Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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	chr1:92063259	A A	T T	1	a0001c0003 a0001c0003	1	HG01109.hp2 HG01109.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1062A>T c.1062A>T	p.Leu354Leu p.Leu354Leu	EPHX4	ENSG00000172031.7	transcript	ENST00000370383.5	protein_coding	7/7	1157/1436	1062/1089	354/362			chr1	92063259

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	chr1:92030069	G G	A A	1	a0001c0001t0003 a0001c0001t0003	1	HG02056.hp1 HG02056.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-11G>A c.-11G>A		EPHX4	ENSG00000172031.7	transcript	ENST00000370383.5	protein_coding	1/7				11		chr1	92030069
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chr1:92062442	A A	T T	7	a0001c0001t0001g0096 a0001c0001t0001g0102 a0001c0001t0001g0103 others(4): Show a0001c0001t0001g0096 a0001c0001t0001g0102 a0001c0001t0001g0103 a0001c0001t0001g0104 a0001c0001t0001g0158 a0001c0001t0001g0189 a0001c0001t0001g0194	7	HG02055.hp2 HG02559.hp1 HG02615.hp1 others(4): Show HG02055.hp2 HG02559.hp1 HG02615.hp1 HG02717.hp1 HG02922.hp2 HG03486.hp2 NA21309.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.858-613A>T c.858-613A>T	EPHX4	ENSG00000172031.7	transcript	ENST00000370383.5	protein_coding	6/6		chr1	92062442
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chr1:92062584	CA CA	C C	28	a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0044 others(25): Show a0001c0001t0001g0014 a0001c0001t0001g0019 a0001c0001t0001g0044 a0001c0001t0001g0057 a0001c0001t0001g0058 a0001c0001t0001g0066 a0001c0001t0001g0069 a0001c0001t0001g0093 a0001c0001t0001g0100 a0001c0001t0001g0127 a0001c0001t0001g0129 a0001c0001t0001g0132 a0001c0001t0001g0151 a0001c0001t0001g0154 a0001c0001t0001g0157 a0001c0001t0001g0166 a0001c0001t0001g0171 a0001c0001t0001g0172 a0001c0001t0001g0173 a0001c0001t0001g0175 a0001c0001t0002g0124 a0001c0001t0002g0190 a0001c0001t0002g0198 a0001c0001t0002g0200 a0001c0001t0002g0201 a0001c0001t0002g0202 a0001c0001t0002g0203 a0001c0001t0002g0204	29	HG00140.hp1 HG01069.hp1 HG01069.hp2 others(26): Show HG00140.hp1 HG01069.hp1 HG01069.hp2 HG01070.hp2 HG01081.hp2 HG01168.hp1 HG01884.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp1 HG02109.hp1 HG02109.hp2 HG02145.hp1 HG02280.hp1 HG02486.hp1 HG02630.hp1 HG02818.hp2 HG02895.hp2 HG02897.hp2 HG02976.hp2 HG03041.hp2 HG03130.hp2 HG03139.hp1 HG03209.hp2 HG03239.hp2 HG03471.hp2 HG03540.hp1 NA19240.hp1 NA20300.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.858-445delA c.858-445delA	EPHX4	ENSG00000172031.7	transcript	ENST00000370383.5	protein_coding	6/6	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr1	92062584
chr1:92062869	G G	A A	1	a0001c0001t0001g0114 a0001c0001t0001g0114	1	HG01358.hp1 HG01358.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.858-186G>A c.858-186G>A	EPHX4	ENSG00000172031.7	transcript	ENST00000370383.5	protein_coding	6/6		chr1	92062869

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EPHX4_chr1_92024985_92068538 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

Coding Level Haplotype Info (Total: 4)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 6)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 206)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 236)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 2)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 2)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 304)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)