Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr12:1566802	T T	A A	1	a0001c0006 a0001c0006	2	HG03130.hp2 HG03225.hp1 HG03130.hp2 HG03225.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1203A>T c.1203A>T	p.Arg401Arg p.Arg401Arg	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	2/2	1718/2527	1203/1257	401/418	chr12	1566802
chr12:1593053	T T	C C	1	a0001c0005 a0001c0005	8	NA18943.hp1 NA18973.hp1 NA19000.hp1 others(5): Show NA18943.hp1 NA18973.hp1 NA19000.hp1 NA19007.hp1 NA19062.hp1 NA19081.hp1 NA19085.hp2 NA19088.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1014A>G c.1014A>G	p.Gly338Gly p.Gly338Gly	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	1/2	1529/2527	1014/1257	338/418	chr12	1593053
chr12:1593383	C C	G G	2	a0001c0003 a0001c0006 a0001c0003 a0001c0006	17	HG01081.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp2 others(14): Show HG01081.hp2 HG01891.hp2 HG02055.hp2 HG02559.hp1 HG02622.hp2 HG02717.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp2 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG03130.hp2 HG03225.hp1 HG03471.hp1 HG03540.hp1 HG03710.hp2 HG06807.hp2 NA18906.hp2	synonymous_variant	LOW	c.684G>C c.684G>C	p.Thr228Thr p.Thr228Thr	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	1/2	1199/2527	684/1257	228/418	chr12	1593383
chr12:1593395	G G	A A	2	a0001c0002 a0001c0007 a0001c0002 a0001c0007	33	HG00621.hp1 HG01884.hp2 HG02040.hp1 others(30): Show HG00621.hp1 HG01884.hp2 HG02040.hp1 HG02145.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02559.hp2 HG02572.hp1 HG02572.hp2 HG02622.hp1 HG02630.hp1 HG02647.hp2 HG02717.hp2 HG02809.hp1 HG03041.hp2 HG03239.hp2 HG03516.hp1 HG03540.hp2 NA18945.hp1 NA18953.hp2 NA18966.hp1 NA18968.hp2 NA18970.hp2 NA18995.hp1 NA19003.hp1 NA19004.hp2 NA19007.hp2 NA19010.hp2 NA19043.hp1 NA19064.hp1 NA19068.hp2 NA19080.hp2 NA20129.hp2	synonymous_variant	LOW	c.672C>T c.672C>T	p.Ser224Ser p.Ser224Ser	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	1/2	1187/2527	672/1257	224/418	chr12	1593395
chr12:1593689	G G	A A	1	a0001c0007 a0001c0007	1	HG02572.hp2 HG02572.hp2	synonymous_variant	LOW	c.378C>T c.378C>T	p.Leu126Leu p.Leu126Leu	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	1/2	893/2527	378/1257	126/418	chr12	1593689
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chr12:1566146	C C	T T	1	a0001c0004t0027 a0001c0004t0027	1	NA18975.hp2 NA18975.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.602G>A c.602G>A	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	2/2	602	chr12	1566146
chr12:1566195	C C	G G	1	a0001c0003t0029 a0001c0003t0029	1	HG03540.hp1 HG03540.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.553G>C c.553G>C	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	2/2	553	chr12	1566195
chr12:1566211	G G	A A	1	a0001c0004t0037 a0001c0004t0037	1	HG02165.hp1 HG02165.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.537C>T c.537C>T	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	2/2	537	chr12	1566211
chr12:1566370	G G	T T	5	a0001c0001t0007 a0001c0001t0033 a0001c0001t0038 others(2): Show a0001c0001t0007 a0001c0001t0033 a0001c0001t0038 a0001c0002t0026 a0001c0004t0028	18	HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00323.hp2 others(15): Show HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00323.hp2 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG01433.hp2 HG01516.hp1 HG01517.hp2 HG01943.hp1 HG01943.hp2 HG02004.hp2 HG02273.hp1 HG02486.hp1 HG02738.hp1 HG03669.hp2 HG03688.hp1 HG03831.hp2 HG04204.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.378C>A c.378C>A	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	2/2	378	chr12	1566370
chr12:1566463	A A	G G	9	a0001c0001t0004 a0001c0001t0008 a0001c0001t0017 others(6): Show a0001c0001t0004 a0001c0001t0008 a0001c0001t0017 a0001c0002t0004 a0001c0002t0012 a0001c0002t0024 a0001c0002t0034 a0001c0003t0004 a0001c0005t0036	60	HG00423.hp1 HG00423.hp2 HG00438.hp1 others(57): Show HG00423.hp1 HG00423.hp2 HG00438.hp1 HG00609.hp1 HG01081.hp2 HG02083.hp1 HG02083.hp2 HG02129.hp1 HG02132.hp1 HG02145.hp1 HG02155.hp1 HG02155.hp2 HG02280.hp1 HG02523.hp2 HG03540.hp2 HG03834.hp1 NA18747.hp1 NA18747.hp2 NA18940.hp2 NA18943.hp2 NA18944.hp1 NA18947.hp2 NA18948.hp1 NA18948.hp2 NA18950.hp2 NA18951.hp2 NA18952.hp1 NA18955.hp2 NA18961.hp2 NA18969.hp1 NA18986.hp2 NA18991.hp2 NA18995.hp1 NA18998.hp2 NA19003.hp1 NA19004.hp2 NA19010.hp1 NA19010.hp2 NA19011.hp1 NA19030.hp1 NA19054.hp1 NA19054.hp2 NA19056.hp1 NA19057.hp2 NA19060.hp2 NA19063.hp1 NA19064.hp1 NA19064.hp2 NA19065.hp2 NA19068.hp2 NA19070.hp1 NA19070.hp2 NA19074.hp2 NA19079.hp1 NA19079.hp2 NA19080.hp2 NA19081.hp2 NA19083.hp2 NA19085.hp2 NA19087.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.285T>C c.285T>C	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	2/2	285	chr12	1566463
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chr12:1566643	A A	G G	3	a0001c0001t0016 a0001c0002t0016 a0001c0002t0018 a0001c0001t0016 a0001c0002t0016 a0001c0002t0018	5	HG02451.hp2 HG02647.hp2 HG02717.hp2 others(2): Show HG02451.hp2 HG02647.hp2 HG02717.hp2 HG02970.hp2 NA19043.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.105T>C c.105T>C	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	2/2	105	chr12	1566643
chr12:1566681	G G	A A	9	a0001c0001t0003 a0001c0001t0009 a0001c0001t0013 others(6): Show a0001c0001t0003 a0001c0001t0009 a0001c0001t0013 a0001c0001t0016 a0001c0002t0016 a0001c0002t0018 a0001c0002t0034 a0001c0003t0003 a0001c0003t0015	63	HG00735.hp2 HG00741.hp2 HG01074.hp1 others(60): Show HG00735.hp2 HG00741.hp2 HG01074.hp1 HG01099.hp1 HG01106.hp1 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01175.hp2 HG01243.hp1 HG01257.hp1 HG01258.hp1 HG01358.hp1 HG01358.hp2 HG01496.hp2 HG01884.hp1 HG01891.hp2 HG01934.hp1 HG01978.hp2 HG01993.hp1 HG01993.hp2 HG02027.hp1 HG02027.hp2 HG02055.hp2 HG02109.hp2 HG02451.hp2 HG02486.hp2 HG02622.hp2 HG02630.hp2 HG02647.hp2 HG02717.hp1 HG02717.hp2 HG02735.hp2 HG02895.hp2 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG02922.hp2 HG02970.hp2 HG03139.hp2 HG03195.hp2 HG03209.hp1 HG03490.hp1 HG03492.hp2 HG03540.hp2 HG03579.hp1 HG03710.hp1 HG04199.hp2 HG04228.hp2 NA18522.hp1 NA18522.hp2 NA18906.hp2 NA18941.hp1 NA18961.hp1 NA18964.hp2 NA18972.hp1 NA18974.hp1 NA18975.hp1 NA19030.hp2 NA19043.hp1 NA19057.hp1 NA19065.hp1 NA19088.hp2 NA20752.hp1 NA20805.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.67C>T c.67C>T	FBXL14	ENSG00000171823.7	transcript	ENST00000339235.4	protein_coding	2/2	67	chr12	1566681
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FBXL14_chr12_1560993_1599581 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

Coding Level Haplotype Info (Total: 8)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 54)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 398)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 418)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 6)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 27)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 596)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)