Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr4:119498621	C C	T T	1	a0005 a0005	2	HG01109.hp1 HG03225.hp1 HG01109.hp1 HG03225.hp1	missense_variant	MODERATE	c.2608G>A c.2608G>A	p.Gly870Ser p.Gly870Ser	PDE5A	ENSG00000138735.16	transcript	ENST00000354960.8	protein_coding	21/21	2741/6959	2608/2628	870/875	chr4	119498621
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chr4:119628664	C C	G G	1	a0007 a0007	1	HG02647.hp2 HG02647.hp2	missense_variant	MODERATE	c.8G>C c.8G>C	p.Arg3Pro p.Arg3Pro	PDE5A	ENSG00000138735.16	transcript	ENST00000354960.8	protein_coding	1/21	141/6959	8/2628	3/875	chr4	119628664

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chr4:119498622	G G	A A	1	a0001c0013 a0001c0013	1	HG02630.hp1 HG02630.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2607C>T c.2607C>T	p.Ser869Ser p.Ser869Ser	PDE5A	ENSG00000138735.16	transcript	ENST00000354960.8	protein_coding	21/21	2740/6959	2607/2628	869/875	chr4	119498622
chr4:119501236	C C	T T	2	a0001c0015 a0002c0006 a0001c0015 a0002c0006	5	HG00738.hp2 HG02280.hp1 HG02486.hp2 others(2): Show HG00738.hp2 HG02280.hp1 HG02486.hp2 HG03130.hp1 NA21309.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2424G>A c.2424G>A	p.Glu808Glu p.Glu808Glu	PDE5A	ENSG00000138735.16	transcript	ENST00000354960.8	protein_coding	20/21	2557/6959	2424/2628	808/875	chr4	119501236
chr4:119502607	T T	G G	1	a0001c0010 a0001c0010	2	HG01891.hp1 HG02818.hp1 HG01891.hp1 HG02818.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2380A>C c.2380A>C	p.Arg794Arg p.Arg794Arg	PDE5A	ENSG00000138735.16	transcript	ENST00000354960.8	protein_coding	19/21	2513/6959	2380/2628	794/875	chr4	119502607
chr4:119511122	T T	G G	1	a0002c0005 a0002c0005	6	HG02451.hp1 HG02615.hp2 HG03453.hp1 others(3): Show HG02451.hp1 HG02615.hp2 HG03453.hp1 NA18522.hp2 NA19030.hp2 NA19240.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2013A>C c.2013A>C	p.Pro671Pro p.Pro671Pro	PDE5A	ENSG00000138735.16	transcript	ENST00000354960.8	protein_coding	15/21	2146/6959	2013/2628	671/875	chr4	119511122
chr4:119553704	A A	G G	2	a0001c0002 a0001c0013 a0001c0002 a0001c0013	109	HG00140.hp2 HG00438.hp2 HG00597.hp2 others(106): Show HG00140.hp2 HG00438.hp2 HG00597.hp2 HG00673.hp2 HG00741.hp1 HG01069.hp1 HG01071.hp2 HG01074.hp2 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01168.hp2 HG01175.hp2 HG01192.hp1 HG01243.hp2 HG01256.hp1 HG01346.hp1 HG01358.hp1 HG01361.hp1 HG01433.hp2 HG01496.hp1 HG01884.hp1 HG01891.hp2 HG01952.hp1 HG01978.hp2 HG01981.hp2 HG01993.hp1 HG02004.hp1 HG02015.hp1 HG02027.hp1 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp2 HG02074.hp1 HG02129.hp1 HG02135.hp1 HG02148.hp1 HG02165.hp1 HG02258.hp1 HG02293.hp1 HG02300.hp1 HG02486.hp1 HG02523.hp2 HG02559.hp2 HG02622.hp2 HG02630.hp1 HG02717.hp1 HG02735.hp1 HG02809.hp1 HG02886.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp1 HG02897.hp2 HG02976.hp2 HG03017.hp2 HG03041.hp1 HG03130.hp2 HG03139.hp2 HG03486.hp2 HG03669.hp1 HG03688.hp1 HG03834.hp1 HG03942.hp2 NA18906.hp1 NA18941.hp1 NA18943.hp1 NA18944.hp1 NA18945.hp1 NA18946.hp1 NA18947.hp1 NA18948.hp1 NA18950.hp2 NA18954.hp1 NA18955.hp1 NA18956.hp2 NA18957.hp2 NA18959.hp2 NA18960.hp2 NA18966.hp1 NA18968.hp1 NA18970.hp2 NA18971.hp2 NA18972.hp2 NA18973.hp1 NA18974.hp2 NA18977.hp1 NA18980.hp2 NA18982.hp2 NA18985.hp1 NA18986.hp1 NA18990.hp1 NA18991.hp2 NA18992.hp2 NA18998.hp2 NA19000.hp1 NA19001.hp2 NA19011.hp2 NA19030.hp1 NA19055.hp2 NA19057.hp1 NA19060.hp1 NA19062.hp1 NA19066.hp2 NA19068.hp2 NA19074.hp1 NA19078.hp1 NA19081.hp1 NA19084.hp2 NA20300.hp2 NA20752.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1242T>C c.1242T>C	p.Tyr414Tyr p.Tyr414Tyr	PDE5A	ENSG00000138735.16	transcript	ENST00000354960.8	protein_coding	8/21	1375/6959	1242/2628	414/875	chr4	119553704

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chr4:119494410	T T	G G	1	a0001c0001t0027 a0001c0001t0027	1	NA18950.hp1 NA18950.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4191A>C c.4191A>C	PDE5A	ENSG00000138735.16	transcript	ENST00000354960.8	protein_coding	21/21	4191	chr4	119494410
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chr4:119494526	A A	G G	1	a0002c0006t0030 a0002c0006t0030	1	HG02280.hp1 HG02280.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.4075T>C c.4075T>C	PDE5A	ENSG00000138735.16	transcript	ENST00000354960.8	protein_coding	21/21	4075	chr4	119494526
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PDE5A_chr4_119489403_119633804 Genic Haplotype Structure on iGV

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