Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr18:36177115	T T	G G	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2474T>G c.2474T>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2474		chr18	36177115
chr18:36177118	A A	G G	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2477A>G c.2477A>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2477		chr18	36177118
chr18:36177120	T T	A A	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2479T>A c.2479T>A	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2479		chr18	36177120
chr18:36177122	C C	G G	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2481C>G c.2481C>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2481		chr18	36177122
chr18:36177125	A A	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2484A>T c.2484A>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2484		chr18	36177125
chr18:36177128	A A	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2487A>C c.2487A>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2487		chr18	36177128
chr18:36177129	A A	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2488A>C c.2488A>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2488		chr18	36177129
chr18:36177132	A A	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2491A>C c.2491A>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2491		chr18	36177132
chr18:36177134	G G	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2493G>C c.2493G>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2493		chr18	36177134
chr18:36177136	T T	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2495T>C c.2495T>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2495		chr18	36177136
chr18:36177137	G G	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2496G>T c.2496G>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2496		chr18	36177137
chr18:36177138	G G	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2497G>T c.2497G>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2497		chr18	36177138
chr18:36177147	A A	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2506A>C c.2506A>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2506		chr18	36177147
chr18:36177148	C C	T T	1	a0001c0001t0063 a0001c0001t0063	1	HG02523.hp2 HG02523.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2507C>T c.2507C>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2507		chr18	36177148
chr18:36177149	G G	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2508G>C c.2508G>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2508		chr18	36177149
chr18:36177150	G G	A A	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2509G>A c.2509G>A	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2509		chr18	36177150
chr18:36177153	A A	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2512A>C c.2512A>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2512		chr18	36177153
chr18:36177155	A A	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2514A>T c.2514A>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2514		chr18	36177155
chr18:36177165	A A	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2524A>T c.2524A>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2524		chr18	36177165
chr18:36177168	A A	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2527A>C c.2527A>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2527		chr18	36177168
chr18:36177169	A A	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2528A>T c.2528A>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2528		chr18	36177169
chr18:36177177	C C	G G	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2536C>G c.2536C>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2536		chr18	36177177
chr18:36177182	A A	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2541A>C c.2541A>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2541		chr18	36177182
chr18:36177184	A A	G G	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2543A>G c.2543A>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2543		chr18	36177184
chr18:36177185	T T	G G	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2544T>G c.2544T>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2544		chr18	36177185
chr18:36177194	T T	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2553T>C c.2553T>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2553		chr18	36177194
chr18:36177196	GT GT	G G	33	a0001c0001t0003 a0002c0002t0003 a0002c0002t0007 others(30): Show a0001c0001t0003 a0002c0002t0003 a0002c0002t0007 a0002c0002t0008 a0002c0002t0020 a0002c0002t0023 a0002c0002t0024 a0002c0002t0025 a0002c0002t0075 a0002c0002t0076 a0002c0002t0077 a0002c0002t0078 a0002c0002t0079 a0002c0002t0080 a0002c0002t0081 a0002c0002t0082 a0002c0002t0083 a0002c0002t0084 a0002c0002t0085 a0002c0002t0086 a0002c0002t0087 a0002c0002t0088 a0002c0002t0089 a0004c0004t0009 a0004c0004t0016 a0004c0004t0027 a0004c0004t0041 a0004c0004t0042 a0004c0004t0043 a0007c0005t0009 a0007c0005t0027 a0011c0016t0052 a0014c0017t0003	104	HG00099.hp1 HG00280.hp2 HG00621.hp1 others(101): Show HG00099.hp1 HG00280.hp2 HG00621.hp1 HG00642.hp1 HG00733.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp2 HG01069.hp1 HG01070.hp2 HG01099.hp1 HG01106.hp1 HG01109.hp1 HG01123.hp1 HG01168.hp2 HG01192.hp1 HG01243.hp2 HG01255.hp2 HG01257.hp2 HG01261.hp1 HG01433.hp1 HG01496.hp1 HG01496.hp2 HG01516.hp1 HG01891.hp1 HG01891.hp2 HG01928.hp1 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG02071.hp1 HG02074.hp2 HG02109.hp1 HG02132.hp1 HG02258.hp2 HG02273.hp2 HG02300.hp2 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02559.hp1 HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02717.hp1 HG02723.hp2 HG02818.hp1 HG02818.hp2 HG02886.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG02965.hp2 HG02976.hp1 HG03130.hp2 HG03195.hp1 HG03209.hp1 HG03471.hp2 HG03490.hp1 HG03491.hp1 HG03579.hp1 HG03669.hp1 HG03710.hp2 HG04184.hp2 HG04199.hp2 HG04204.hp1 HG06807.hp1 NA18942.hp2 NA18943.hp1 NA18949.hp2 NA18950.hp1 NA18952.hp1 NA18955.hp1 NA18957.hp1 NA18962.hp1 NA18964.hp2 NA18965.hp2 NA18970.hp1 NA18979.hp1 NA18980.hp2 NA18982.hp2 NA18985.hp2 NA18987.hp2 NA18988.hp2 NA18991.hp2 NA18994.hp2 NA18995.hp2 NA18999.hp1 NA19010.hp1 NA19010.hp2 NA19011.hp1 NA19055.hp2 NA19056.hp1 NA19058.hp1 NA19067.hp1 NA19068.hp1 NA19076.hp2 NA19077.hp1 NA19080.hp2 NA19082.hp2 NA19086.hp1 NA19089.hp1 NA19091.hp2 NA19240.hp1 NA21309.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2560delT c.2560delT	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2560	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr18	36177196
chr18:36177197	T T	A A	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2556T>A c.2556T>A	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2556		chr18	36177197
chr18:36177202	G G	A A	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2561G>A c.2561G>A	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2561		chr18	36177202
chr18:36177203	T T	G G	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2562T>G c.2562T>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2562		chr18	36177203
chr18:36177204	A A	G G	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2563A>G c.2563A>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2563		chr18	36177204
chr18:36177207	C C	A A	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2566C>A c.2566C>A	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2566		chr18	36177207
chr18:36177209	C C	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2568C>T c.2568C>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2568		chr18	36177209
chr18:36177210	A A	G G	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2569A>G c.2569A>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2569		chr18	36177210
chr18:36177213	C C	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2572C>T c.2572C>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2572		chr18	36177213
chr18:36177216	A A	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2575A>T c.2575A>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2575		chr18	36177216
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chr18:36177219	G G	A A	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2578G>A c.2578G>A	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2578		chr18	36177219
chr18:36177222	C C	G G	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2581C>G c.2581C>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2581		chr18	36177222
chr18:36177223	C C	A A	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2582C>A c.2582C>A	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2582		chr18	36177223
chr18:36177231	A A	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2590A>C c.2590A>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2590		chr18	36177231
chr18:36177237	G G	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2596G>T c.2596G>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2596		chr18	36177237
chr18:36177238	C C	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2597C>T c.2597C>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2597		chr18	36177238
chr18:36177240	A A	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2599A>C c.2599A>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2599		chr18	36177240
chr18:36177243	A A	C C	1	a0005c0006t0040 a0005c0006t0040	1	HG03579.hp2 HG03579.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2602A>C c.2602A>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2602		chr18	36177243
chr18:36177246	T T	A A	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2605T>A c.2605T>A	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2605		chr18	36177246
chr18:36177247	G G	C C	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2606G>C c.2606G>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2606		chr18	36177247
chr18:36177248	G G	T T	1	a0001c0001t0072 a0001c0001t0072	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2607G>T c.2607G>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2607		chr18	36177248
chr18:36177295	A A	G G	1	a0002c0002t0086 a0002c0002t0086	1	NA19010.hp2 NA19010.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2654A>G c.2654A>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2654		chr18	36177295
chr18:36177397	C C	G G	4	a0001c0001t0005 a0001c0001t0010 a0001c0001t0022 others(1): Show a0001c0001t0005 a0001c0001t0010 a0001c0001t0022 a0001c0001t0030	32	HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00544.hp1 others(29): Show HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00544.hp1 HG00558.hp1 HG00609.hp2 HG02080.hp2 HG02129.hp2 HG03490.hp2 NA18612.hp2 NA18940.hp1 NA18941.hp1 NA18945.hp1 NA18949.hp1 NA18951.hp2 NA18953.hp2 NA18959.hp2 NA18965.hp1 NA18968.hp1 NA18983.hp2 NA18985.hp1 NA18991.hp1 NA18999.hp2 NA19001.hp1 NA19002.hp2 NA19003.hp2 NA19005.hp1 NA19012.hp1 NA19068.hp2 NA19070.hp1 NA19078.hp1 NA19090.hp1 NA21309.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2756C>G c.2756C>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2756		chr18	36177397
chr18:36177428	C C	G G	1	a0001c0001t0062 a0001c0001t0062	1	HG02071.hp2 HG02071.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2787C>G c.2787C>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2787		chr18	36177428
chr18:36177468	A A	G G	1	a0001c0001t0074 a0001c0001t0074	1	HG02486.hp2 HG02486.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2827A>G c.2827A>G	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	2827		chr18	36177468
chr18:36178073	A A	T T	1	a0001c0001t0061 a0001c0001t0061	1	HG01175.hp1 HG01175.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3432A>T c.3432A>T	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	3432		chr18	36178073
chr18:36178117	T T	C C	5	a0001c0001t0034 a0001c0001t0035 a0001c0001t0074 others(2): Show a0001c0001t0034 a0001c0001t0035 a0001c0001t0074 a0002c0002t0075 a0011c0016t0052	5	HG02055.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp2 others(2): Show HG02055.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp2 HG02895.hp1 NA21309.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3476T>C c.3476T>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	3476		chr18	36178117
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chr18:36178163	G G	A A	2	a0001c0001t0044 a0001c0001t0053 a0001c0001t0044 a0001c0001t0053	2	HG00609.hp1 NA19086.hp2 HG00609.hp1 NA19086.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3522G>A c.3522G>A	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	3522		chr18	36178163
chr18:36178308	T T	C C	1	a0001c0001t0061 a0001c0001t0061	1	HG01175.hp1 HG01175.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3667T>C c.3667T>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	3667		chr18	36178308
chr18:36178436	T T	C C	1	a0001c0001t0074 a0001c0001t0074	1	HG02486.hp2 HG02486.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3795T>C c.3795T>C	ELP2	ENSG00000134759.14	transcript	ENST00000358232.11	protein_coding	22/22	3795		chr18	36178436
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ELP2_chr18_36124899_36185557 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 15)

Coding Level Haplotype Info (Total: 18)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 104)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 363)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 378)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 15)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 128)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 583)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)