Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr7:115016495	T T	C C	1	a0001c0001t0038 a0001c0001t0038	1	HG02273.hp2 HG02273.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.560T>C c.560T>C	MDFIC	ENSG00000135272.13	transcript	ENST00000393486.6	protein_coding	5/5	560		chr7	115016495
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chr7:115015314	A A	C C	1	a0001c0001t0014g0289 a0001c0001t0014g0289	1	HG02080.hp2 HG02080.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.494-374A>C c.494-374A>C	MDFIC	ENSG00000135272.13	transcript	ENST00000393486.6	protein_coding	4/4		chr7	115015314

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MDFIC_chr7_114917094_115024917 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

Coding Level Haplotype Info (Total: 8)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 74)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 319)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 334)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 54)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 857)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)