Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr8:1783336	A A	T T	2	a0001c0001t0012 a0001c0001t0034 a0001c0001t0012 a0001c0001t0034	6	HG00639.hp2 HG00733.hp2 HG01346.hp2 others(3): Show HG00639.hp2 HG00733.hp2 HG01346.hp2 HG01515.hp1 HG02486.hp2 NA20805.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2769A>T c.2769A>T	CLN8	ENSG00000182372.10	transcript	ENST00000331222.6	protein_coding	3/3	2769		chr8	1783336
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chr8:1783689	C C	T T	8	a0001c0001t0003 a0001c0001t0018 a0001c0001t0031 others(5): Show a0001c0001t0003 a0001c0001t0018 a0001c0001t0031 a0001c0001t0066 a0001c0001t0076 a0001c0001t0077 a0001c0001t0081 a0001c0001t0082	35	HG00140.hp1 HG00280.hp2 HG00558.hp2 others(32): Show HG00140.hp1 HG00280.hp2 HG00558.hp2 HG00642.hp2 HG00733.hp1 HG00735.hp2 HG01070.hp1 HG01074.hp1 HG01099.hp1 HG01109.hp2 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01192.hp2 HG01361.hp1 HG01433.hp1 HG01516.hp2 HG02040.hp2 HG02071.hp1 HG02083.hp2 HG02523.hp1 HG02602.hp2 HG02698.hp2 HG02738.hp1 HG03490.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp1 HG03710.hp1 HG03834.hp1 HG03942.hp1 HG04199.hp2 NA18947.hp2 NA19079.hp2 NA20752.hp2 NA20805.hp1 NA20905.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3122C>T c.3122C>T	CLN8	ENSG00000182372.10	transcript	ENST00000331222.6	protein_coding	3/3	3122		chr8	1783689
chr8:1783758	G G	A A	1	a0001c0001t0024 a0001c0001t0024	2	HG03130.hp2 HG03225.hp1 HG03130.hp2 HG03225.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3191G>A c.3191G>A	CLN8	ENSG00000182372.10	transcript	ENST00000331222.6	protein_coding	3/3	3191		chr8	1783758
chr8:1783767	G G	T T	1	a0001c0001t0063 a0001c0001t0063	1	HG02970.hp2 HG02970.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3200G>T c.3200G>T	CLN8	ENSG00000182372.10	transcript	ENST00000331222.6	protein_coding	3/3	3200		chr8	1783767
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chr8:1783861	C C	G G	1	a0001c0001t0077 a0001c0001t0077	1	HG01516.hp2 HG01516.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3294C>G c.3294C>G	CLN8	ENSG00000182372.10	transcript	ENST00000331222.6	protein_coding	3/3	3294		chr8	1783861
chr8:1783886	C C	T T	1	a0001c0001t0060 a0001c0001t0060	1	HG02258.hp2 HG02258.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3319C>T c.3319C>T	CLN8	ENSG00000182372.10	transcript	ENST00000331222.6	protein_coding	3/3	3319		chr8	1783886
chr8:1783959	G G	C C	2	a0001c0001t0012 a0001c0001t0034 a0001c0001t0012 a0001c0001t0034	6	HG00639.hp2 HG00733.hp2 HG01346.hp2 others(3): Show HG00639.hp2 HG00733.hp2 HG01346.hp2 HG01515.hp1 HG02486.hp2 NA20805.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3392G>C c.3392G>C	CLN8	ENSG00000182372.10	transcript	ENST00000331222.6	protein_coding	3/3	3392		chr8	1783959
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CLN8_chr8_1758789_1791570 Genic Haplotype Structure on iGV

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Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 8)

Coding Level Haplotype Info (Total: 10)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 101)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 206)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 413)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 8)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 2)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 126)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 231)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)