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NA19091	hp1	a0001	c0001	t0002	g0009	EAS	JPT	KLHL12_chr1_202886120_202932234	KLHL12	chr1	202886120	202932234
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NA19240	hp2	a0001	c0001	t0006	g0254	AFR	YRI	KLHL12_chr1_202886120_202932234	KLHL12	chr1	202886120	202932234
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NA20129	hp2	a0001	c0001	t0002	g0080	AFR	ASW	KLHL12_chr1_202886120_202932234	KLHL12	chr1	202886120	202932234
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NA18955	hp1	a0001	c0001	t0003	g0244	EAS	JPT	KLHL12_chr1_202886120_202932234	KLHL12	chr1	202886120	202932234
NA18955	hp2	a0001	c0001	t0004	g0110	EAS	JPT	KLHL12_chr1_202886120_202932234	KLHL12	chr1	202886120	202932234
NA21309	hp1	a0001	c0001	t0002	g0055	AFR	LWK	KLHL12_chr1_202886120_202932234	KLHL12	chr1	202886120	202932234
NA21309	hp2	a0001	c0002	t0011	g0144	AFR	LWK	KLHL12_chr1_202886120_202932234	KLHL12	chr1	202886120	202932234
homoSapiens_chm13v2	hp1	a0001	c0002	t0001	g0297	REF	REF	KLHL12_chr1_202886120_202932234	KLHL12	chr1	202886120	202932234
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chr:pos	ref	alt	# # of ahapid:amino-acid(protein) level	ahapids	# # of haplotypeids	haplotypeids	annotation	impact	hgvs_c	hgvs_p	genename	geneid	featuretype	featureid	transcript_biotype	rank	cdna cdna pos length	cds cds pos length	aa aa pos length	distance	status	chr	pos
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chr1:202925206	A A	G G	1	a0001 a0001	1	NA21309.hp2 NA21309.hp2	splice_region_variant	LOW	c.-44T>C c.-44T>C		KLHL12	ENSG00000117153.16	transcript	ENST00000367261.8	protein_coding	2/12						chr1	202925206

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chr1:202918279	T T	G G	1	a0001c0004 a0001c0004	1	NA19081.hp1 NA19081.hp1	synonymous_variant	LOW	c.459A>C c.459A>C	p.Ala153Ala p.Ala153Ala	KLHL12	ENSG00000117153.16	transcript	ENST00000367261.8	protein_coding	4/12	650/3311	459/1707	153/568			chr1	202918279
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chr1:202926409	A A	T T	1	a0001c0001t0003g0028 a0001c0001t0003g0028	1	HG03704.hp1 HG03704.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-46+680T>A c.-46+680T>A	KLHL12	ENSG00000117153.16	transcript	ENST00000367261.8	protein_coding	1/11	chr1	202926409
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chr1:202927018	G G	C C	1	a0001c0002t0001g0298 a0001c0002t0001g0298	1	NA19057.hp1 NA19057.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-46+71C>G c.-46+71C>G	KLHL12	ENSG00000117153.16	transcript	ENST00000367261.8	protein_coding	1/11	chr1	202927018

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer KLHL12_chr1_202886120_202932234

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Translation Multiple Alignment View

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 17)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 298)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 4)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 19)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 298)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 358)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 13)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 358)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)