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NA20300	hp2	a0001	c0001	t0003	g0004	AFR	USA	LIMD2_chr17_63690888_63705125	LIMD2	chr17	63690888	63705125
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chr17:63698569	C C	T T	1	a0002 a0002	1	NA21309.hp1 NA21309.hp1	missense_variant	MODERATE	c.367G>A c.367G>A	p.Gly123Ser p.Gly123Ser	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	5/5	511/3192	367/384	123/127			chr17	63698569
chr17:63700034	G G	C C	1	a0001 a0001	1	HG02027.hp1 HG02027.hp1	splice_region_variant	LOW	c.-53C>G c.-53C>G		LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	1/5						chr17	63700034

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chr17:63698663	G G	A A	1	a0001c0004 a0001c0004	1	HG02040.hp2 HG02040.hp2	synonymous_variant	LOW	c.273C>T c.273C>T	p.His91His p.His91His	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	5/5	417/3192	273/384	91/127			chr17	63698663
chr17:63698912	C C	T T	1	a0001c0002 a0001c0002	1	HG00408.hp2 HG00408.hp2	synonymous_variant	LOW	c.111G>A c.111G>A	p.Lys37Lys p.Lys37Lys	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	4/5	255/3192	111/384	37/127			chr17	63698912

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chr17:63695939	TAAA TAAA	T T	1	a0001c0001t0005 a0001c0001t0005	6	HG00140.hp1 HG01081.hp2 HG01123.hp1 others(3): Show HG00140.hp1 HG01081.hp2 HG01123.hp1 HG01433.hp1 HG02293.hp2 NA19043.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2610_2612delTTT c.2610_2612delTTT	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	5/5	2610	chr17	63695939
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chr17:63696150	CTA CTA	C C	1	a0001c0001t0012 a0001c0001t0012	3	HG02970.hp2 HG03209.hp2 NA18522.hp2 HG02970.hp2 HG03209.hp2 NA18522.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2400_2401delTA c.2400_2401delTA	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	5/5	2400	chr17	63696150
chr17:63696156	CTG CTG	C C	5	a0001c0001t0002 a0001c0001t0015 a0001c0001t0024 others(2): Show a0001c0001t0002 a0001c0001t0015 a0001c0001t0024 a0001c0001t0025 a0001c0001t0026	53	HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00280.hp1 others(50): Show HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00280.hp1 HG00639.hp2 HG01069.hp1 HG01106.hp2 HG01123.hp2 HG01243.hp1 HG01358.hp1 HG01358.hp2 HG01891.hp2 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01952.hp2 HG02004.hp1 HG02055.hp1 HG02145.hp1 HG02148.hp2 HG02293.hp1 HG02300.hp1 HG02486.hp1 HG02572.hp2 HG02622.hp1 HG02630.hp1 HG02683.hp1 HG02809.hp2 HG02886.hp1 HG02895.hp2 HG02922.hp2 HG02976.hp1 HG03098.hp2 HG03239.hp1 HG03453.hp2 HG03486.hp2 HG03492.hp2 HG03516.hp1 HG03540.hp1 HG03579.hp2 HG03831.hp1 HG04184.hp1 HG04184.hp2 HG06807.hp1 NA18906.hp1 NA18950.hp1 NA18952.hp1 NA18971.hp2 NA19005.hp1 NA19054.hp1 NA19056.hp1 NA19077.hp1 NA19087.hp2 NA20805.hp2 homoSapiens_chm13v2.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.2394_2395delCA c.2394_2395delCA	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	5/5	2394	chr17	63696156
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chr17:63696844	C C	CT CT	9	a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0012 others(6): Show a0001c0001t0002 a0001c0001t0003 a0001c0001t0012 a0001c0001t0019 a0001c0001t0020 a0001c0001t0024 a0001c0001t0025 a0001c0001t0026 a0002c0003t0003	70	HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00280.hp1 others(67): Show HG00099.hp2 HG00140.hp2 HG00280.hp1 HG00639.hp2 HG01069.hp1 HG01099.hp2 HG01106.hp2 HG01123.hp2 HG01243.hp1 HG01358.hp1 HG01358.hp2 HG01891.hp2 HG01928.hp2 HG01934.hp2 HG01952.hp2 HG02004.hp1 HG02055.hp1 HG02109.hp1 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02257.hp1 HG02293.hp1 HG02300.hp1 HG02486.hp1 HG02486.hp2 HG02572.hp1 HG02572.hp2 HG02622.hp1 HG02630.hp1 HG02683.hp1 HG02809.hp2 HG02886.hp1 HG02895.hp1 HG02895.hp2 HG02897.hp1 HG02922.hp2 HG02970.hp2 HG02976.hp1 HG03041.hp1 HG03098.hp2 HG03130.hp2 HG03139.hp1 HG03209.hp1 HG03209.hp2 HG03239.hp1 HG03453.hp1 HG03453.hp2 HG03486.hp2 HG03492.hp2 HG03516.hp1 HG03540.hp1 HG03579.hp2 HG03831.hp1 HG04184.hp1 HG04184.hp2 HG06807.hp1 NA18522.hp2 NA18906.hp1 NA18950.hp1 NA18952.hp1 NA18971.hp2 NA19005.hp1 NA19054.hp1 NA19056.hp1 NA19077.hp1 NA19087.hp2 NA19240.hp2 NA20300.hp2 NA21309.hp1 homoSapiens_chm13v2.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.1707_1708insA c.1707_1708insA	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	5/5	1707	chr17	63696844
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chr17:63699833	C C	G G	1	a0001c0001t0004g0005 a0001c0001t0004g0005	8	HG02055.hp2 HG02280.hp2 HG02622.hp2 others(5): Show HG02055.hp2 HG02280.hp2 HG02622.hp2 HG02970.hp1 HG02976.hp2 HG03041.hp2 HG03139.hp2 HG03195.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-51+199G>C c.-51+199G>C	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	1/4	chr17	63699833
chr17:63699862	G G	C C	1	a0001c0001t0001g0018 a0001c0001t0001g0018	2	HG02683.hp2 HG03710.hp1 HG02683.hp2 HG03710.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.-51+170C>G c.-51+170C>G	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	1/4	chr17	63699862
chr17:63699947	C C	T T	1	a0001c0001t0012g0013 a0001c0001t0012g0013	3	HG02970.hp2 HG03209.hp2 NA18522.hp2 HG02970.hp2 HG03209.hp2 NA18522.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.-51+85G>A c.-51+85G>A	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	1/4	chr17	63699947
chr17:63700014	T T	C C	1	a0001c0001t0001g0038 a0001c0001t0001g0038	1	NA19060.hp2 NA19060.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.-51+18A>G c.-51+18A>G	LIMD2	ENSG00000136490.9	transcript	ENST00000259006.8	protein_coding	1/4	chr17	63700014

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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer LIMD2_chr17_63690888_63705125

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ACTG-Haplotype Mutation Positions 3D Viewer

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 28)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 40)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 4)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 31)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 40)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 392)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 2)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 30)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 13)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)