Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr2:173964692	G G	A A	1	a0001c0001t0001g0326 a0001c0001t0001g0326	1	NA19087.hp1 NA19087.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.8-139C>T c.8-139C>T	SP3	ENSG00000172845.18	transcript	ENST00000310015.12	protein_coding	1/6	chr2	173964692
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chr2:173965100	T T	G G	1	a0002c0002t0041g0336 a0002c0002t0041g0336	1	NA18995.hp2 NA18995.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.7+65A>C c.7+65A>C	SP3	ENSG00000172845.18	transcript	ENST00000310015.12	protein_coding	1/6	chr2	173965100
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SP3_chr2_173895775_173970373 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

Coding Level Haplotype Info (Total: 9)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 104)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 341)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 356)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 7)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 85)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 724)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)