Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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	chr9:113256221	C C	G G	1	a0002 a0002	7	HG02145.hp2 HG02486.hp2 HG02572.hp1 others(4): Show HG02145.hp2 HG02486.hp2 HG02572.hp1 HG02970.hp1 HG03195.hp2 NA19240.hp1 NA20129.hp1	missense_variant	MODERATE	c.73C>G c.73C>G	p.Pro25Ala p.Pro25Ala	SLC31A1	ENSG00000136868.11	transcript	ENST00000374212.5	protein_coding	2/5	243/4762	73/573	25/190			chr9	113256221

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chr9:113260122	T T	C C	1	a0001c0001t0042g0197 a0001c0001t0042g0197	1	HG02970.hp2 HG02970.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.372-150T>C c.372-150T>C	SLC31A1	ENSG00000136868.11	transcript	ENST00000374212.5	protein_coding	4/4		chr9	113260122
chr9:113260149	C C	G G	5	a0001c0001t0002g0089 a0001c0001t0002g0103 a0001c0001t0002g0144 others(2): Show a0001c0001t0002g0089 a0001c0001t0002g0103 a0001c0001t0002g0144 a0001c0001t0002g0145 a0001c0001t0002g0146	5	HG02148.hp1 NA18951.hp2 NA18952.hp2 others(2): Show HG02148.hp1 NA18951.hp2 NA18952.hp2 NA19000.hp1 NA19088.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.372-123C>G c.372-123C>G	SLC31A1	ENSG00000136868.11	transcript	ENST00000374212.5	protein_coding	4/4		chr9	113260149
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chr9:113260182	C C	G G	1	a0001c0001t0001g0024 a0001c0001t0001g0024	2	HG02647.hp1 HG02717.hp2 HG02647.hp1 HG02717.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.372-90C>G c.372-90C>G	SLC31A1	ENSG00000136868.11	transcript	ENST00000374212.5	protein_coding	4/4		chr9	113260182

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SLC31A1_chr9_113216544_113269492 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

Coding Level Haplotype Info (Total: 7)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 84)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 355)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 418)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 5)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 42)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 436)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)