Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr2:157311136	G G	A A	1	a0003c0004t0062g0218 a0003c0004t0062g0218	1	NA19088.hp1 NA19088.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.2683-72G>A c.2683-72G>A	GALNT5	ENSG00000136542.9	transcript	ENST00000259056.5	protein_coding	9/9		chr2	157311136

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GALNT5_chr2_157252705_157323491 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 8)

Coding Level Haplotype Info (Total: 13)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 113)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 269)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 282)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 6)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 74)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 582)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)