Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr1:211278125	T T	C C	2	a0001c0002 a0001c0003 a0001c0002 a0001c0003	53	HG00733.hp1 HG00738.hp2 HG01070.hp1 others(50): Show HG00733.hp1 HG00738.hp2 HG01070.hp1 HG01071.hp1 HG01099.hp1 HG01167.hp2 HG01256.hp2 HG01257.hp2 HG01884.hp1 HG01928.hp2 HG01975.hp2 HG02055.hp1 HG02109.hp1 HG02145.hp2 HG02273.hp1 HG02293.hp2 HG02559.hp2 HG02630.hp1 HG02698.hp1 HG02717.hp2 HG02723.hp1 HG02738.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG03017.hp1 HG03041.hp1 HG03098.hp2 HG03130.hp2 HG03225.hp2 HG03239.hp2 HG03669.hp1 HG06807.hp2 NA18612.hp1 NA18906.hp2 NA18939.hp2 NA18954.hp2 NA18970.hp2 NA18973.hp2 NA18979.hp1 NA18986.hp1 NA18999.hp1 NA19004.hp1 NA19007.hp2 NA19030.hp1 NA19060.hp2 NA19065.hp2 NA19070.hp2 NA19081.hp2 NA19082.hp1 NA19083.hp1 NA19086.hp1 NA19088.hp2 NA20805.hp2	synonymous_variant	LOW	c.525T>C c.525T>C	p.Asp175Asp p.Asp175Asp	RCOR3	ENSG00000117625.14	transcript	ENST00000419091.7	protein_coding	6/12	720/4474	525/1662	175/553	chr1	211278125
chr1:211289306	G G	A A	1	a0001c0004 a0001c0004	2	HG03130.hp1 HG03209.hp2 HG03130.hp1 HG03209.hp2	synonymous_variant	LOW	c.849G>A c.849G>A	p.Gln283Gln p.Gln283Gln	RCOR3	ENSG00000117625.14	transcript	ENST00000419091.7	protein_coding	8/12	1044/4474	849/1662	283/553	chr1	211289306
chr1:211313702	G G	A A	1	a0001c0005 a0001c0005	1	HG00673.hp1 HG00673.hp1	synonymous_variant	LOW	c.1596G>A c.1596G>A	p.Thr532Thr p.Thr532Thr	RCOR3	ENSG00000117625.14	transcript	ENST00000419091.7	protein_coding	12/12	1791/4474	1596/1662	532/553	chr1	211313702

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chr1:211259456	T T	TCTC TCTC	1	a0001c0002t0006 a0001c0002t0006	6	HG00738.hp2 HG01099.hp1 HG01167.hp2 others(3): Show HG00738.hp2 HG01099.hp1 HG01167.hp2 HG02293.hp2 HG02698.hp1 NA20805.hp2	5_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.-90_-88dupCCT c.-90_-88dupCCT	RCOR3	ENSG00000117625.14	transcript	ENST00000419091.7	protein_coding	1/12	87	INFO_REALIGN_3_PRIME	chr1	211259456
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chr1:211314087	T T	C C	1	a0001c0001t0004 a0001c0001t0004	13	HG01109.hp2 HG01884.hp2 HG02257.hp2 others(10): Show HG01109.hp2 HG01884.hp2 HG02257.hp2 HG02451.hp2 HG02615.hp1 HG02818.hp2 HG02897.hp1 HG02922.hp1 HG02965.hp1 HG03139.hp2 HG03471.hp2 HG03486.hp1 NA18906.hp1	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.319T>C c.319T>C	RCOR3	ENSG00000117625.14	transcript	ENST00000419091.7	protein_coding	12/12	319		chr1	211314087
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chr1:211314212	T T	G G	1	a0001c0001t0011 a0001c0001t0011	2	HG02970.hp2 NA19043.hp2 HG02970.hp2 NA19043.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.444T>G c.444T>G	RCOR3	ENSG00000117625.14	transcript	ENST00000419091.7	protein_coding	12/12	444		chr1	211314212
chr1:211314259	C C	T T	1	a0001c0001t0019 a0001c0001t0019	1	NA19091.hp2 NA19091.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.491C>T c.491C>T	RCOR3	ENSG00000117625.14	transcript	ENST00000419091.7	protein_coding	12/12	491		chr1	211314259
chr1:211314261	G G	A A	1	a0001c0001t0016 a0001c0001t0016	1	NA18986.hp2 NA18986.hp2	3_prime_UTR_variant	MODIFIER	c.493G>A c.493G>A	RCOR3	ENSG00000117625.14	transcript	ENST00000419091.7	protein_coding	12/12	493		chr1	211314261
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RCOR3_chr1_211254366_211321385 Genic Haplotype Structure on iGV

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