Joint Open Genome and Omics Platform (JoGo)

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chr2:165949457	G G	T T	1	a0015 a0015	1	HG02970.hp1 HG02970.hp1	missense_variant	MODERATE	c.199C>A c.199C>A	p.Gln67Lys p.Gln67Lys	TTC21B	ENSG00000123607.16	transcript	ENST00000243344.8	protein_coding	3/29	270/5415	199/3951	67/1316	chr2	165949457

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chr2:165883959	A A	G G	1	a0001c0006 a0001c0006	5	HG00323.hp1 HG01069.hp1 HG01070.hp2 others(2): Show HG00323.hp1 HG01069.hp1 HG01070.hp2 HG01071.hp1 HG02293.hp2	synonymous_variant	LOW	c.3519T>C c.3519T>C	p.Thr1173Thr p.Thr1173Thr	TTC21B	ENSG00000123607.16	transcript	ENST00000243344.8	protein_coding	26/29	3590/5415	3519/3951	1173/1316	chr2	165883959
chr2:165898699	T T	C C	1	a0002c0014 a0002c0014	2	HG02895.hp1 HG02897.hp1 HG02895.hp1 HG02897.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2937A>G c.2937A>G	p.Leu979Leu p.Leu979Leu	TTC21B	ENSG00000123607.16	transcript	ENST00000243344.8	protein_coding	22/29	3008/5415	2937/3951	979/1316	chr2	165898699
chr2:165901737	G G	A A	1	a0001c0009 a0001c0009	3	HG01891.hp2 HG03130.hp1 NA19240.hp1 HG01891.hp2 HG03130.hp1 NA19240.hp1	synonymous_variant	LOW	c.2742C>T c.2742C>T	p.Cys914Cys p.Cys914Cys	TTC21B	ENSG00000123607.16	transcript	ENST00000243344.8	protein_coding	20/29	2813/5415	2742/3951	914/1316	chr2	165901737
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TTC21B_chr2_165868362_165958776 Genic Haplotype Structure on iGV

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Amino acid(protein) Level Haplotype Info (Total: 21)

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Genebody Level Haplotype Info (Total: 396)

Haplotype Details by Sample (Haploid Level) (Total: 408)

Amino acid(protein) Level Haplotype Related Variants (Effect to Protein Coding Variants) (Total: 20)

Coding Level Variants (On coding region but no effect to protein coding variants: Synonymous Mutations) (Total: 10)

Transcript Level Haplotype Variants (Exon) (Total: 19)

Genebody Level Haplotype Variants (Intron) (Total: 1147)

Annotation (Repeats)

Annotation (SNP Array)