Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr9:71730242	G G	A A	4	a0005c0004 a0005c0017 a0008c0011 others(1): Show a0005c0004 a0005c0017 a0008c0011 a0008c0022	28	HG01070.hp1 HG01109.hp1 HG01167.hp1 others(25): Show HG01070.hp1 HG01109.hp1 HG01167.hp1 HG01169.hp2 HG01175.hp2 HG01261.hp1 HG01981.hp2 HG02257.hp2 HG03225.hp1 HG03490.hp1 HG03669.hp1 HG03710.hp2 HG03834.hp2 HG04115.hp2 HG04199.hp2 HG04204.hp2 NA18941.hp1 NA18944.hp2 NA18945.hp2 NA18953.hp1 NA18962.hp1 NA18969.hp2 NA18971.hp1 NA18983.hp1 NA18993.hp2 NA19000.hp1 NA19079.hp2 NA20805.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1785C>T c.1785C>T	p.Thr595Thr p.Thr595Thr	CEMIP2	ENSG00000135048.14	transcript	ENST00000377044.9	protein_coding	9/24	1954/6152	1785/4152	595/1383	chr9	71730242
chr9:71732387	T T	C C	1	a0006c0033 a0006c0033	1	NA19043.hp2 NA19043.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1527A>G c.1527A>G	p.Gln509Gln p.Gln509Gln	CEMIP2	ENSG00000135048.14	transcript	ENST00000377044.9	protein_coding	7/24	1696/6152	1527/4152	509/1383	chr9	71732387
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chr9:71745293	G G	C C	6	a0002c0002 a0002c0034 a0007c0010 others(3): Show a0002c0002 a0002c0034 a0007c0010 a0011c0020 a0013c0035 a0017c0036	45	HG00140.hp2 HG01099.hp1 HG01123.hp2 others(42): Show HG00140.hp2 HG01099.hp1 HG01123.hp2 HG01358.hp1 HG01361.hp1 HG01934.hp1 HG01943.hp1 HG01975.hp1 HG01981.hp1 HG01993.hp1 HG02074.hp2 HG02148.hp1 HG02148.hp2 HG02300.hp2 HG02818.hp2 HG02896.hp2 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG03704.hp1 HG03831.hp2 HG04204.hp1 HG04228.hp2 NA18747.hp2 NA18944.hp1 NA18952.hp1 NA18961.hp2 NA18964.hp2 NA18970.hp2 NA18975.hp1 NA18977.hp2 NA18983.hp2 NA18989.hp2 NA18992.hp1 NA18997.hp1 NA19000.hp2 NA19001.hp1 NA19005.hp2 NA19009.hp2 NA19011.hp2 NA19055.hp2 NA19057.hp2 NA19068.hp2 NA19088.hp2 NA19089.hp2 NA20805.hp1	synonymous_variant	LOW	c.759C>G c.759C>G	p.Pro253Pro p.Pro253Pro	CEMIP2	ENSG00000135048.14	transcript	ENST00000377044.9	protein_coding	4/24	928/6152	759/4152	253/1383	chr9	71745293
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Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 320)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 13)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 13)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 34)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1385)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)