Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr9:6013968	T T	C C	1	a0007 a0007	1	NA18993.hp1 NA18993.hp1	missense_variant	MODERATE	c.1640A>G c.1640A>G	p.Lys547Arg p.Lys547Arg	RANBP6	ENSG00000137040.10	transcript	ENST00000259569.6	protein_coding	1/1	1657/4600	1640/3318	547/1105	chr9	6013968
chr9:6014735	T T	C C	1	a0004 a0004	1	HG01884.hp1 HG01884.hp1	missense_variant	MODERATE	c.873A>G c.873A>G	p.Ile291Met p.Ile291Met	RANBP6	ENSG00000137040.10	transcript	ENST00000259569.6	protein_coding	1/1	890/4600	873/3318	291/1105	chr9	6014735
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chr9:6015307	G G	C C	1	a0005 a0005	1	HG04115.hp1 HG04115.hp1	missense_variant	MODERATE	c.301C>G c.301C>G	p.Leu101Val p.Leu101Val	RANBP6	ENSG00000137040.10	transcript	ENST00000259569.6	protein_coding	1/1	318/4600	301/3318	101/1105	chr9	6015307
chr9:6015478	T T	G G	1	a0002 a0002	2	HG02895.hp2 HG02896.hp2 HG02895.hp2 HG02896.hp2	missense_variant	MODERATE	c.130A>C c.130A>C	p.Ile44Leu p.Ile44Leu	RANBP6	ENSG00000137040.10	transcript	ENST00000259569.6	protein_coding	1/1	147/4600	130/3318	44/1105	chr9	6015478
chr9:6015512	C C	T T	1	a0008 a0008	1	NA19070.hp2 NA19070.hp2	missense_variant	MODERATE	c.96G>A c.96G>A	p.Met32Ile p.Met32Ile	RANBP6	ENSG00000137040.10	transcript	ENST00000259569.6	protein_coding	1/1	113/4600	96/3318	32/1105	chr9	6015512

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chr9:6012734	A A	C C	6	a0001c0002 a0001c0003 a0001c0004 others(3): Show a0001c0002 a0001c0003 a0001c0004 a0001c0006 a0005c0016 a0009c0012	198	HG00140.hp1 HG00408.hp2 HG00423.hp1 others(195): Show HG00140.hp1 HG00408.hp2 HG00423.hp1 HG00423.hp2 HG00597.hp1 HG00597.hp2 HG00609.hp2 HG00621.hp1 HG00621.hp2 HG00639.hp1 HG00642.hp1 HG00673.hp1 HG00733.hp1 HG00735.hp1 HG00738.hp1 HG00741.hp2 HG01069.hp1 HG01069.hp2 HG01071.hp2 HG01074.hp1 HG01081.hp2 HG01099.hp1 HG01106.hp1 HG01106.hp2 HG01109.hp2 HG01123.hp2 HG01167.hp1 HG01192.hp1 HG01256.hp2 HG01257.hp2 HG01346.hp1 HG01358.hp1 HG01496.hp2 HG01516.hp1 HG01517.hp1 HG01884.hp2 HG01891.hp2 HG01943.hp2 HG01952.hp1 HG01975.hp2 HG01993.hp1 HG02015.hp2 HG02027.hp1 HG02040.hp1 HG02040.hp2 HG02055.hp1 HG02055.hp2 HG02056.hp1 HG02071.hp1 HG02071.hp2 HG02080.hp1 HG02080.hp2 HG02109.hp1 HG02129.hp1 HG02132.hp1 HG02132.hp2 HG02135.hp1 HG02135.hp2 HG02145.hp1 HG02145.hp2 HG02148.hp2 HG02257.hp2 HG02258.hp1 HG02258.hp2 HG02280.hp1 HG02300.hp2 HG02451.hp1 HG02451.hp2 HG02559.hp1 HG02602.hp1 HG02602.hp2 HG02615.hp1 HG02615.hp2 HG02622.hp1 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02698.hp2 HG02717.hp1 HG02717.hp2 HG02723.hp1 HG02723.hp2 HG02738.hp2 HG02809.hp1 HG02809.hp2 HG02818.hp2 HG02886.hp1 HG02895.hp1 HG02896.hp1 HG02922.hp2 HG02965.hp1 HG02965.hp2 HG02970.hp2 HG02976.hp2 HG03130.hp2 HG03139.hp1 HG03139.hp2 HG03195.hp1 HG03209.hp1 HG03209.hp2 HG03225.hp1 HG03225.hp2 HG03239.hp2 HG03453.hp2 HG03471.hp1 HG03490.hp1 HG03491.hp1 HG03492.hp1 HG03516.hp1 HG03516.hp2 HG03540.hp1 HG03540.hp2 HG03654.hp1 HG03654.hp2 HG03669.hp1 HG03669.hp2 HG03704.hp1 HG03710.hp2 HG03834.hp2 HG03927.hp1 HG03942.hp1 HG04115.hp1 HG04184.hp1 HG04184.hp2 HG04228.hp2 HG06807.hp1 NA18522.hp1 NA18522.hp2 NA18612.hp2 NA18747.hp1 NA18747.hp2 NA18906.hp1 NA18906.hp2 NA18939.hp2 NA18940.hp1 NA18941.hp2 NA18945.hp2 NA18946.hp1 NA18946.hp2 NA18947.hp1 NA18947.hp2 NA18949.hp2 NA18953.hp1 NA18955.hp1 NA18956.hp1 NA18956.hp2 NA18960.hp2 NA18962.hp1 NA18962.hp2 NA18966.hp1 NA18966.hp2 NA18969.hp1 NA18971.hp2 NA18973.hp1 NA18974.hp1 NA18983.hp2 NA18985.hp1 NA18985.hp2 NA18987.hp2 NA18994.hp2 NA18995.hp2 NA18997.hp2 NA19001.hp1 NA19004.hp1 NA19006.hp2 NA19009.hp1 NA19010.hp1 NA19011.hp1 NA19012.hp2 NA19030.hp1 NA19054.hp1 NA19054.hp2 NA19056.hp1 NA19057.hp2 NA19058.hp1 NA19060.hp1 NA19064.hp1 NA19065.hp1 NA19066.hp1 NA19066.hp2 NA19068.hp2 NA19072.hp1 NA19074.hp1 NA19077.hp2 NA19080.hp1 NA19081.hp1 NA19081.hp2 NA19082.hp1 NA19084.hp1 NA19084.hp2 NA19085.hp1 NA19087.hp2 NA19089.hp1 NA19240.hp2 NA20129.hp1 NA20300.hp1 NA20905.hp2 NA21309.hp1 NA21309.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2874T>G c.2874T>G	p.Leu958Leu p.Leu958Leu	RANBP6	ENSG00000137040.10	transcript	ENST00000259569.6	protein_coding	1/1	2891/4600	2874/3318	958/1105	chr9	6012734
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chr9:6012968	A A	G G	6	a0001c0004 a0001c0005 a0001c0006 others(3): Show a0001c0004 a0001c0005 a0001c0006 a0002c0008 a0004c0015 a0005c0016	58	HG00423.hp2 HG00597.hp1 HG00738.hp1 others(55): Show HG00423.hp2 HG00597.hp1 HG00738.hp1 HG00741.hp2 HG01099.hp1 HG01109.hp1 HG01192.hp2 HG01884.hp1 HG01891.hp2 HG02040.hp2 HG02129.hp1 HG02132.hp1 HG02145.hp2 HG02257.hp1 HG02280.hp2 HG02559.hp2 HG02622.hp1 HG02622.hp2 HG02647.hp1 HG02647.hp2 HG02723.hp1 HG02886.hp1 HG02895.hp2 HG02896.hp1 HG02896.hp2 HG02965.hp1 HG03041.hp1 HG03041.hp2 HG03195.hp2 HG03209.hp2 HG03225.hp1 HG03239.hp2 HG03486.hp1 HG03491.hp1 HG03516.hp2 HG03540.hp2 HG03579.hp1 HG03579.hp2 HG03669.hp1 HG03834.hp2 HG04115.hp1 HG04184.hp1 HG04184.hp2 NA18747.hp1 NA18947.hp2 NA18954.hp2 NA18962.hp2 NA18983.hp2 NA18985.hp1 NA19009.hp2 NA19012.hp2 NA19030.hp2 NA19054.hp2 NA19056.hp1 NA19240.hp2 NA20300.hp2 NA21309.hp1 NA21309.hp2	synonymous_variant	LOW	c.2640T>C c.2640T>C	p.Ile880Ile p.Ile880Ile	RANBP6	ENSG00000137040.10	transcript	ENST00000259569.6	protein_coding	1/1	2657/4600	2640/3318	880/1105	chr9	6012968
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RANBP6_chr9_6006025_6020624 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 9)

Coding Level Haplotype Info (Total: 16)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 26)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 26)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 414)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 8)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 4)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 9)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 0)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)