Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr12:71785834	A A	T T	3	a0001c0001t0040 a0001c0001t0125 a0001c0001t0126 a0001c0001t0040 a0001c0001t0125 a0001c0001t0126	4	NA18965.hp1 NA18972.hp2 NA19055.hp2 others(1): Show NA18965.hp1 NA18972.hp2 NA19055.hp2 NA19084.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.161A>T c.161A>T	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	161		chr12	71785834
chr12:71785877	ATGTTTTT others(14): Show ATGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT	A A	4	a0001c0001t0016 a0001c0001t0044 a0001c0001t0045 others(1): Show a0001c0001t0016 a0001c0001t0044 a0001c0001t0045 a0001c0001t0046	7	HG02056.hp1 HG02080.hp1 HG02132.hp2 others(4): Show HG02056.hp1 HG02080.hp1 HG02132.hp2 NA18971.hp2 NA19064.hp2 NA19066.hp2 NA19079.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.226_246delTGTTTT others(15): Show c.226_246delTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	226	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr12	71785877
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chr12:71785879	GTTTTTTT others(4): Show GTTTTTTTTTGT	G G	1	a0001c0001t0004 a0001c0001t0004	1	NA19056.hp1 NA19056.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.226_236delTGTTTT others(5): Show c.226_236delTGTTTTTTTTT	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	226	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr12	71785879
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chr12:71785890	TTTTTTTT others(3): Show TTTTTTTTTTG	T T	1	a0001c0001t0002 a0001c0001t0002	1	HG03831.hp1 HG03831.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.238_247delTTTTTT others(4): Show c.238_247delTTTTTTTTTG	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	238	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr12	71785890
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chr12:71785911	T T	G G	13	a0001c0001t0004 a0001c0001t0011 a0001c0001t0026 others(10): Show a0001c0001t0004 a0001c0001t0011 a0001c0001t0026 a0001c0001t0047 a0001c0001t0048 a0001c0001t0049 a0001c0001t0050 a0001c0001t0052 a0001c0001t0053 a0001c0001t0055 a0002c0004t0004 a0002c0004t0054 a0005c0008t0051	32	HG00408.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 others(29): Show HG00408.hp1 HG00609.hp2 HG00639.hp2 HG00642.hp1 HG00741.hp2 HG01070.hp1 HG01071.hp2 HG01099.hp2 HG01123.hp1 HG01243.hp1 HG01256.hp1 HG01256.hp2 HG01257.hp1 HG01433.hp2 HG01934.hp2 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01975.hp2 HG01993.hp2 HG02004.hp1 HG02165.hp2 HG02258.hp2 HG02293.hp1 HG02300.hp2 HG03710.hp1 HG04199.hp2 NA18612.hp1 NA19056.hp1 NA19057.hp1 NA19059.hp1 NA19089.hp2 NA20752.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.238T>G c.238T>G	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	238		chr12	71785911
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chr12:71796753	C C	T T	1	a0001c0001t0081 a0001c0001t0081	1	HG01346.hp2 HG01346.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.11080C>T c.11080C>T	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	11080		chr12	71796753
chr12:71796759	G G	C C	1	a0001c0001t0081 a0001c0001t0081	1	HG01346.hp2 HG01346.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.11086G>C c.11086G>C	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	11086		chr12	71796759
chr12:71796761	A A	C C	1	a0001c0001t0081 a0001c0001t0081	1	HG01346.hp2 HG01346.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.11088A>C c.11088A>C	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	11088		chr12	71796761
chr12:71796763	A A	C C	1	a0001c0001t0081 a0001c0001t0081	1	HG01346.hp2 HG01346.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.11090A>C c.11090A>C	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	11090		chr12	71796763
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chr12:71796778	T T	A A	1	a0001c0001t0081 a0001c0001t0081	1	HG01346.hp2 HG01346.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.11105T>A c.11105T>A	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	11105		chr12	71796778
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chr12:71796788	G G	A A	1	a0001c0001t0081 a0001c0001t0081	1	HG01346.hp2 HG01346.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.11115G>A c.11115G>A	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	11115		chr12	71796788
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chr12:71796839	A A	T T	1	a0001c0001t0081 a0001c0001t0081	1	HG01346.hp2 HG01346.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.11166A>T c.11166A>T	RAB21	ENSG00000080371.6	transcript	ENST00000261263.5	protein_coding	7/7	11166		chr12	71796839
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RAB21_chr12_71749863_71805286 Genic Haplotype Structure on iGV

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Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 5)

Coding Level Haplotype Info (Total: 8)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 131)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 255)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 380)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 4)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 264)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 340)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)