Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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a0001c0001t0011	0/0	13003	6	6	0	0	0	0	TRIM44_chr11_35657775_35823007	TRIM44	GGCGG others(12998): Show GGCGGCTGCCGCGATCTCTCCCTGGTAGCGGGAGGCTGAGCGGGCGGCGC GACGCGGGGGCCGACGGGGGCGCCGGGTGGCCGCGCCGGAAGTGCCTTGC GCGGCAGAGGAAGCGCAGGGACAGAGCGGAGCAGGCCGAGCCGGCGGAAA GGGTCTTTGCTGCTGCGCCCGGGCAGGGGCTGCCGCGGCCCCAGGTCCCG CTTCGAGACGCGGCGCGGTCCAGGCGGGAGGCGACTCCCTAGGAAGGGAC CCGGGGCGGGAGGAGGAAGTGAGGCCGCGCGGAAGGAAGGCGGCGAGCCC CGGGGCCCCGAGGCCTTGGCCGCGTCACAGCACCCACATGGCCTCTGGAG TGGGCGCGGCCTTCGAGGAACTGCCTCACGACGGCACGTGTGACGAGTGC GAGCCCGACGAGGCTCCGGGGGCCGAGGAAGTGTGCCGAGAATGCGGCTT CTGCTACTGCCGCCGCCATGCCGAGGCGCACAGGCAGAAGTTCCTCAGTC ACCATCTGGCCGAATACGTCCACGGCTCCCAGGCCTGGACCCCGCCAGCT GACGGAGAGGGGGCGGGGAAGGAAGAAGCGGAGGTCAAGGTGGAGCAGGA GAGGGAGATAGAAAGCGAGGCAGGGGAAGAGAGTGAGTCGGAGGAAGAGA GCGAGTCAGAGGAAGAGAGCGAGACAGAGGAAGAGAGTGAGGATGAGAGC GATGAGGAGAGTGAAGAAGACAGCGAGGAAGAAATGGAGGATGAGCAAGA AAGCGAGGCCGAAGAAGACAACCAAGAAGAAGGGGAATCCGAGGCGGAGG GAGAAACTGAGGCAGAAAGTGAATTTGACCCAGAAATAGAAATGGAAGCA 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a0001c0001t0016	0/0	12996	5	1	2	2	0	0	TRIM44_chr11_35657775_35823007	TRIM44	GGCGG others(12991): Show GGCGGCTGCCGCGATCTCTCCCTGGTAGCGGGAGGCTGAGCGGGCGGCGC GACGCGGGGGCCGACGGGGGCGCCGGGTGGCCGCGCCGGAAGTGCCTTGC GCGGCAGAGGAAGCGCAGGGACAGAGCGGAGCAGGCCGAGCCGGCGGAAA GGGTCTTTGCTGCTGCGCCCGGGCAGGGGCTGCCGCGGCCCCAGGTCCCG CTTCGAGACGCGGCGCGGTCCAGGCGGGAGGCGACTCCCTAGGAAGGGAC CCGGGGCGGGAGGAGGAAGTGAGGCCGCGCGGAAGGAAGGCGGCGAGCCC CGGGGCCCCGAGGCCTTGGCCGCGTCACAGCACCCACATGGCCTCTGGAG TGGGCGCGGCCTTCGAGGAACTGCCTCACGACGGCACGTGTGACGAGTGC GAGCCCGACGAGGCTCCGGGGGCCGAGGAAGTGTGCCGAGAATGCGGCTT CTGCTACTGCCGCCGCCATGCCGAGGCGCACAGGCAGAAGTTCCTCAGTC ACCATCTGGCCGAATACGTCCACGGCTCCCAGGCCTGGACCCCGCCAGCT GACGGAGAGGGGGCGGGGAAGGAAGAAGCGGAGGTCAAGGTGGAGCAGGA GAGGGAGATAGAAAGCGAGGCAGGGGAAGAGAGTGAGTCGGAGGAAGAGA GCGAGTCAGAGGAAGAGAGCGAGACAGAGGAAGAGAGTGAGGATGAGAGC GATGAGGAGAGTGAAGAAGACAGCGAGGAAGAAATGGAGGATGAGCAAGA AAGCGAGGCCGAAGAAGACAACCAAGAAGAAGGGGAATCCGAGGCGGAGG GAGAAACTGAGGCAGAAAGTGAATTTGACCCAGAAATAGAAATGGAAGCA 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chr11:35806260	G G	T T	1	a0001c0001t0013g0031 a0001c0001t0013g0031	1	HG02129.hp2 HG02129.hp2	intron_variant	MODIFIER	c.1008-98G>T c.1008-98G>T	TRIM44	ENSG00000166326.7	transcript	ENST00000299413.7	protein_coding	4/4		chr11	35806260

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TRIM44_chr11_35657775_35823007 Genic Haplotype Structure on iGV

Translation Multiple Alignment View

Gene Summary (with MANE)

Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 3)

Coding Level Haplotype Info (Total: 3)

Transcript Level Haplotype Info (Total: 113)

Genebody Level Haplotype Info (Total: 384)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 392)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 2)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 0)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 105)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1483)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)