Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr10:47761586	C C	T T	1	a0012 a0012	1	HG04204.hp2 HG04204.hp2	missense_variant	MODERATE	c.67G>A c.67G>A	p.Gly23Arg p.Gly23Arg	SYT15B	ENSG00000277758.6	transcript	ENST00000615923.4	protein_coding	2/8	1019/11673	67/1266	23/421	chr10	47761586

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chr10:47762498	C C	T T	1	a0002c0002t0002g0153 a0002c0002t0002g0153	1	NA18939.hp2 NA18939.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.7+136G>A c.7+136G>A	SYT15B	ENSG00000277758.6	transcript	ENST00000615923.4	protein_coding	1/7	chr10	47762498
chr10:47762548	C C	T T	1	a0001c0001t0022g0135 a0001c0001t0022g0135	1	HG01516.hp1 HG01516.hp1	intron_variant	MODIFIER	c.7+86G>A c.7+86G>A	SYT15B	ENSG00000277758.6	transcript	ENST00000615923.4	protein_coding	1/7	chr10	47762548

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SYT15B_chr10_47739717_47768592 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 13)

Coding Level Haplotype Info (Total: 20)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 118)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 197)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 340)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 13)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 6)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 116)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 87)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)