Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr1:61724873	C C	A A	1	a0001c0001t0001g0364 a0001c0001t0001g0364	1	NA18974.hp2 NA18974.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.164+84G>T c.164+84G>T	TM2D1	ENSG00000162604.13	transcript	ENST00000606498.5	protein_coding	1/6	chr1	61724873

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TM2D1_chr1_61676046_61730141 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 2)

Coding Level Haplotype Info (Total: 2)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 7)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 364)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 388)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 1)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 0)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 4)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 735)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)