Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr13:32517104	G G	C C	9	a0001c0001t0003 a0001c0001t0011 a0001c0001t0024 others(6): Show a0001c0001t0003 a0001c0001t0011 a0001c0001t0024 a0001c0001t0025 a0001c0001t0063 a0001c0001t0064 a0001c0001t0065 a0001c0001t0066 a0004c0008t0003	63	HG00140.hp1 HG00280.hp1 HG00544.hp2 others(60): Show HG00140.hp1 HG00280.hp1 HG00544.hp2 HG00639.hp1 HG00673.hp1 HG00738.hp1 HG01074.hp2 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01255.hp1 HG01257.hp1 HG01258.hp1 HG01361.hp2 HG01433.hp2 HG01496.hp2 HG01515.hp2 HG01516.hp2 HG01517.hp2 HG01928.hp2 HG01943.hp1 HG01978.hp1 HG01981.hp2 HG01993.hp1 HG02004.hp2 HG02040.hp1 HG02055.hp1 HG02071.hp2 HG02080.hp2 HG02273.hp2 HG02293.hp1 HG02602.hp1 HG02683.hp1 HG02735.hp2 HG02922.hp1 HG03453.hp1 HG03490.hp2 HG03654.hp2 HG06807.hp1 NA18943.hp1 NA18950.hp1 NA18951.hp2 NA18952.hp2 NA18956.hp2 NA18971.hp2 NA18979.hp1 NA18980.hp2 NA18988.hp1 NA18990.hp2 NA18993.hp2 NA18998.hp1 NA18999.hp1 NA19002.hp2 NA19004.hp2 NA19006.hp1 NA19009.hp1 NA19012.hp2 NA19057.hp2 NA19058.hp1 NA19060.hp2 NA19062.hp1 NA19068.hp2 NA19091.hp1 NA20129.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.698C>G c.698C>G	N4BP2L2	ENSG00000244754.9	transcript	ENST00000267068.6	protein_coding	6/6	698	chr13	32517104
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chr13:32517411	G G	A A	7	a0002c0002t0009 a0002c0002t0010 a0002c0002t0013 others(4): Show a0002c0002t0009 a0002c0002t0010 a0002c0002t0013 a0002c0002t0016 a0002c0002t0068 a0002c0006t0009 a0003c0004t0013	20	HG01175.hp2 HG02280.hp2 HG02572.hp1 others(17): Show HG01175.hp2 HG02280.hp2 HG02572.hp1 HG02615.hp2 HG02630.hp2 HG02647.hp1 HG02809.hp1 HG02895.hp1 HG02896.hp2 HG02897.hp2 HG02965.hp2 HG03098.hp1 HG03130.hp1 HG03209.hp1 HG03471.hp1 HG03486.hp1 HG03579.hp1 HG06807.hp2 NA18906.hp2 NA20300.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.391C>T c.391C>T	N4BP2L2	ENSG00000244754.9	transcript	ENST00000267068.6	protein_coding	6/6	391	chr13	32517411
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chr13:32518225	T T	C C	1	a0001c0001t0003g0085 a0001c0001t0003g0085	1	HG00738.hp1 HG00738.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1551-222A>G c.1551-222A>G	N4BP2L2	ENSG00000244754.9	transcript	ENST00000267068.6	protein_coding	5/5	chr13	32518225
chr13:32518338	AT AT	A A	2	a0001c0001t0002g0032 a0001c0001t0002g0256 a0001c0001t0002g0032 a0001c0001t0002g0256	3	HG01943.hp2 HG01952.hp2 HG02300.hp2 HG01943.hp2 HG01952.hp2 HG02300.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1551-336delA c.1551-336delA	N4BP2L2	ENSG00000244754.9	transcript	ENST00000267068.6	protein_coding	5/5	chr13	32518338
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N4BP2L2_chr13_32505292_32543795 Genic Haplotype Structure on iGV

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Coding Level Haplotype Info (Total: 13)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 78)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 283)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 394)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 8)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 81)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 228)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)