Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr7:23173008	A A	G G	1	a0001c0006 a0001c0006	1	HG00280.hp2 HG00280.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1440A>G c.1440A>G	p.Lys480Lys p.Lys480Lys	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	10/11	1682/5619	1440/1761	480/586	chr7	23173008
chr7:23174115	T T	C C	2	a0001c0003 a0001c0005 a0001c0003 a0001c0005	11	HG01243.hp1 HG02109.hp2 HG02258.hp1 others(8): Show HG01243.hp1 HG02109.hp2 HG02258.hp1 HG02451.hp1 HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02717.hp2 HG02895.hp1 HG03209.hp1 HG03516.hp2 NA19030.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1578T>C c.1578T>C	p.Val526Val p.Val526Val	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	1820/5619	1578/1761	526/586	chr7	23174115
chr7:23174259	C C	T T	1	a0001c0008 a0001c0008	1	HG02717.hp1 HG02717.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1722C>T c.1722C>T	p.Val574Val p.Val574Val	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	1964/5619	1722/1761	574/586	chr7	23174259

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chr7:23105792	G G	T T	4	a0001c0001t0006 a0001c0001t0030 a0001c0001t0058 others(1): Show a0001c0001t0006 a0001c0001t0030 a0001c0001t0058 a0001c0001t0059	16	HG00621.hp1 HG01978.hp1 NA18747.hp1 others(13): Show HG00621.hp1 HG01978.hp1 NA18747.hp1 NA18959.hp1 NA18966.hp2 NA18967.hp1 NA18968.hp2 NA18986.hp1 NA18990.hp2 NA19004.hp1 NA19011.hp1 NA19056.hp2 NA19065.hp1 NA19086.hp1 NA19091.hp2 NA20300.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-235G>T c.-235G>T	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	1/11	235		chr7	23105792
chr7:23105915	G G	A A	1	a0001c0002t0031 a0001c0002t0031	1	HG02040.hp1 HG02040.hp1	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-112G>A c.-112G>A	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	1/11	112		chr7	23105915
chr7:23174305	A A	G G	3	a0001c0001t0021 a0001c0001t0029 a0001c0002t0021 a0001c0001t0021 a0001c0001t0029 a0001c0002t0021	5	HG02486.hp1 HG02630.hp2 HG02886.hp2 others(2): Show HG02486.hp1 HG02630.hp2 HG02886.hp2 HG03098.hp1 HG03195.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.7A>G c.7A>G	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	7		chr7	23174305
chr7:23174314	CAGACTCA others(4): Show CAGACTCATCAG	C C	3	a0001c0002t0004 a0001c0002t0020 a0001c0002t0057 a0001c0002t0004 a0001c0002t0020 a0001c0002t0057	22	HG00438.hp1 HG00544.hp2 HG01175.hp1 others(19): Show HG00438.hp1 HG00544.hp2 HG01175.hp1 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02040.hp2 HG02132.hp1 HG04184.hp1 NA18747.hp2 NA18941.hp2 NA18943.hp1 NA18950.hp2 NA18959.hp2 NA18975.hp1 NA18986.hp2 NA18995.hp1 NA19003.hp2 NA19056.hp1 NA19062.hp2 NA19065.hp2 NA19067.hp2 NA19082.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.23_33delATCAGAGA others(3): Show c.23_33delATCAGAGACTC	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	23	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr7	23174314
chr7:23174333	A A	G G	3	a0001c0002t0004 a0001c0002t0020 a0001c0002t0057 a0001c0002t0004 a0001c0002t0020 a0001c0002t0057	22	HG00438.hp1 HG00544.hp2 HG01175.hp1 others(19): Show HG00438.hp1 HG00544.hp2 HG01175.hp1 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02040.hp2 HG02132.hp1 HG04184.hp1 NA18747.hp2 NA18941.hp2 NA18943.hp1 NA18950.hp2 NA18959.hp2 NA18975.hp1 NA18986.hp2 NA18995.hp1 NA19003.hp2 NA19056.hp1 NA19062.hp2 NA19065.hp2 NA19067.hp2 NA19082.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.35A>G c.35A>G	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	35		chr7	23174333
chr7:23174675	G G	A A	1	a0001c0001t0032 a0001c0001t0032	1	NA18983.hp2 NA18983.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.377G>A c.377G>A	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	377		chr7	23174675
chr7:23175028	C C	T T	1	a0001c0002t0056 a0001c0002t0056	1	HG03225.hp1 HG03225.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.730C>T c.730C>T	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	730		chr7	23175028
chr7:23175060	G G	A A	1	a0001c0002t0033 a0001c0002t0033	1	HG06807.hp2 HG06807.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.762G>A c.762G>A	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	762		chr7	23175060
chr7:23175077	A A	G G	27	a0001c0001t0005 a0001c0001t0015 a0001c0001t0021 others(24): Show a0001c0001t0005 a0001c0001t0015 a0001c0001t0021 a0001c0001t0026 a0001c0001t0029 a0001c0001t0045 a0001c0001t0046 a0001c0001t0047 a0001c0001t0052 a0001c0001t0053 a0001c0001t0054 a0001c0002t0004 a0001c0002t0007 a0001c0002t0015 a0001c0002t0018 a0001c0002t0020 a0001c0002t0021 a0001c0002t0028 a0001c0002t0057 a0001c0003t0013 a0001c0003t0049 a0001c0003t0051 a0001c0004t0019 a0001c0004t0055 a0001c0005t0027 a0001c0005t0048 a0001c0005t0050	82	HG00438.hp1 HG00544.hp2 HG01081.hp2 others(79): Show HG00438.hp1 HG00544.hp2 HG01081.hp2 HG01175.hp1 HG01243.hp1 HG01243.hp2 HG01255.hp1 HG01256.hp2 HG01934.hp2 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02040.hp2 HG02109.hp2 HG02132.hp1 HG02145.hp1 HG02257.hp2 HG02258.hp1 HG02258.hp2 HG02280.hp1 HG02280.hp2 HG02293.hp2 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02486.hp1 HG02559.hp1 HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02622.hp1 HG02630.hp1 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02717.hp2 HG02723.hp1 HG02818.hp2 HG02886.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG02896.hp1 HG03098.hp1 HG03098.hp2 HG03139.hp2 HG03195.hp1 HG03195.hp2 HG03209.hp1 HG03453.hp1 HG03471.hp2 HG03486.hp2 HG03516.hp1 HG03516.hp2 HG03540.hp1 HG03540.hp2 HG03654.hp1 HG04115.hp1 HG04115.hp2 HG04184.hp1 HG04199.hp1 NA18747.hp2 NA18906.hp1 NA18906.hp2 NA18941.hp2 NA18943.hp1 NA18948.hp1 NA18950.hp2 NA18953.hp2 NA18959.hp2 NA18975.hp1 NA18986.hp2 NA18995.hp1 NA19003.hp2 NA19030.hp1 NA19043.hp1 NA19056.hp1 NA19062.hp2 NA19063.hp2 NA19065.hp2 NA19067.hp2 NA19082.hp2 NA19091.hp1 NA19240.hp1 NA20129.hp2 NA20300.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.779A>G c.779A>G	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	779		chr7	23175077
chr7:23175269	G G	T T	3	a0001c0002t0004 a0001c0002t0020 a0001c0002t0057 a0001c0002t0004 a0001c0002t0020 a0001c0002t0057	22	HG00438.hp1 HG00544.hp2 HG01175.hp1 others(19): Show HG00438.hp1 HG00544.hp2 HG01175.hp1 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02040.hp2 HG02132.hp1 HG04184.hp1 NA18747.hp2 NA18941.hp2 NA18943.hp1 NA18950.hp2 NA18959.hp2 NA18975.hp1 NA18986.hp2 NA18995.hp1 NA19003.hp2 NA19056.hp1 NA19062.hp2 NA19065.hp2 NA19067.hp2 NA19082.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.971G>T c.971G>T	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	971		chr7	23175269
chr7:23175524	A A	C C	2	a0001c0001t0017 a0001c0001t0025 a0001c0001t0017 a0001c0001t0025	5	HG01069.hp1 HG01071.hp2 HG03225.hp2 others(2): Show HG01069.hp1 HG01071.hp2 HG03225.hp2 HG03486.hp1 NA18522.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1226A>C c.1226A>C	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	1226		chr7	23175524
chr7:23175568	G G	GA GA	2	a0001c0002t0014 a0002c0007t0014 a0001c0002t0014 a0002c0007t0014	4	HG02809.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp1 others(1): Show HG02809.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp1 HG03209.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1275dupA c.1275dupA	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	1276	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr7	23175568
chr7:23175587	A A	G G	1	a0001c0002t0024 a0001c0002t0024	2	HG01884.hp2 NA20129.hp1 HG01884.hp2 NA20129.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1289A>G c.1289A>G	KLHL7	ENSG00000122550.18	transcript	ENST00000339077.10	protein_coding	11/11	1289		chr7	23175587
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KLHL7_chr7_23100785_23182914 Genic Haplotype Structure on iGV

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Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

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Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 328)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

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Annotation (SNP Array)