Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr15:34910295	A A	G G	1	a0001c0016 a0001c0016	1	NA18975.hp2 NA18975.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1503T>C c.1503T>C	p.Gly501Gly p.Gly501Gly	AQR	ENSG00000021776.11	transcript	ENST00000156471.10	protein_coding	17/35	1632/9597	1503/4458	501/1485	chr15	34910295
chr15:34927076	T T	C C	1	a0004c0025 a0004c0025	1	HG06807.hp2 HG06807.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1077A>G c.1077A>G	p.Val359Val p.Val359Val	AQR	ENSG00000021776.11	transcript	ENST00000156471.10	protein_coding	13/35	1206/9597	1077/4458	359/1485	chr15	34927076
chr15:34930333	A A	G G	1	a0001c0010 a0001c0010	3	NA18950.hp2 NA18952.hp1 NA19011.hp2 NA18950.hp2 NA18952.hp1 NA19011.hp2	synonymous_variant	LOW	c.939T>C c.939T>C	p.Ile313Ile p.Ile313Ile	AQR	ENSG00000021776.11	transcript	ENST00000156471.10	protein_coding	12/35	1068/9597	939/4458	313/1485	chr15	34930333
chr15:34934576	G G	A A	1	a0002c0009 a0002c0009	4	HG02572.hp2 HG03130.hp2 NA18906.hp1 others(1): Show HG02572.hp2 HG03130.hp2 NA18906.hp1 NA19030.hp2	synonymous_variant	LOW	c.778C>T c.778C>T	p.Leu260Leu p.Leu260Leu	AQR	ENSG00000021776.11	transcript	ENST00000156471.10	protein_coding	10/35	907/9597	778/4458	260/1485	chr15	34934576
chr15:34934619	G G	A A	1	a0001c0011 a0001c0011	3	HG02109.hp2 HG02451.hp2 NA20129.hp2 HG02109.hp2 HG02451.hp2 NA20129.hp2	synonymous_variant	LOW	c.735C>T c.735C>T	p.Asp245Asp p.Asp245Asp	AQR	ENSG00000021776.11	transcript	ENST00000156471.10	protein_coding	10/35	864/9597	735/4458	245/1485	chr15	34934619
chr15:34948339	T T	C C	1	a0001c0026 a0001c0026	1	HG01346.hp2 HG01346.hp2	synonymous_variant	LOW	c.255A>G c.255A>G	p.Val85Val p.Val85Val	AQR	ENSG00000021776.11	transcript	ENST00000156471.10	protein_coding	5/35	384/9597	255/4458	85/1485	chr15	34948339
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AQR_chr15_34846782_34974742 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 9)

Coding Level Haplotype Info (Total: 26)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 86)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 309)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 312)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 8)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 17)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 58)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1288)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)