Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr15:55641159	G G	A A	1	a0001c0020 a0001c0020	1	HG02145.hp2 HG02145.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2091C>T c.2091C>T	p.Asp697Asp p.Asp697Asp	PRTG	ENSG00000166450.13	transcript	ENST00000389286.9	protein_coding	12/20	2312/12142	2091/3453	697/1150	chr15	55641159
chr15:55673504	C C	T T	3	a0001c0008 a0001c0009 a0016c0014 a0001c0008 a0001c0009 a0016c0014	8	HG02615.hp1 HG02970.hp2 HG03453.hp1 others(5): Show HG02615.hp1 HG02970.hp2 HG03453.hp1 HG03486.hp2 NA18906.hp2 NA19030.hp1 NA20129.hp1 NA20129.hp2	synonymous_variant	LOW	c.1719G>A c.1719G>A	p.Thr573Thr p.Thr573Thr	PRTG	ENSG00000166450.13	transcript	ENST00000389286.9	protein_coding	10/20	1940/12142	1719/3453	573/1150	chr15	55673504
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chr15:55740674	G G	A A	1	a0003c0005 a0003c0005	6	HG00099.hp1 HG00741.hp1 HG01106.hp2 others(3): Show HG00099.hp1 HG00741.hp1 HG01106.hp2 HG01243.hp1 HG03490.hp2 NA20805.hp1	synonymous_variant	LOW	c.105C>T c.105C>T	p.Cys35Cys p.Cys35Cys	PRTG	ENSG00000166450.13	transcript	ENST00000389286.9	protein_coding	2/20	326/12142	105/3453	35/1150	chr15	55740674

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PRTG_chr15_55606544_55748152 Genic Haplotype Structure on iGV

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Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 284)

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Annotation (SNP Array)