Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr10:92637232	C C	G G	1	a0007 a0007	1	NA19076.hp1 NA19076.hp1	missense_variant	MODERATE	c.1924C>G c.1924C>G	p.Pro642Ala p.Pro642Ala	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	15/22	2170/5016	1924/3171	642/1056	chr10	92637232
chr10:92637538	A A	T T	1	a0003 a0003	3	HG02074.hp1 HG02083.hp1 NA18945.hp1 HG02074.hp1 HG02083.hp1 NA18945.hp1	missense_variant	MODERATE	c.2153A>T c.2153A>T	p.His718Leu p.His718Leu	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	16/22	2399/5016	2153/3171	718/1056	chr10	92637538
chr10:92648224	T T	A A	1	a0008 a0008	1	NA21309.hp1 NA21309.hp1	missense_variant	MODERATE	c.2560T>A c.2560T>A	p.Cys854Ser p.Cys854Ser	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	19/22	2806/5016	2560/3171	854/1056	chr10	92648224
chr10:92649866	CCCATCAA others(15): Show CCCATCAACACTGGTAAGAACTG	C C	1	a0006 a0006	1	NA19001.hp2 NA19001.hp2	frameshift_variant	HIGH	c.2803_2824delCCATCA others(16): Show c.2803_2824delCCATCAACACTGGTAAGAACTG	p.Pro935fs p.Pro935fs	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	20/22	3049/5016	2803/3171	935/1056	chr10	92649866
chr10:92653751	G G	C C	1	a0002 a0002	6	HG01243.hp2 HG02818.hp1 HG02922.hp1 others(3): Show HG01243.hp2 HG02818.hp1 HG02922.hp1 HG02976.hp2 HG03041.hp1 HG06807.hp2	missense_variant	MODERATE	c.3126G>C c.3126G>C	p.Leu1042Phe p.Leu1042Phe	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	22/22	3372/5016	3126/3171	1042/1056	chr10	92653751

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chr10:92606367	G G	A A	1	a0001c0004 a0001c0004	1	HG00639.hp2 HG00639.hp2	synonymous_variant	LOW	c.180G>A c.180G>A	p.Lys60Lys p.Lys60Lys	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	2/22	426/5016	180/3171	60/1056	chr10	92606367
chr10:92606654	C C	T T	1	a0001c0011 a0001c0011	1	NA19009.hp1 NA19009.hp1	synonymous_variant	LOW	c.246C>T c.246C>T	p.Tyr82Tyr p.Tyr82Tyr	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	3/22	492/5016	246/3171	82/1056	chr10	92606654
chr10:92633726	G G	A A	1	a0002c0002 a0002c0002	6	HG01243.hp2 HG02818.hp1 HG02922.hp1 others(3): Show HG01243.hp2 HG02818.hp1 HG02922.hp1 HG02976.hp2 HG03041.hp1 HG06807.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1806G>A c.1806G>A	p.Gln602Gln p.Gln602Gln	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	14/22	2052/5016	1806/3171	602/1056	chr10	92633726
chr10:92639799	T T	G G	1	a0001c0006 a0001c0006	1	HG02109.hp2 HG02109.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2166T>G c.2166T>G	p.Leu722Leu p.Leu722Leu	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	17/22	2412/5016	2166/3171	722/1056	chr10	92639799

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chr10:92593130	A A	C C	1	a0001c0001t0013 a0001c0001t0013	1	NA18969.hp2 NA18969.hp2	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-246A>C c.-246A>C	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	1/22	246	chr10	92593130
chr10:92593161	A A	G G	2	a0001c0001t0006 a0001c0006t0006 a0001c0001t0006 a0001c0006t0006	11	HG01081.hp2 HG01243.hp1 HG01433.hp2 others(8): Show HG01081.hp2 HG01243.hp1 HG01433.hp2 HG02109.hp2 HG02258.hp2 HG02559.hp2 HG02717.hp2 HG02818.hp2 HG02896.hp2 HG03098.hp1 NA18906.hp2	5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant	LOW	c.-215A>G c.-215A>G	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	1/22		chr10	92593161
chr10:92593181	T T	A A	1	a0001c0001t0010 a0001c0001t0010	1	HG01975.hp1 HG01975.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-195T>A c.-195T>A	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	1/22	195	chr10	92593181
chr10:92653906	G G	A A	1	a0001c0001t0007 a0001c0001t0007	3	HG00642.hp2 HG03927.hp2 HG04199.hp2 HG00642.hp2 HG03927.hp2 HG04199.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.110G>A c.110G>A	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	22/22	110	chr10	92653906
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chr10:92654253	C C	A A	1	a0001c0001t0005 a0001c0001t0005	15	HG00408.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp2 others(12): Show HG00408.hp2 HG00735.hp1 HG00738.hp2 HG01070.hp2 HG01361.hp2 HG01928.hp2 HG01952.hp1 HG01978.hp1 HG01981.hp2 HG02071.hp2 HG02273.hp2 HG02293.hp1 HG02723.hp2 HG03710.hp1 NA18952.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.457C>A c.457C>A	KIF11	ENSG00000138160.7	transcript	ENST00000260731.5	protein_coding	22/22	457	chr10	92654253
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Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 352)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 7)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 14)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 865)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)