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chr17:60430957	T T	C C	1	a0001c0001t0001g0064 a0001c0001t0001g0064	1	NA19074.hp2 NA19074.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.626-224T>C c.626-224T>C	CHCT1	ENSG00000141371.13	transcript	ENST00000269127.5	protein_coding	5/5		chr17	60430957
chr17:60430981	C C	G G	1	a0001c0002t0001g0076 a0001c0002t0001g0076	1	HG06807.hp2 HG06807.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.626-200C>G c.626-200C>G	CHCT1	ENSG00000141371.13	transcript	ENST00000269127.5	protein_coding	5/5		chr17	60430981

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer CHCT1_chr17_60417489_60436426

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🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 8)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 1)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 84)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 8)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 8)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 87)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 322)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 5)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 0)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 89)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)