Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr2:206795811	G G	A A	9	a0001c0001t0007 a0001c0001t0016 a0001c0001t0034 others(6): Show a0001c0001t0007 a0001c0001t0016 a0001c0001t0034 a0001c0001t0050 a0001c0001t0064 a0001c0001t0066 a0001c0001t0077 a0005c0005t0043 a0005c0005t0044	29	HG01109.hp1 HG01175.hp2 HG01261.hp1 others(26): Show HG01109.hp1 HG01175.hp2 HG01261.hp1 HG02129.hp1 HG02630.hp2 HG02809.hp2 HG02886.hp2 HG02896.hp2 HG03098.hp2 HG03239.hp1 HG03704.hp2 NA18612.hp2 NA18955.hp2 NA18956.hp1 NA18965.hp1 NA18971.hp1 NA18998.hp1 NA18999.hp1 NA18999.hp2 NA19011.hp1 NA19054.hp2 NA19055.hp2 NA19057.hp2 NA19063.hp1 NA19064.hp1 NA19066.hp1 NA19067.hp1 NA19075.hp1 NA19078.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4009G>A c.4009G>A	FASTKD2	ENSG00000118246.14	transcript	ENST00000402774.8	protein_coding	12/12	4009		chr2	206795811
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chr2:206796003	C C	T T	1	a0002c0002t0047 a0002c0002t0047	1	HG02027.hp1 HG02027.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4201C>T c.4201C>T	FASTKD2	ENSG00000118246.14	transcript	ENST00000402774.8	protein_coding	12/12	4201		chr2	206796003
chr2:206796062	C C	T T	1	a0003c0003t0087 a0003c0003t0087	1	HG02572.hp2 HG02572.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4260C>T c.4260C>T	FASTKD2	ENSG00000118246.14	transcript	ENST00000402774.8	protein_coding	12/12	4260		chr2	206796062
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chr2:206791270	C C	T T	1	a0001c0001t0004g0115 a0001c0001t0004g0115	1	HG02622.hp1 HG02622.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.2014-413C>T c.2014-413C>T	FASTKD2	ENSG00000118246.14	transcript	ENST00000402774.8	protein_coding	11/11		chr2	206791270
chr2:206791294	C C	T T	1	a0001c0001t0001g0192 a0001c0001t0001g0192	1	HG01358.hp2 HG01358.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.2014-389C>T c.2014-389C>T	FASTKD2	ENSG00000118246.14	transcript	ENST00000402774.8	protein_coding	11/11		chr2	206791294
chr2:206791352	A A	T T	5	a0001c0001t0021g0041 a0001c0001t0021g0174 a0001c0001t0021g0175 others(2): Show a0001c0001t0021g0041 a0001c0001t0021g0174 a0001c0001t0021g0175 a0001c0001t0059g0041 a0001c0001t0061g0231	5	HG01069.hp1 HG03041.hp1 HG03195.hp2 others(2): Show HG01069.hp1 HG03041.hp1 HG03195.hp2 HG03486.hp2 HG03579.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.2014-331A>T c.2014-331A>T	FASTKD2	ENSG00000118246.14	transcript	ENST00000402774.8	protein_coding	11/11		chr2	206791352
chr2:206791396	T T	C C	1	a0001c0001t0005g0141 a0001c0001t0005g0141	1	HG03654.hp1 HG03654.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.2014-287T>C c.2014-287T>C	FASTKD2	ENSG00000118246.14	transcript	ENST00000402774.8	protein_coding	11/11		chr2	206791396

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FASTKD2_chr2_206760606_206801189 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 5)

Coding Level Haplotype Info (Total: 9)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 104)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 298)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 394)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 4)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 69)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 314)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)