T T	1	a0001c0011 a0001c0011	1	HG03704.hp1 HG03704.hp1	synonymous_variant	LOW	c.738C>T c.738C>T	p.Tyr246Tyr p.Tyr246Tyr	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	8/22	1146/6742	738/2742	246/913	chr11	22236252
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chr11:22281078	A A	G G	10	a0001c0001t0005 a0001c0001t0008 a0001c0001t0019 others(7): Show a0001c0001t0005 a0001c0001t0008 a0001c0001t0019 a0001c0001t0027 a0001c0001t0029 a0001c0004t0019 a0002c0003t0008 a0003c0005t0010 a0006c0009t0028 a0012c0010t0037	35	HG01243.hp1 HG01975.hp2 HG02109.hp1 others(32): Show HG01243.hp1 HG01975.hp2 HG02109.hp1 HG02145.hp1 HG02257.hp2 HG02451.hp2 HG02486.hp2 HG02559.hp1 HG02630.hp1 HG02717.hp1 HG02809.hp1 HG02809.hp2 HG02886.hp1 HG02896.hp2 HG02922.hp2 HG02965.hp1 HG02976.hp1 HG03098.hp2 HG03139.hp1 HG03139.hp2 HG03225.hp1 HG03453.hp1 HG03471.hp1 HG03486.hp2 HG03579.hp1 HG03579.hp2 HG06807.hp1 HG06807.hp2 NA18906.hp2 NA19030.hp1 NA19030.hp2 NA19043.hp1 NA19043.hp2 NA19240.hp1 NA20300.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1313A>G c.1313A>G	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	1313		chr11	22281078
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chr11:22281327	C C	A A	1	a0001c0002t0041 a0001c0002t0041	1	HG02735.hp2 HG02735.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1562C>A c.1562C>A	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	1562		chr11	22281327
chr11:22281334	A A	G G	1	a0001c0002t0041 a0001c0002t0041	1	HG02735.hp2 HG02735.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1569A>G c.1569A>G	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	1569		chr11	22281334
chr11:22281335	A A	AGGAAAGG others(65): Show AGGAAAGGGGGTATTGGAGGGAGGCTGGGGAGGCTGATCATGGGGGGGAG GAGAGTGAGAGGGGGGCCGAGGG	1	a0001c0002t0041 a0001c0002t0041	1	HG02735.hp2 HG02735.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1571_1572insGAAA others(68): Show c.1571_1572insGAAAGGGGGTATTGGAGGGAGGCTGGGGAGGCTG ATCATGGGGGGGAGGAGAGTGAGAGGGGGGCCGAGGGG	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	1572	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr11	22281335
chr11:22281337	C C	T T	1	a0001c0002t0041 a0001c0002t0041	1	HG02735.hp2 HG02735.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1572C>T c.1572C>T	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	1572		chr11	22281337
chr11:22281346	C C	T T	1	a0001c0001t0036 a0001c0001t0036	1	HG02071.hp2 HG02071.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1581C>T c.1581C>T	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	1581		chr11	22281346
chr11:22281395	C C	A A	1	a0001c0002t0039 a0001c0002t0039	1	NA18979.hp1 NA18979.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1630C>A c.1630C>A	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	1630		chr11	22281395
chr11:22281426	C C	T T	1	a0001c0001t0011 a0001c0001t0011	5	HG02055.hp1 HG02486.hp1 HG02615.hp1 others(2): Show HG02055.hp1 HG02486.hp1 HG02615.hp1 HG02647.hp1 HG02723.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1661C>T c.1661C>T	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	1661		chr11	22281426
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chr11:22281477	T T	C C	1	a0001c0002t0023 a0001c0002t0023	2	HG02280.hp1 HG03195.hp2 HG02280.hp1 HG03195.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1712T>C c.1712T>C	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	1712		chr11	22281477
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chr11:22282334	C C	T T	1	a0002c0003t0020 a0002c0003t0020	2	HG01070.hp1 HG01071.hp1 HG01070.hp1 HG01071.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2569C>T c.2569C>T	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	2569		chr11	22282334
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chr11:22282476	T T	C C	1	a0001c0001t0043 a0001c0001t0043	1	HG03225.hp2 HG03225.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2711T>C c.2711T>C	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	2711		chr11	22282476
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chr11:22282600	A A	C C	1	a0006c0009t0028 a0006c0009t0028	1	NA19043.hp2 NA19043.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2835A>C c.2835A>C	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	2835		chr11	22282600
chr11:22282634	A A	G G	1	a0001c0001t0009 a0001c0001t0009	6	HG00642.hp1 HG01243.hp2 HG01256.hp1 others(3): Show HG00642.hp1 HG01243.hp2 HG01256.hp1 HG01258.hp2 HG02965.hp2 HG03209.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2869A>G c.2869A>G	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	2869		chr11	22282634
chr11:22282666	A A	G G	1	a0001c0001t0034 a0001c0001t0034	1	HG02717.hp2 HG02717.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2901A>G c.2901A>G	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	2901		chr11	22282666
chr11:22282886	A A	G G	1	a0002c0003t0022 a0002c0003t0022	2	HG02258.hp1 HG02602.hp1 HG02258.hp1 HG02602.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3121A>G c.3121A>G	ANO5	ENSG00000171714.13	transcript	ENST00000324559.9	protein_coding	22/22	3121		chr11	22282886
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ANO5_chr11_22188085_22288357 Genic Haplotype Structure on iGV

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Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 12)

Coding Level Haplotype Info (Total: 17)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 63)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 333)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 364)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 14)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 7)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 67)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1175)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)