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chr1:167383862	C C	T T	1	a0001c0006 a0001c0006	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	synonymous_variant	LOW	c.724C>T c.724C>T	p.Leu242Leu p.Leu242Leu	POU2F1	ENSG00000143190.23	transcript	ENST00000367866.7	protein_coding	8/16	736/13843	724/2301	242/766	chr1	167383862
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🧬 JoGo Online Haplotype Explorer POU2F1_chr1_167215886_167432340

JoGo Local Haplotype Explorer (on iGV) POU2F1_chr1_167215886_167432340

Translation Multiple Alignment View

ACTG-Haplotype Mutation Positions 3D Viewer

🧬 Gene Summary

AAmino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

CCoding Level Haplotype Info (Total: 6)

TTranscript Level Haplotype Info (Total: 79)

GGenebody Level Haplotype Info (Total: 291)

A C AC Level (Amino Acid + Coding) Haplotype Info (Total: 6)

A C T ACT Level (Amino Acid + Coding + Transcript) Haplotype Info (Total: 81)

A C T G ACTG Level (Amino Acid + Coding + Transcript + Genebody) Haplotype Info (Total: 291)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 292)

AAmino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

CCoding Level Variants (Synonymous Mutations) (Total: 4)

TTranscript Level Haplotype Variants (5'UTR+3'UTR) (Total: 93)

GGenebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1832)

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Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)