Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr2:172595608	A A	C C	10	a0001c0001t0008g0001 a0001c0001t0008g0297 a0001c0001t0008g0298 others(7): Show a0001c0001t0008g0001 a0001c0001t0008g0297 a0001c0001t0008g0298 a0001c0001t0008g0301 a0001c0001t0008g0303 a0001c0001t0044g0296 a0001c0001t0044g0302 a0001c0001t0106g0001 a0001c0001t0107g0294 a0003c0006t0008g0295	13	HG00642.hp2 HG02015.hp1 HG02148.hp1 others(10): Show HG00642.hp2 HG02015.hp1 HG02148.hp1 HG02165.hp2 HG02273.hp2 HG03831.hp2 NA18945.hp1 NA18946.hp1 NA18964.hp1 NA18994.hp2 NA18999.hp1 NA19057.hp2 NA19064.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1171-221A>C c.1171-221A>C	PDK1	ENSG00000152256.14	transcript	ENST00000282077.8	protein_coding	10/10		chr2	172595608
chr2:172595771	C C	G G	1	a0001c0001t0067g0212 a0001c0001t0067g0212	1	HG02698.hp1 HG02698.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.1171-58C>G c.1171-58C>G	PDK1	ENSG00000152256.14	transcript	ENST00000282077.8	protein_coding	10/10		chr2	172595771

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PDK1_chr2_172551090_172613669 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 4)

Coding Level Haplotype Info (Total: 8)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 113)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 319)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 342)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 3)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 154)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 472)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)