Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr18:5891374	GGCGGCGG others(5): Show GGCGGCGGCGGCC	G G	1	a0001 a0001	3	HG03130.hp2 HG03834.hp2 HG04228.hp1 HG03130.hp2 HG03834.hp2 HG04228.hp1	disruptive_inframe_deletion	MODERATE	c.678_689delGGCCGCCG others(4): Show c.678_689delGGCCGCCGCCGC	p.Ala227_Ala230del p.Ala227_Ala230del	TMEM200C	ENSG00000206432.4	transcript	ENST00000383490.3	protein_coding	2/2	1276/10579	678/1866	226/621	chr18	5891374
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TMEM200C_chr18_5877072_5900522 Genic Haplotype Structure on iGV

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Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 16)

Coding Level Haplotype Info (Total: 19)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 162)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 214)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 438)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 21)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 3)

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Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 27)

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Annotation (SNP Array)