Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr11:77701411	T T	C C	1	a0006 a0006	1	HG00280.hp1 HG00280.hp1	missense_variant	MODERATE	c.1818A>G c.1818A>G	p.Ile606Met p.Ile606Met	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	6/16	1826/11242	1818/4326	606/1441	chr11	77701411
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chr11:77701806	A A	G G	1	a0002 a0002	40	HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00558.hp2 others(37): Show HG00099.hp2 HG00140.hp1 HG00558.hp2 HG00639.hp1 HG00733.hp1 HG01070.hp2 HG01109.hp1 HG01123.hp1 HG01167.hp2 HG01168.hp2 HG01255.hp2 HG01358.hp2 HG01361.hp2 HG01515.hp1 HG01516.hp1 HG01891.hp1 HG01928.hp2 HG02027.hp1 HG02273.hp2 HG02293.hp2 HG02486.hp1 HG03017.hp1 HG03490.hp2 HG03491.hp2 HG03492.hp2 HG03654.hp1 HG03669.hp2 HG03688.hp2 HG03704.hp1 HG03710.hp2 HG03927.hp1 HG03942.hp1 HG04228.hp1 NA18955.hp1 NA18964.hp2 NA18971.hp1 NA18990.hp1 NA18994.hp2 NA19088.hp2 NA20129.hp2	missense_variant	MODERATE	c.1423T>C c.1423T>C	p.Ser475Pro p.Ser475Pro	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	6/16	1431/11242	1423/4326	475/1441	chr11	77701806
chr11:77702178	T T	C C	1	a0003 a0003	4	HG02451.hp2 HG02818.hp2 HG03041.hp1 others(1): Show HG02451.hp2 HG02818.hp2 HG03041.hp1 HG03195.hp2	missense_variant	MODERATE	c.1051A>G c.1051A>G	p.Ile351Val p.Ile351Val	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	6/16	1059/11242	1051/4326	351/1441	chr11	77702178
chr11:77702317	T T	G G	1	a0011 a0011	1	NA19240.hp2 NA19240.hp2	missense_variant	MODERATE	c.912A>C c.912A>C	p.Glu304Asp p.Glu304Asp	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	6/16	920/11242	912/4326	304/1441	chr11	77702317
chr11:77820687	C C	G G	1	a0004 a0004	2	HG02818.hp1 HG06807.hp1 HG02818.hp1 HG06807.hp1	missense_variant	MODERATE	c.28G>C c.28G>C	p.Val10Leu p.Val10Leu	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	1/16	36/11242	28/4326	10/1441	chr11	77820687

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chr11:77667343	T T	C C	4	a0001c0002 a0001c0009 a0011c0018 others(1): Show a0001c0002 a0001c0009 a0011c0018 a0012c0008	81	HG00280.hp2 HG00408.hp2 HG00423.hp2 others(78): Show HG00280.hp2 HG00408.hp2 HG00423.hp2 HG00597.hp1 HG00673.hp1 HG00733.hp2 HG01069.hp2 HG01071.hp2 HG01074.hp1 HG01081.hp1 HG01192.hp2 HG01243.hp2 HG01256.hp2 HG01361.hp1 HG01433.hp2 HG01884.hp1 HG01993.hp2 HG02055.hp2 HG02071.hp1 HG02080.hp1 HG02083.hp1 HG02132.hp1 HG02145.hp1 HG02257.hp1 HG02273.hp1 HG02280.hp1 HG02523.hp1 HG02559.hp2 HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02630.hp2 HG02717.hp1 HG02809.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG03041.hp2 HG03130.hp1 HG03139.hp1 HG03209.hp2 HG03453.hp1 HG03471.hp1 HG03486.hp2 HG03516.hp2 HG03540.hp1 HG03579.hp1 HG06807.hp2 NA18612.hp1 NA18747.hp2 NA18939.hp1 NA18941.hp1 NA18942.hp2 NA18946.hp1 NA18950.hp1 NA18951.hp2 NA18954.hp1 NA18957.hp2 NA18964.hp1 NA18965.hp1 NA18967.hp2 NA18969.hp1 NA18972.hp2 NA18980.hp1 NA18981.hp2 NA18986.hp2 NA18989.hp2 NA18991.hp1 NA19005.hp2 NA19011.hp1 NA19056.hp1 NA19057.hp1 NA19062.hp2 NA19068.hp2 NA19078.hp2 NA19081.hp2 NA19083.hp2 NA19084.hp2 NA19086.hp2 NA19087.hp2 NA19240.hp1 NA19240.hp2 NA20129.hp1	synonymous_variant	LOW	c.3900A>G c.3900A>G	p.Leu1300Leu p.Leu1300Leu	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	16/16	3908/11242	3900/4326	1300/1441	chr11	77667343
chr11:77667460	A A	G G	4	a0001c0002 a0001c0009 a0011c0018 others(1): Show a0001c0002 a0001c0009 a0011c0018 a0012c0008	81	HG00280.hp2 HG00408.hp2 HG00423.hp2 others(78): Show HG00280.hp2 HG00408.hp2 HG00423.hp2 HG00597.hp1 HG00673.hp1 HG00733.hp2 HG01069.hp2 HG01071.hp2 HG01074.hp1 HG01081.hp1 HG01192.hp2 HG01243.hp2 HG01256.hp2 HG01361.hp1 HG01433.hp2 HG01884.hp1 HG01993.hp2 HG02055.hp2 HG02071.hp1 HG02080.hp1 HG02083.hp1 HG02132.hp1 HG02145.hp1 HG02257.hp1 HG02273.hp1 HG02280.hp1 HG02523.hp1 HG02559.hp2 HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02630.hp2 HG02717.hp1 HG02809.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG03041.hp2 HG03130.hp1 HG03139.hp1 HG03209.hp2 HG03453.hp1 HG03471.hp1 HG03486.hp2 HG03516.hp2 HG03540.hp1 HG03579.hp1 HG06807.hp2 NA18612.hp1 NA18747.hp2 NA18939.hp1 NA18941.hp1 NA18942.hp2 NA18946.hp1 NA18950.hp1 NA18951.hp2 NA18954.hp1 NA18957.hp2 NA18964.hp1 NA18965.hp1 NA18967.hp2 NA18969.hp1 NA18972.hp2 NA18980.hp1 NA18981.hp2 NA18986.hp2 NA18989.hp2 NA18991.hp1 NA19005.hp2 NA19011.hp1 NA19056.hp1 NA19057.hp1 NA19062.hp2 NA19068.hp2 NA19078.hp2 NA19081.hp2 NA19083.hp2 NA19084.hp2 NA19086.hp2 NA19087.hp2 NA19240.hp1 NA19240.hp2 NA20129.hp1	synonymous_variant	LOW	c.3783T>C c.3783T>C	p.Asp1261Asp p.Asp1261Asp	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	16/16	3791/11242	3783/4326	1261/1441	chr11	77667460
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chr11:77698523	T T	C C	4	a0001c0002 a0001c0009 a0011c0018 others(1): Show a0001c0002 a0001c0009 a0011c0018 a0012c0008	81	HG00280.hp2 HG00408.hp2 HG00423.hp2 others(78): Show HG00280.hp2 HG00408.hp2 HG00423.hp2 HG00597.hp1 HG00673.hp1 HG00733.hp2 HG01069.hp2 HG01071.hp2 HG01074.hp1 HG01081.hp1 HG01192.hp2 HG01243.hp2 HG01256.hp2 HG01361.hp1 HG01433.hp2 HG01884.hp1 HG01993.hp2 HG02055.hp2 HG02071.hp1 HG02080.hp1 HG02083.hp1 HG02132.hp1 HG02145.hp1 HG02257.hp1 HG02273.hp1 HG02280.hp1 HG02523.hp1 HG02559.hp2 HG02572.hp2 HG02615.hp2 HG02630.hp2 HG02717.hp1 HG02809.hp1 HG02886.hp2 HG02895.hp1 HG03041.hp2 HG03130.hp1 HG03139.hp1 HG03209.hp2 HG03453.hp1 HG03471.hp1 HG03486.hp2 HG03516.hp2 HG03540.hp1 HG03579.hp1 HG06807.hp2 NA18612.hp1 NA18747.hp2 NA18939.hp1 NA18941.hp1 NA18942.hp2 NA18946.hp1 NA18950.hp1 NA18951.hp2 NA18954.hp1 NA18957.hp2 NA18964.hp1 NA18965.hp1 NA18967.hp2 NA18969.hp1 NA18972.hp2 NA18980.hp1 NA18981.hp2 NA18986.hp2 NA18989.hp2 NA18991.hp1 NA19005.hp2 NA19011.hp1 NA19056.hp1 NA19057.hp1 NA19062.hp2 NA19068.hp2 NA19078.hp2 NA19081.hp2 NA19083.hp2 NA19084.hp2 NA19086.hp2 NA19087.hp2 NA19240.hp1 NA19240.hp2 NA20129.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2679A>G c.2679A>G	p.Pro893Pro p.Pro893Pro	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	7/16	2687/11242	2679/4326	893/1441	chr11	77698523
chr11:77698622	A A	G G	1	a0001c0010 a0001c0010	1	NA19062.hp1 NA19062.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2580T>C c.2580T>C	p.Asp860Asp p.Asp860Asp	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	7/16	2588/11242	2580/4326	860/1441	chr11	77698622
chr11:77700931	C C	T T	1	a0001c0009 a0001c0009	1	HG03453.hp1 HG03453.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2298G>A c.2298G>A	p.Glu766Glu p.Glu766Glu	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	6/16	2306/11242	2298/4326	766/1441	chr11	77700931
chr11:77702266	G G	C C	1	a0001c0017 a0001c0017	1	HG01175.hp2 HG01175.hp2	synonymous_variant	LOW	c.963C>G c.963C>G	p.Pro321Pro p.Pro321Pro	RSF1	ENSG00000048649.14	transcript	ENST00000308488.11	protein_coding	6/16	971/11242	963/4326	321/1441	chr11	77702266

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RSF1_chr11_77655009_77825722 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 12)

Coding Level Haplotype Info (Total: 18)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 81)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 352)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 352)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 13)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 7)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 72)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1734)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)