Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr8:450034	C C	T T	1	a0001c0009 a0001c0009	1	NA19080.hp1 NA19080.hp1	synonymous_variant	LOW	c.426C>T c.426C>T	p.Gly142Gly p.Gly142Gly	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	6/10	542/10356	426/1077	142/358	chr8	450034
chr8:451330	C C	T T	1	a0001c0008 a0001c0008	1	HG03041.hp1 HG03041.hp1	synonymous_variant	LOW	c.537C>T c.537C>T	p.Thr179Thr p.Thr179Thr	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	7/10	653/10356	537/1077	179/358	chr8	451330
chr8:468768	G G	A A	1	a0001c0008 a0001c0008	1	HG03041.hp1 HG03041.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1041G>A c.1041G>A	p.Val347Val p.Val347Val	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	1157/10356	1041/1077	347/358	chr8	468768

chr:pos	ref	alt	# # of thapid:transcript level	thapids	# # of haplotypeids	haplotypeids	annotation	impact	hgvs_c	genename	geneid	featuretype	featureid	transcript_biotype	rank	distance	status	chr	pos
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chr8:468825	A A	G G	1	a0002c0002t0139 a0002c0002t0139	1	HG03669.hp1 HG03669.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.21A>G c.21A>G	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	21		chr8	468825
chr8:468833	T T	C C	1	a0004c0006t0030 a0004c0006t0030	2	HG02129.hp1 NA19090.hp2 HG02129.hp1 NA19090.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.29T>C c.29T>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	29		chr8	468833
chr8:468863	T T	C C	4	a0001c0001t0021 a0001c0001t0050 a0001c0001t0051 others(1): Show a0001c0001t0021 a0001c0001t0050 a0001c0001t0051 a0001c0001t0052	6	HG02145.hp2 HG02257.hp1 HG02572.hp1 others(3): Show HG02145.hp2 HG02257.hp1 HG02572.hp1 HG02723.hp2 HG02895.hp2 HG03195.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.59T>C c.59T>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	59		chr8	468863
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chr8:468951	G G	A A	1	a0001c0001t0054 a0001c0001t0054	1	NA20300.hp2 NA20300.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.147G>A c.147G>A	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	147		chr8	468951
chr8:468991	A A	C C	1	a0001c0001t0138 a0001c0001t0138	1	HG04228.hp1 HG04228.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.187A>C c.187A>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	187		chr8	468991
chr8:468993	G G	C C	32	a0001c0001t0006 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 others(29): Show a0001c0001t0006 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0015 a0001c0001t0016 a0001c0001t0021 a0001c0001t0022 a0001c0001t0031 a0001c0001t0032 a0001c0001t0033 a0001c0001t0035 a0001c0001t0050 a0001c0001t0051 a0001c0001t0053 a0001c0001t0055 a0001c0001t0056 a0001c0001t0059 a0001c0001t0060 a0001c0001t0062 a0001c0001t0064 a0001c0001t0065 a0001c0001t0066 a0001c0001t0067 a0001c0001t0068 a0001c0001t0069 a0002c0002t0016 a0002c0002t0058 a0003c0003t0034 a0003c0003t0036 a0003c0003t0057 a0003c0003t0061 a0003c0003t0063	66	HG00280.hp1 HG00323.hp1 HG00597.hp1 others(63): Show HG00280.hp1 HG00323.hp1 HG00597.hp1 HG00597.hp2 HG01069.hp2 HG01071.hp2 HG01081.hp2 HG01123.hp1 HG01168.hp1 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01433.hp1 HG01433.hp2 HG01496.hp2 HG01884.hp1 HG01934.hp1 HG02040.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp1 HG02071.hp2 HG02145.hp2 HG02257.hp1 HG02258.hp2 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02559.hp1 HG02572.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp2 HG02630.hp1 HG02723.hp2 HG02735.hp2 HG02809.hp1 HG02809.hp2 HG02818.hp2 HG02895.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp2 HG02897.hp1 HG02897.hp2 HG03139.hp1 HG03209.hp1 HG03225.hp2 HG03239.hp2 HG03486.hp2 HG03491.hp2 HG03492.hp1 HG03516.hp1 HG03540.hp1 HG03704.hp2 NA18612.hp2 NA18943.hp1 NA18953.hp2 NA18956.hp1 NA18965.hp2 NA19003.hp2 NA19011.hp2 NA19056.hp2 NA19058.hp1 NA19063.hp1 NA19065.hp1 NA19072.hp1 NA20129.hp2 NA20300.hp1 NA20752.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.189G>C c.189G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	189		chr8	468993
chr8:469052	C C	T T	2	a0002c0002t0004 a0004c0004t0004 a0002c0002t0004 a0004c0004t0004	14	HG02027.hp2 HG02155.hp1 HG02523.hp1 others(11): Show HG02027.hp2 HG02155.hp1 HG02523.hp1 NA18747.hp2 NA18939.hp1 NA18952.hp1 NA18962.hp1 NA18991.hp2 NA19012.hp2 NA19064.hp2 NA19072.hp2 NA19084.hp1 NA19085.hp1 NA19090.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.248C>T c.248C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	248		chr8	469052
chr8:469055	A A	ACT ACT	27	a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0011 others(24): Show a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0011 a0001c0001t0028 a0001c0001t0047 a0001c0001t0117 a0001c0001t0118 a0001c0001t0120 a0001c0001t0121 a0001c0001t0122 a0001c0001t0123 a0001c0001t0124 a0001c0001t0125 a0001c0001t0126 a0001c0001t0127 a0001c0001t0138 a0001c0009t0008 a0002c0002t0007 a0002c0002t0019 a0002c0002t0115 a0002c0002t0116 a0002c0002t0128 a0003c0003t0011 a0003c0003t0045 a0003c0003t0046 a0003c0003t0119 a0003c0003t0129	59	HG00423.hp2 HG00438.hp2 HG00621.hp1 others(56): Show HG00423.hp2 HG00438.hp2 HG00621.hp1 HG01123.hp2 HG01243.hp1 HG01257.hp2 HG01258.hp2 HG01361.hp1 HG01943.hp2 HG02071.hp1 HG02109.hp1 HG02145.hp1 HG02293.hp1 HG02572.hp2 HG02602.hp1 HG02717.hp2 HG02735.hp1 HG02738.hp1 HG02738.hp2 HG03017.hp1 HG03017.hp2 HG03688.hp1 HG03831.hp1 HG03831.hp2 HG04199.hp2 HG04204.hp1 HG04228.hp1 NA18612.hp1 NA18940.hp2 NA18941.hp1 NA18944.hp2 NA18945.hp2 NA18959.hp1 NA18961.hp1 NA18972.hp1 NA18974.hp2 NA18975.hp2 NA18977.hp2 NA18978.hp1 NA18978.hp2 NA18979.hp2 NA18981.hp2 NA18982.hp1 NA18983.hp1 NA18988.hp2 NA18995.hp1 NA19002.hp2 NA19004.hp1 NA19006.hp2 NA19011.hp1 NA19068.hp2 NA19077.hp2 NA19080.hp1 NA19081.hp1 NA19081.hp2 NA19086.hp1 NA20129.hp1 NA20805.hp1 NA21309.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.262_263dupCT c.262_263dupCT	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	264	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr8	469055
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chr8:469066	C C	CTG CTG	16	a0001c0001t0021 a0001c0001t0029 a0001c0001t0048 others(13): Show a0001c0001t0021 a0001c0001t0029 a0001c0001t0048 a0001c0001t0049 a0001c0001t0050 a0001c0001t0051 a0001c0001t0054 a0001c0001t0130 a0001c0001t0131 a0001c0001t0134 a0001c0001t0136 a0001c0001t0137 a0001c0008t0132 a0003c0003t0020 a0003c0003t0133 a0003c0003t0135	25	HG01952.hp2 HG02145.hp2 HG02257.hp1 others(22): Show HG01952.hp2 HG02145.hp2 HG02257.hp1 HG02280.hp2 HG02572.hp1 HG02615.hp1 HG02622.hp1 HG02723.hp2 HG02818.hp1 HG02886.hp1 HG02895.hp2 HG02922.hp1 HG02922.hp2 HG02965.hp1 HG02970.hp2 HG03041.hp1 HG03130.hp1 HG03139.hp2 HG03225.hp1 HG03471.hp2 HG03516.hp2 HG03579.hp1 HG06807.hp1 NA20300.hp2 NA21309.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.263_264insGT c.263_264insGT	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	264	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr8	469066
chr8:469131	C C	T T	1	a0001c0001t0110 a0001c0001t0110	1	NA19087.hp2 NA19087.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.327C>T c.327C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	327		chr8	469131
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chr8:470691	A A	G G	1	a0001c0001t0108 a0001c0001t0108	1	NA18979.hp1 NA18979.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1887A>G c.1887A>G	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	1887		chr8	470691
chr8:470724	T T	A A	1	a0002c0002t0073 a0002c0002t0073	1	HG03710.hp1 HG03710.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1920T>A c.1920T>A	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	1920		chr8	470724
chr8:470823	T T	C C	1	a0001c0008t0132 a0001c0008t0132	1	HG03041.hp1 HG03041.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2019T>C c.2019T>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2019		chr8	470823
chr8:470826	C C	T T	1	a0001c0001t0137 a0001c0001t0137	1	HG02922.hp2 HG02922.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2022C>T c.2022C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2022		chr8	470826
chr8:470830	A A	G G	2	a0001c0001t0134 a0003c0003t0135 a0001c0001t0134 a0003c0003t0135	2	HG06807.hp1 NA21309.hp1 HG06807.hp1 NA21309.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2026A>G c.2026A>G	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2026		chr8	470830
chr8:471023	A A	G G	1	a0001c0001t0064 a0001c0001t0064	1	NA19063.hp1 NA19063.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2219A>G c.2219A>G	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2219		chr8	471023
chr8:471069	T T	C C	1	a0003c0003t0084 a0003c0003t0084	1	NA19054.hp1 NA19054.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2265T>C c.2265T>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2265		chr8	471069
chr8:471243	G G	C C	2	a0001c0001t0037 a0001c0001t0038 a0001c0001t0037 a0001c0001t0038	4	HG01081.hp1 HG03041.hp2 HG03195.hp1 others(1): Show HG01081.hp1 HG03041.hp2 HG03195.hp1 NA19043.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2439G>C c.2439G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2439		chr8	471243
chr8:471303	G G	C C	1	a0003c0003t0119 a0003c0003t0119	1	NA19002.hp2 NA19002.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2499G>C c.2499G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2499		chr8	471303
chr8:471314	G G	C C	1	a0001c0008t0132 a0001c0008t0132	1	HG03041.hp1 HG03041.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2510G>C c.2510G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2510		chr8	471314
chr8:471349	G G	A A	1	a0001c0001t0028 a0001c0001t0028	3	HG02109.hp1 HG02572.hp2 NA20129.hp1 HG02109.hp1 HG02572.hp2 NA20129.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2545G>A c.2545G>A	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2545		chr8	471349
chr8:471353	G G	C C	1	a0003c0003t0085 a0003c0003t0085	1	NA19086.hp2 NA19086.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2549G>C c.2549G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2549		chr8	471353
chr8:471358	A A	C C	3	a0002c0002t0128 a0003c0003t0046 a0003c0003t0129 a0002c0002t0128 a0003c0003t0046 a0003c0003t0129	4	HG01943.hp2 HG02293.hp1 HG02602.hp1 others(1): Show HG01943.hp2 HG02293.hp1 HG02602.hp1 HG02738.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2554A>C c.2554A>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2554		chr8	471358
chr8:471361	C C	T T	1	a0001c0001t0022 a0001c0001t0022	3	HG03491.hp2 HG03492.hp1 NA19072.hp1 HG03491.hp2 HG03492.hp1 NA19072.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2557C>T c.2557C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2557		chr8	471361
chr8:471370	G G	C C	5	a0001c0001t0037 a0001c0001t0038 a0001c0001t0049 others(2): Show a0001c0001t0037 a0001c0001t0038 a0001c0001t0049 a0001c0001t0130 a0001c0008t0132	8	HG01081.hp1 HG02622.hp1 HG02818.hp1 others(5): Show HG01081.hp1 HG02622.hp1 HG02818.hp1 HG02965.hp1 HG03041.hp1 HG03041.hp2 HG03195.hp1 NA19043.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2566G>C c.2566G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2566		chr8	471370
chr8:471372	T T	C C	1	a0001c0001t0077 a0001c0001t0077	1	HG02630.hp2 HG02630.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2568T>C c.2568T>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2568		chr8	471372
chr8:471507	G G	C C	1	a0001c0001t0064 a0001c0001t0064	1	NA19063.hp1 NA19063.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2703G>C c.2703G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2703		chr8	471507
chr8:471561	C C	T T	1	a0002c0002t0076 a0002c0002t0076	1	HG01256.hp1 HG01256.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2757C>T c.2757C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2757		chr8	471561
chr8:471566	C C	T T	1	a0001c0001t0137 a0001c0001t0137	1	HG02922.hp2 HG02922.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2762C>T c.2762C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2762		chr8	471566
chr8:471777	C C	T T	21	a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0011 others(18): Show a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0011 a0001c0001t0047 a0001c0001t0112 a0001c0001t0114 a0001c0001t0118 a0001c0001t0123 a0001c0001t0124 a0001c0001t0125 a0001c0001t0126 a0001c0001t0127 a0001c0001t0138 a0001c0009t0008 a0002c0002t0007 a0002c0002t0115 a0002c0002t0128 a0003c0003t0011 a0003c0003t0046 a0003c0003t0119 a0003c0003t0129	47	HG00423.hp2 HG00621.hp1 HG01123.hp2 others(44): Show HG00423.hp2 HG00621.hp1 HG01123.hp2 HG01361.hp2 HG01496.hp1 HG01943.hp2 HG02071.hp1 HG02145.hp1 HG02293.hp1 HG02602.hp1 HG02738.hp1 HG02738.hp2 HG03017.hp1 HG03017.hp2 HG03688.hp1 HG03831.hp2 HG04199.hp2 HG04228.hp1 NA18612.hp1 NA18940.hp2 NA18941.hp1 NA18944.hp2 NA18945.hp2 NA18959.hp1 NA18961.hp1 NA18974.hp2 NA18975.hp2 NA18977.hp2 NA18978.hp1 NA18978.hp2 NA18979.hp2 NA18981.hp2 NA18982.hp1 NA18983.hp1 NA18988.hp2 NA18995.hp1 NA19002.hp2 NA19004.hp1 NA19006.hp2 NA19011.hp1 NA19068.hp2 NA19077.hp2 NA19080.hp1 NA19081.hp1 NA19081.hp2 NA19086.hp1 NA21309.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2973C>T c.2973C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	2973		chr8	471777
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chr8:472547	G G	C C	1	a0001c0001t0065 a0001c0001t0065	1	HG02486.hp1 HG02486.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3743G>C c.3743G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	3743		chr8	472547
chr8:472609	G G	T T	1	a0001c0001t0028 a0001c0001t0028	3	HG02109.hp1 HG02572.hp2 NA20129.hp1 HG02109.hp1 HG02572.hp2 NA20129.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3805G>T c.3805G>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	3805		chr8	472609
chr8:472620	G G	A A	1	a0002c0002t0078 a0002c0002t0078	1	HG00735.hp2 HG00735.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3816G>A c.3816G>A	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	3816		chr8	472620
chr8:472704	G G	C C	1	a0001c0001t0028 a0001c0001t0028	3	HG02109.hp1 HG02572.hp2 NA20129.hp1 HG02109.hp1 HG02572.hp2 NA20129.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3900G>C c.3900G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	3900		chr8	472704
chr8:472758	C C	A A	2	a0001c0001t0049 a0001c0001t0130 a0001c0001t0049 a0001c0001t0130	3	HG02622.hp1 HG02818.hp1 HG02965.hp1 HG02622.hp1 HG02818.hp1 HG02965.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3954C>A c.3954C>A	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	3954		chr8	472758
chr8:472758	C C	T T	1	a0003c0003t0063 a0003c0003t0063	1	NA19058.hp1 NA19058.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.3954C>T c.3954C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	3954		chr8	472758
chr8:472812	T T	A A	1	a0004c0004t0101 a0004c0004t0101	1	NA18952.hp2 NA18952.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4008T>A c.4008T>A	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4008		chr8	472812
chr8:472818	G G	C C	25	a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0011 others(22): Show a0001c0001t0007 a0001c0001t0008 a0001c0001t0011 a0001c0001t0047 a0001c0001t0112 a0001c0001t0114 a0001c0001t0118 a0001c0001t0120 a0001c0001t0121 a0001c0001t0122 a0001c0001t0123 a0001c0001t0124 a0001c0001t0125 a0001c0001t0126 a0001c0001t0127 a0001c0001t0138 a0001c0009t0008 a0002c0002t0007 a0002c0002t0115 a0002c0002t0128 a0003c0003t0011 a0003c0003t0045 a0003c0003t0046 a0003c0003t0119 a0003c0003t0129	52	HG00423.hp2 HG00438.hp2 HG00621.hp1 others(49): Show HG00423.hp2 HG00438.hp2 HG00621.hp1 HG01123.hp2 HG01257.hp2 HG01258.hp2 HG01361.hp2 HG01496.hp1 HG01943.hp2 HG02071.hp1 HG02145.hp1 HG02293.hp1 HG02602.hp1 HG02738.hp1 HG02738.hp2 HG03017.hp1 HG03017.hp2 HG03688.hp1 HG03831.hp1 HG03831.hp2 HG04199.hp2 HG04204.hp1 HG04228.hp1 NA18612.hp1 NA18940.hp2 NA18941.hp1 NA18944.hp2 NA18945.hp2 NA18959.hp1 NA18961.hp1 NA18974.hp2 NA18975.hp2 NA18977.hp2 NA18978.hp1 NA18978.hp2 NA18979.hp2 NA18981.hp2 NA18982.hp1 NA18983.hp1 NA18988.hp2 NA18995.hp1 NA19002.hp2 NA19004.hp1 NA19006.hp2 NA19011.hp1 NA19068.hp2 NA19077.hp2 NA19080.hp1 NA19081.hp1 NA19081.hp2 NA19086.hp1 NA21309.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4014G>C c.4014G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4014		chr8	472818
chr8:472842	G G	C C	1	a0001c0001t0130 a0001c0001t0130	1	HG02818.hp1 HG02818.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4038G>C c.4038G>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4038		chr8	472842
chr8:472868	C C	A A	1	a0002c0002t0025 a0002c0002t0025	3	NA18949.hp2 NA18960.hp1 NA18999.hp1 NA18949.hp2 NA18960.hp1 NA18999.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4064C>A c.4064C>A	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4064		chr8	472868
chr8:473039	C C	T T	4	a0001c0001t0028 a0001c0001t0048 a0001c0001t0136 others(1): Show a0001c0001t0028 a0001c0001t0048 a0001c0001t0136 a0001c0001t0137	7	HG01952.hp2 HG02109.hp1 HG02280.hp2 others(4): Show HG01952.hp2 HG02109.hp1 HG02280.hp2 HG02572.hp2 HG02922.hp1 HG02922.hp2 NA20129.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4235C>T c.4235C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4235		chr8	473039
chr8:473048	T T	C C	1	a0002c0002t0040 a0002c0002t0040	2	NA19009.hp1 NA19064.hp1 NA19009.hp1 NA19064.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4244T>C c.4244T>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4244		chr8	473048
chr8:473090	A A	G G	3	a0001c0001t0049 a0001c0001t0055 a0001c0001t0130 a0001c0001t0049 a0001c0001t0055 a0001c0001t0130	4	HG01884.hp1 HG02622.hp1 HG02818.hp1 others(1): Show HG01884.hp1 HG02622.hp1 HG02818.hp1 HG02965.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4286A>G c.4286A>G	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4286		chr8	473090
chr8:473092	A A	G G	8	a0001c0001t0014 a0001c0001t0015 a0001c0001t0016 others(5): Show a0001c0001t0014 a0001c0001t0015 a0001c0001t0016 a0001c0001t0053 a0001c0001t0131 a0001c0001t0134 a0002c0002t0016 a0003c0003t0135	17	HG01069.hp2 HG01071.hp2 HG01168.hp2 others(14): Show HG01069.hp2 HG01071.hp2 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01496.hp2 HG02559.hp1 HG02809.hp2 HG02886.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp2 HG03209.hp1 HG03239.hp2 HG03704.hp2 HG06807.hp1 NA20300.hp1 NA20752.hp2 NA21309.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4288A>G c.4288A>G	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4288		chr8	473092
chr8:473122	T T	C C	1	a0001c0001t0131 a0001c0001t0131	1	HG02886.hp1 HG02886.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4318T>C c.4318T>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4318		chr8	473122
chr8:473179	C C	T T	1	a0001c0001t0042 a0001c0001t0042	2	HG02257.hp2 HG02886.hp2 HG02257.hp2 HG02886.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4375C>T c.4375C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4375		chr8	473179
chr8:473201	C C	T T	1	a0001c0001t0131 a0001c0001t0131	1	HG02886.hp1 HG02886.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4397C>T c.4397C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4397		chr8	473201
chr8:473206	C C	A A	2	a0001c0001t0028 a0001c0001t0037 a0001c0001t0028 a0001c0001t0037	5	HG02109.hp1 HG02572.hp2 HG03195.hp1 others(2): Show HG02109.hp1 HG02572.hp2 HG03195.hp1 NA19043.hp2 NA20129.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4402C>A c.4402C>A	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4402		chr8	473206
chr8:473207	G G	A A	1	a0002c0002t0076 a0002c0002t0076	1	HG01256.hp1 HG01256.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4403G>A c.4403G>A	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4403		chr8	473207
chr8:473208	C C	T T	1	a0002c0002t0098 a0002c0002t0098	1	NA18957.hp1 NA18957.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4404C>T c.4404C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4404		chr8	473208
chr8:473213	C C	T T	3	a0001c0001t0008 a0001c0009t0008 a0002c0002t0115 a0001c0001t0008 a0001c0009t0008 a0002c0002t0115	12	HG00423.hp2 HG02071.hp1 NA18944.hp2 others(9): Show HG00423.hp2 HG02071.hp1 NA18944.hp2 NA18945.hp2 NA18961.hp1 NA18975.hp2 NA18977.hp2 NA18978.hp1 NA18982.hp1 NA18983.hp1 NA19080.hp1 NA19081.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4409C>T c.4409C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4409		chr8	473213
chr8:473235	C C	T T	10	a0001c0001t0014 a0001c0001t0015 a0001c0001t0016 others(7): Show a0001c0001t0014 a0001c0001t0015 a0001c0001t0016 a0001c0001t0028 a0001c0001t0029 a0001c0001t0053 a0001c0001t0131 a0001c0001t0134 a0002c0002t0016 a0003c0003t0135	23	HG01069.hp2 HG01071.hp2 HG01168.hp2 others(20): Show HG01069.hp2 HG01071.hp2 HG01168.hp2 HG01169.hp1 HG01496.hp2 HG02109.hp1 HG02559.hp1 HG02572.hp2 HG02809.hp2 HG02886.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp2 HG02970.hp2 HG03130.hp1 HG03209.hp1 HG03239.hp2 HG03579.hp1 HG03704.hp2 HG06807.hp1 NA20129.hp1 NA20300.hp1 NA20752.hp2 NA21309.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4431C>T c.4431C>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4431		chr8	473235
chr8:473239	A A	T T	1	a0002c0002t0116 a0002c0002t0116	1	NA18972.hp1 NA18972.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4435A>T c.4435A>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4435		chr8	473239
chr8:473245	T T	C C	1	a0002c0002t0081 a0002c0002t0081	1	HG02486.hp2 HG02486.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4441T>C c.4441T>C	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4441		chr8	473245
chr8:473297	G G	T T	1	a0001c0001t0035 a0001c0001t0035	2	HG02818.hp2 NA20129.hp2 HG02818.hp2 NA20129.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4493G>T c.4493G>T	FBXO25	ENSG00000147364.17	transcript	ENST00000350302.8	protein_coding	10/10	4493		chr8	473297
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FBXO25_chr8_401958_482967 Genic Haplotype Structure on iGV

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Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 6)

Coding Level Haplotype Info (Total: 9)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 155)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 363)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 412)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 4)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 196)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1070)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)