Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr1:204548859	G G	A A	3	a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0086 a0001c0001t0023g0077 a0001c0001t0001g0020 a0001c0001t0001g0086 a0001c0001t0023g0077	4	NA18999.hp2 NA19012.hp1 NA19066.hp2 others(1): Show NA18999.hp2 NA19012.hp1 NA19066.hp2 NA19083.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.904-254G>A c.904-254G>A	MDM4	ENSG00000198625.14	transcript	ENST00000367182.8	protein_coding	10/10		chr1	204548859
chr1:204548949	C C	T T	2	a0004c0007t0010g0263 a0004c0007t0010g0264 a0004c0007t0010g0263 a0004c0007t0010g0264	2	HG02451.hp1 HG02559.hp1 HG02451.hp1 HG02559.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.904-164C>T c.904-164C>T	MDM4	ENSG00000198625.14	transcript	ENST00000367182.8	protein_coding	10/10		chr1	204548949

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MDM4_chr1_204511406_204563120 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 8)

Coding Level Haplotype Info (Total: 12)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 102)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 297)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 372)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 7)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 133)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 358)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)