Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr7:80199257	A A	G G	1	a0001c0004 a0001c0004	10	HG01891.hp2 HG02258.hp1 HG02895.hp2 others(7): Show HG01891.hp2 HG02258.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp2 HG02897.hp1 HG02970.hp2 HG03130.hp2 HG03516.hp2 HG06807.hp1 NA21309.hp1	synonymous_variant	LOW	c.336A>G c.336A>G	p.Gly112Gly p.Gly112Gly	GNAI1	ENSG00000127955.17	transcript	ENST00000649796.2	protein_coding	4/8	666/10083	336/1065	112/354	chr7	80199257
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chr7:80211023	C C	T T	2	a0001c0003 a0001c0007 a0001c0003 a0001c0007	28	HG01243.hp1 HG01433.hp2 HG02145.hp1 others(25): Show HG01243.hp1 HG01433.hp2 HG02145.hp1 HG02451.hp2 HG02559.hp1 HG02615.hp1 HG02630.hp1 HG02647.hp2 HG02717.hp1 HG02818.hp1 HG02886.hp1 HG02886.hp2 HG02896.hp1 HG02897.hp2 HG02970.hp1 HG02976.hp2 HG03041.hp1 HG03098.hp1 HG03195.hp1 HG03225.hp2 HG03471.hp1 HG03486.hp1 HG03486.hp2 HG03540.hp1 NA18522.hp1 NA18522.hp2 NA18906.hp1 NA20129.hp1	synonymous_variant	LOW	c.645C>T c.645C>T	p.Phe215Phe p.Phe215Phe	GNAI1	ENSG00000127955.17	transcript	ENST00000649796.2	protein_coding	6/8	975/10083	645/1065	215/354	chr7	80211023
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chr7:80134858	G G	A A	19	a0001c0001t0002 a0001c0001t0008 a0001c0001t0012 others(16): Show a0001c0001t0002 a0001c0001t0008 a0001c0001t0012 a0001c0001t0014 a0001c0001t0021 a0001c0001t0022 a0001c0001t0035 a0001c0001t0037 a0001c0001t0038 a0001c0001t0039 a0001c0001t0040 a0001c0001t0041 a0001c0001t0042 a0001c0001t0045 a0001c0001t0046 a0001c0001t0047 a0001c0002t0009 a0001c0002t0043 a0001c0002t0044	71	HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00280.hp2 others(68): Show HG00140.hp1 HG00140.hp2 HG00280.hp2 HG00323.hp2 HG00423.hp1 HG00423.hp2 HG00621.hp1 HG00642.hp2 HG00733.hp1 HG00733.hp2 HG00735.hp1 HG01070.hp1 HG01081.hp1 HG01109.hp1 HG01168.hp2 HG01175.hp1 HG01192.hp2 HG01257.hp1 HG01258.hp2 HG01261.hp1 HG01346.hp2 HG01358.hp2 HG01433.hp1 HG01496.hp1 HG01496.hp2 HG01928.hp1 HG01934.hp2 HG01978.hp1 HG01993.hp2 HG02129.hp1 HG02683.hp1 HG02735.hp2 HG03017.hp1 HG03491.hp2 HG03669.hp2 HG03688.hp1 HG03704.hp1 HG03704.hp2 HG03710.hp1 HG03710.hp2 HG03831.hp1 HG03831.hp2 HG03834.hp2 HG03927.hp2 HG04115.hp1 HG04115.hp2 HG04184.hp1 HG04204.hp2 NA18939.hp2 NA18942.hp1 NA18942.hp2 NA18943.hp2 NA18945.hp2 NA18960.hp2 NA18963.hp2 NA18971.hp1 NA18971.hp2 NA18977.hp1 NA18978.hp1 NA18978.hp2 NA18979.hp1 NA18982.hp2 NA18986.hp2 NA18987.hp1 NA18995.hp1 NA19004.hp2 NA19062.hp2 NA19065.hp1 NA20300.hp1 NA20752.hp1 NA20905.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-303G>A c.-303G>A	GNAI1	ENSG00000127955.17	transcript	ENST00000649796.2	protein_coding	1/8	303		chr7	80134858
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GNAI1_chr7_80129831_80231181 Genic Haplotype Structure on iGV

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Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

Coding Level Haplotype Info (Total: 9)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 97)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 308)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 312)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 6)

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Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 968)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)